Cupionich blev nævnt af Mariano Bolizza i 1614 og var en del af Sanjak af Scutari. Den var romersk-katolsk, havde 60 huse og 130 våbenmænd under kommando af Pecha Campersa.
Koplik menes at være blevet grundlagt engang i det 14. århundrede af zar Stephan Dushan af Serbien.
Koplik er en grænseby og har som sådan en lang historie med krigsførelse. Kopliks historiske betydning skyldes i høj grad stammefolkene Malissori. Deres voldsomme uafhængige natur sikrede, at Koplik ofte var indblandet i krige mod osmannerne og serberne gennem en stor del af sin historie. I selve byen er der et monument til minde om slaget ved Koplik, som også er kendt som slaget ved Deçiq, fordi det blev udkæmpet både i Koplik og Tuzi. Slaget var et resultat af et oprør af Malsori-stammefolk ledet af Ded Gjo Luli fra Traboin-Hoti-stammen mod den osmanniske kejserlige autoritet. Slaget var en kostbar sejr for Malsori-stammen. Efter første verdenskrig og opdelingen af Malsia e Madhe i to dele blev området omkring Tuzi givet til Kongeriget Montenegro, mens området omkring Koplik forblev albansk, og Koplik blev oprettet som regional hovedstad i Malsia e Madhe. Under den osmanniske besættelse konverterede mange af byens indbyggere til islam, selv om landbefolkningen i Malësia e Madhe fortsat var overvejende katolsk. Det kommunistiske regime lagde store begrænsninger på mobiliteten, men efter kommunismens fald i 1991 oplevede Koplik en stor tilstrømning af nye bosættere fra landet.
I 1984 blev Koplik ophøjet til bystatus, og efter det første demokratiske valg den 26. juli 1992 fik Koplik tildelt en kommune.