Vejbeskrivelse:
Lysinacetylering er en reversibel posttranslationel modifikation, der spiller en afgørende rolle i reguleringen af proteinfunktion, kromatinstruktur og genekspression. Mange transkriptionelle coaktivatorer besidder iboende acetylaseaktivitet, mens transkriptionelle corepressorer er forbundet med deacetylaseaktivitet. Acetyleringskomplekser (såsom CBP/ p300 og PCAF) eller deacetyleringskomplekser (såsom Sin3, NuRD, NcoR og SMRT) rekrutteres til DNA-bundne transkriptionsfaktorer (TF’er) som reaktion på signalveje. Histonhyperacetylering ved hjælp af histonacetyltransferaser (HAT’er) er forbundet med transkriptionel aktivering, mens histondeacetylering ved hjælp af histondeacetylaser (HDAC’er) er forbundet med transkriptionel repression. Histonacetylering stimulerer transkription ved at remodellere kromatinstruktur af højere orden, svække histon-DNA-interaktioner og tilvejebringe bindingssteder for transkriptionelle aktiveringskomplekser, der indeholder proteiner med bromodomainer, som binder acetyleret lysin. Histondeacetylering undertrykker transkription gennem en omvendt mekanisme, der indebærer samling af kompakt kromatin af højere orden og udelukkelse af transkriptionsaktiveringskomplekser, der indeholder bromodomainer. Histonhypoacetylering er et kendetegn for tavse heterokromatin. Stedspecifik acetylering af et stigende antal ikke-histonproteiner har vist sig at regulere deres aktivitet, lokalisering, specifikke interaktioner og stabilitet/nedbrydning. Bemærkelsesværdigt nok har de seneste fremskridt inden for massespektrometri-teknologier gjort det muligt at kortlægge de fleste acetyleringssteder i hele proteomet i høj opløsning. Disse undersøgelser viste, at “acetylomet” omfatter næsten ~3600 acetyleringssteder i ca. ~1750 proteiner, hvilket tyder på, at denne modifikation er en af de hyppigst forekommende kemiske modifikationer i naturen. Det ser faktisk ud til, at dette mærke kan påvirke aktiviteten af proteiner i forskellige biologiske processer, herunder kromatinomdannelse, cellecyklus, splejsning, nuklear transport, mitokondriel biologi og aktinkernedbrydning. På organismeniveau spiller acetylering en vigtig rolle i immunitet, cirkadisk rytme og hukommelsesdannelse. Proteinacetylering er ved at blive et gunstigt mål for lægemiddeldesign i forbindelse med mange sygdomstilstande.