I dag begyndte jeg at gennemgå materiale fra MCAT, så jeg kan komme godt i gang, når jeg om et par måneder begynder på medicinstudiet. Jeg er ikke fan af at huske ting udenad, men der er et par steder hvor det ikke kan undgås. At kende aminosyrerne er et godt eksempel.
Jeg har tre akronymer til at hjælpe mig med at huske navnet på hver aminosyre. Et par af dem får mig også til at huske aminosyrens struktur. Hvert akronym repræsenterer en gruppe af aminosyrer, og hver gruppe er baseret på elektronkarakteren i molekylets sidekæde. Bemærk, at akronymerne anvender aminosyrernes forkortelser på et bogstav:
Nonpolære sidekæder: “Bedstemor besøger altid London i maj til Winstons fest” (G, A, V, L, L, I, M, F, W, P)
Polære sidekæder: “Julemandens team fremstiller hvert år nye dyner” (S, T, C, N, Q, Y)
Elektrisk ladede sidekæder: “Julemandens team fremstiller hvert år nye dyner” (S, T, C, N, Q, Y)
“Dragons Eat Knights Riding Horses” (D, E, K, R, H)
Og selv om disse værktøjer måske passer godt til dig, vil det stadig kræve arbejde at lære aminosyrerne udenad. Jeg anbefaler, at du får et par ark papir, der går gennem disse fire trin:
Først skal du skrive bogstavsrækkefølgen af hvert akronym ned i separate områder på siden, så der er plads til at tegne hver aminosyre. Sig akronymet højt for dig selv, mens du går fremad. (I begyndelsen vil du også gerne skrive det fulde navn og forkortelsen på tre bogstaver for hver aminosyre ned. Senere, når du kender navnene på alle 20 molekyler, kan du sandsynligvis nøjes med at skrive koden på tre bogstaver.)
For det andet skal du tegne aminosyrens grundstruktur (alfakulstof, aminogruppe og carboxylsyregruppe) over hvert bogstav. Du kan enten vise denne struktur som enten en Fischer-projektion (som vist i billedet ovenfor) eller som en stereokemisk figur. Husk, at amino- og carboxylgrupperne er ioniserede ved pH 7, og det samme gælder de elektrisk ladede sidekæder.
For det tredje skal du, knyttet til hver grundstruktur, tegne den relevante sidekæde. Tænk højt, mens du tegner hver sidekæde – det vil hjælpe dig til at huske bedre. Vær opmærksom på akronymets rækkefølge og ændringerne i strukturen, når du går fra den ene sidekæde til den næste.
Slutteligt skal du skylle og gentage. Lav denne øvelse en gang om dagen i en uge, derefter en gang hver anden dag i en uge og til sidst en eller to gange om ugen fremadrettet. Senere kan du prøve at tegne sidekæderne i omvendt eller tilfældig rækkefølge for at få en ekstra udfordring.
Okay, nu hvor vi har en plan for spillet, lad os se nærmere på disse akronymer:
Nonpolære sidekæder:
“Bedstemor besøger altid London i maj til Winstons fest”
- Glycin, Gly, G
- Alanin, Ala, A
- Valin, Val, V
- Leucin, Leu, L
- Isoleucin, Ile, I
- Methionin, Met, M
- Phenylalanin, Phe, F
- Tryptophan, Trp, W
- Proline, Pro, P
For at huske, at dette er akronymet for upolære sidekæder, skal man huske, at London, England, ikke ligger i nærheden af Jordens poler. Det kan også hjælpe dig at forbinde London med Winston Churchill (Det Forenede Kongeriges premierminister under Anden Verdenskrig) og i forlængelse heraf med 8. maj (Victory in Europe Day, som fejrer Nazi-Tysklands formelle overgivelse til de allierede).
Støjsmagerne i den upolære gruppe er phenylalanin (F) og tryptophan (W). Selvfølgelig burde phenylalanins forkortelse på ét bogstav være relativt let at huske, fordi de to første bogstaver, “ph”, udtales som om de var et “F”. Et trick til at huske tryptofans forkortelse er at forestille sig et sidelæns bogstav W dannet af flere af bindingerne i sidekædens sammenføjede fem- og seks-delte ringe.
Polære sidekæder:
“Santa’s Team Crafts New Quilts Yearly”
- Serin, Ser, S
- Threonin, Thr, T
- Cystein, Cys, C
- Asparagin, Asn, N
- Glutamin, Gln, Q
- Tyrosin, Tyr, Y
For at huske, at dette er akronymet for polære sidekæder, skal man blot spørge en femårig, hvor julemanden og hans team af nisser bor – på Nordpolen, naturligvis! (Min mor er meget optaget af quiltning og syning, så det hjælper mig at forbinde quilts med julegaver).)
Som ballademagere i den polære gruppe kan nævnes asparagin (N), glutamin (Q) og tyrosin (Y). En måde at håndtere de to første på er at springe videre til tricket til at huske aspartat og glutamat (se slutningen af dette indlæg for en note om asparagin og glutamin). I mellemtiden husker jeg, at tyrosin har forkortelsen Y, fordi dette bogstav er det andet i det fulde navn, og fordi to af bindingerne i fenylringen og bindingen med hydroxylgruppen kan danne et imaginært Y, hvis sidekæden tegnes nedadrettet.
Cystein er også lidt tricky, men kun fordi den anden officielle måde at stave navnet på, “cystin”, henviser til aminosyrernes oxiderede form.
Elektrisk ladede sidekæder:
“Dragons Eat Knights Riding Horses”
- Aspartat, Asp, D
- Glutamat, Glu, E
- Lysin, Lys, K
- Arginin, Arg, R
- Histidin, His, H
Gennem en elimineringsproces vil du vide, at dette akronym henviser til den resterende gruppe af aminosyrer. Ligesom de irriterende drager er næsten alle molekyler her en ballademager: aspartat (D), glutamat (E), lysin (K) og arginin (R).
Der er to mad-tema-tricks, som jeg bruger til at huske aspartat (D) og glutamat (E). For det første forbinder jeg suffikset “-ate” med tanken om drager, der spiser. For det andet tænker jeg, når jeg ser på de to aminosyrers forkortelser, “Asp” og “Glu”, på udtrykket “Aspiring Gluttons”. Hvad angår lysin (K), husker jeg bare, at L følger efter K i alfabetet. Og arginins forkortelse på et bogstav burde være relativt let at huske, fordi de to første bogstaver, “ar”, udtales som navnet på bogstavet R.
Note om asparagin og glutamin:
Asparagin (N) og glutamin (Q) er identiske med aspartat (D) og glutamat (E), bortset fra at de to førstnævnte har en aminogruppe, hvor de to sidstnævnte har en negativt ladet ilt. Det er nyttigt, at forkortelserne på tre bogstaver for asparagin (N) og glutamin (Q) er henholdsvis Asn og Gln – det faktum, at begge indeholder bogstavet “n”, minder mig om det nitrogenatom, der findes i deres aminosidekæder.