Så vi skal tale om kooperativ binding, som er et meget interessant emne, når vi diskuterer enzymkinetik, men lad os først gennemgå ideen om, at vi kan opdele enzymkatalysen i to trin, først bindingen af substratenzym og dernæst dannelsen af produkt, og ved hjælp af denne ide kan vi udlede michaelis-menten ligning, som er meget nyttig til kvantitativt at se på enzymkinetik også huske, at når du øger substratkoncentrationen, vil hastigheden af produktdannelsen udjævnes ved sin maksimale værdi som vist på denne graf nu den første ting, som jeg vil tale om, er, at nogle proteiner kan binde mere end ét substrat og ikke alle enzymer har kun ét aktivt sted, så E Plus’er kan danne es gennem det, der kaldes reaktion 1, men nogle enzymer kan reagere med et andet substratmolekyle for at danne es 2 gennem det, jeg har kaldt reaktion 2 og igen til at danne es 3 gennem reaktion 3 og så videre nu kan disse enzymer danne produkt på ethvert tidspunkt i processen, uanset hvor mange molekyler der er bundet substrat nu vil man forvente, at reaktionshastigheden for reaktion 1 vil være hurtigere end reaktionshastigheden for reaktion 2, hvis vi ser på eksemplet med et enzym med 3 substratbindingssteder, er der 3 tomme steder til rådighed for substratet gennem reaktion 1 og kun to til rådighed for reaktion 2, så man vil forvente, at hastighed 1 vil være hurtigere, ligesom hastighed 2 vil være hurtigere end hastighed 3 af samme grund og idéen er, at mætningen af det aktive sted ikke stiger lineært med substratkoncentrationen. Jeg forstår, at det kan være en mundfuld, så lad os se på det grafisk, men vi vil også vise en undtagelse fra denne regel, så i denne første graf har jeg plottet substratkoncentrationen mod enzymets procentvise mætning, og som du kan se, falder kurven, efterhånden som substratbindingsstederne bliver optaget, og det bliver svært at finde flere substratmolekyler, når der er flere substratmolekyler bundet. kurve, som man også kan se i nogle enzymer, og det er der, hvor substratbinding sker hurtigere, efterhånden som bindingsstederne bliver optaget, og substratbinding ændrer substrataffiniteten, og vi kalder dette kooperativitet. Med hensyn til kooperativitet kan vi nu definere tre nye idéer positiv kooperativ binding forekommer, når substratbinding øger enzymets affinitet for et efterfølgende substrat negativt kooperativ binding forekommer, når substratbinding mindsker enzymets affinitet for efterfølgende substrat mere, end man normalt ville forvente, og ikkekooperativ binding er det samme som i det første eksempel, hvor substratbinding ikke påvirker enzymets affinitet for substratmolekyler, så lad os se på dette grafisk, hvis vi har et protein med f.eks. fem bindingssteder og plotter brøkdelen, der er besat, over for substratkoncentrationen, vil vi få tre mulige kurver den grønne kurve, der har en sigmoidform, vil repræsentere et enzym med positiv kooperativitet den blå kurve med hyperbolisk form vil repræsentere et enzym med ikke-kooperativitet den blå kurve med hyperbolisk form vil repræsentere et enzym med ikke-kooperativitetkooperativ binding og den røde kurve ville snarere end et enzym med negativt kooperativ binding nu husk, at virkningerne af kooperativitet kun ses, efter at noget substrat allerede er bundet, hvilket er grunden til, at forskellen i den besatte fraktion mellem de tre kurver er meget mindre det er mindre værdier som den 1/5, som jeg har vist her, end det er ved de højere værdier, så lad os se på et specifikt eksempel på et par proteiner, så hæmoglobin eller HB er det ilttransporterende molekyle, som du finder i menneskeligt blod, og det kan binde op til i alt fire iltmolekyler, og det udviser positivt kooperativ binding, myoglobin på den anden side som er det ilttransporterende molekyle, der findes i muskelvæv, kan kun binde ét iltmolekyle i alt, og da det kun kan binde ét, må det udvise ikke-kooperativ binding, da der ikke er noget efterfølgende substrat at tale om. Hvis vi nu laver en graf, hvor vi tegner brøkdelen af aktive steder, der er bundet i hvert af disse proteiner i forhold til trykket af ilt Husk, at ilt er vores substrat her, og da det er en gas, vil vi bruge tryk i stedet for koncentration, kan du se, at den røde sigmoidkurve, der er forbundet med hæmoglobins positive kooperative binding, ser anderledes ud end den blå hyperboliske kurve, der er forbundet med myoglobins ikke-samarbejdsvillige binding.Hvad lærte vi så, først lærte vi, at nogle proteiner kan binde mere end én substratækvivalent, og dernæst lærte vi, at der findes tre forskellige typer af kooperativitet, positiv negativ og ikke-kooperativ Endelig lærte vi om proteiner, der udviser to forskellige typer af kooperativitet, hvilket var de iltbindende molekyler hæmoglobin og myoglobin.