Colorado RockiesRediger
Fowler blev hentet af Colorado Rockies i 14. runde af 2004-draften i Major League Baseball. I 2008 blev han udvalgt af Major League Baseball til at spille i All-Star Futures Game på Yankee Stadium.
Fowler med Colorado Rockies
Fowler var slagmand .337 med ni homeruns, 61 runs batted in (RBIs) og 20 stjålne baser for Rockies’ Double-A Texas League-affiliate, Tulsa Drillers, inden han spillede for Team USA ved OL i 2008.
Fowler blev kaldt op til Major Leagues for første gang den 2. september 2008. Han fik sin debut samme dag i en hjemmesejr på 6-5 i en ekstra inning over San Francisco Giants, idet han kom ind som pinch runner i bunden af 10. inning; han blev efterfølgende udtaget på første base. I Fowlers første slag i bunden af tredje inning i et 9-2-hjemmetab mod Giants den følgende dag i et 9-2-hjemmetab mod Giants, slog han en flied out til højre felt.
Den 10. september 2008 fik Fowler sit første hit, en infield single, mod Will Ohman i starten af den syvende inning i et 9-5-tab på udebane mod Atlanta Braves.
Den 8. april 2009 slog Fowler sit første home run i karrieren mod Doug Davis fra Arizona Diamondbacks, som en del af en 9-2-sejr på udebane. Han slog home run på kampens første kast og blev dermed den første spiller i Rockies’ historie til at gøre det.
Den 27. april 2009 tangerede Fowler en moderne rookierekord, da han stjal fem baser mod San Diego Padres i en sejr på 12-7.
I 2010 førte Fowler Majors i trippler med 14 på sæsonen. I 439 at-bats på året havde han seks homeruns, 36 RBIs, 73 scorede runs og 114 samlede base hits.
I 2011 var Fowler nummer tre i National League i triples, idet han slog 15 i den sæson. I 481 at-bats på året slog han fem home runs, 45 RBIs, 84 scorede runs og 128 samlede base hits.
I 2012-sæsonen steg Fowlers batting-statistik til karrierens højeste. Han slog 13 home runs, 53 RBIs og et slaggennemsnit på 0,300 i 454 at-bats.
Meget af hans succes kom dog, mens han slog på hjemmebane, Coors Field. Hans hjemme-OPS var 0,880, men kun 0,694 på landevejen.
Houston AstrosRediger
Fowler hos Houston Astros
Den 3. december 2013 blev Fowler sammen med en spiller, der skal navngives senere, handlet til Houston Astros for outfielder Brandon Barnes og pitcher Jordan Lyles. Rockies sendte i sidste ende kontanter til Astros for at fuldføre handlen i stedet for spilleren, der skal nævnes senere. Han slog .276 i 116 kampe for Astros i 2014-sæsonen.
Chicago CubsRediger
Fowler i 2016
Den 19. januar 2015 blev Fowler handlet til Chicago Cubs for Luis Valbuena og Dan Straily. Han sluttede 2015-sæsonen med et gennemsnit på .250 og 102 scorede runs, 46 RBI’er, 17 HR’er og 20 stjålne baser. I 2015 National League wild card-kampen i National League hjalp Fowler Cubs til en 4-0-sejr over Pittsburgh Pirates med tre hits, tre scorede runs, en RBI, en homerun og en stjålet base.
Med Cubs sluttede 2015-sæsonen med en 97-65-rekord, og holdet kom med i eftersæsonen for første gang i syv år. I ni kampe i eftersæsonen slog Fowler 0,396 med to homeruns og tre RBIs. I kamp 4 i NLCS 2015 mod New York Mets var han den sidste slagmand, der slog ud, da Cubs blev slået ud af eftersæsonen.
Fowler ved Home Run Derby 2016
Fowler underskrev en etårig kontrakt med Cubs, der omfattede en gensidig option for 2017-sæsonen den 25. februar 2016, til trods for at han tidligere samme uge angiveligt var blevet enig om en treårig kontrakt med Baltimore Orioles. Orioles hævdede, at Fowlers insisteren på en opt-out-klausul efter et år var det, der var hæmsko på aftalen, og at de blev overrumplet, da han underskrev med Cubs. Fowler insisterede på den anden side på, at han aldrig var blevet enig med Orioles om en aftale, og han og hans agent gav holdet og medierne skylden for at lække ukorrekte oplysninger.
Fowler fik sin første udvisning i MLB-karrieren for at argumentere for en strike three call af dommer Vic Carapazza den 5. maj 2016. Fowler blev udvalgt til sin første All-Star Game i 2016 som repræsentant for Cubs sammen med seks andre holdkammerater.
Fowler sluttede året med at slå med et gennemsnit på ,276 med 13 homeruns og 48 RBIs og 84 scorede runs. Han svingede kun på 19,4 % af kastene uden for strike zone (den laveste procentdel i majors).
Den 25. oktober 2016 blev Dexter Fowler sammen med holdkammeraterne Jason Heyward, Addison Russell og Carl Edwards Jr. de første afroamerikanere til at spille for Cubs i en World Series-kamp. Derudover var Fowler den første afroamerikaner til at optræde og slå for Cubs i en World Series. Fowler er den første afroamerikaner, der starter for Cubs i en World Series.
Fowler indledte Game 7 i World Series med et homerun og blev dermed den første spiller i historien, der indledte en World Series Game 7 med et homerun. Cubs vandt kampen 8-7 i 10 innings, hvilket gav holdet deres første mesterskab i 108 år. Den 5. november afslog Fowler sin gensidige option for 2017-sæsonen og blev free agent.
St. Louis CardinalsRediger
Den 9. december 2016 blev Fowler og St. Louis Cardinals enige om en femårig aftale på 82,5 millioner dollars. Han slog sit første homerun og RBI som Cardinal mod Pittsburgh Pirates-kasteren Gerrit Cole den 19. april 2017. Fowler afsluttede sin første sæson i St. Louis med et slaggennemsnit på 0,264, 18 homeruns og 64 RBI’er i 118 kampe.
Forud for 2018-sæsonen indvilligede han i at skifte position for at blive Cardinals’ startende højre markspiller; Cardinals flyttede Tommy Pham til center og havde erhvervet Marcell Ozuna i offseason. Fowler slog sit første walk-off home run nogensinde den 6. maj 2018 i bunden af den 14. inning mod sit tidligere hold, Chicago Cubs. Hans to-run home run var med til at føre Cardinals til en 4-3 sejr. Den 21. august 2018 blev Fowler sat på 60-dages invalidelisten, hvilket afsluttede en skuffende 2018-sæson, hvor han scorede .180/.278/.298 med otte homeruns og 31 RBI’er i 90 kampe.
Fowler vendte tilbage sund og rask i 2019 som St. Louis’ startende højre markspiller. I løbet af 150 kampe i den regulære sæson scorede han .238/.346/.409 med 19 homeruns og 67 RBIs.
I 2020 slog han .233/.317/.389 med 28 strikeouts i 90 at bats.
Los Angeles AngelsRediger
Den 4. februar 2021 handlede Cardinals Fowler og kontanter til Los Angeles Angels for en spiller, der vil blive navngivet senere.