Cupionich wurde 1614 von Mariano Bolizza erwähnt und gehörte zum Sanjak von Skutari. Es war römisch-katholisch, hatte 60 Häuser und 130 bewaffnete Männer, die von Pecha Campersa befehligt wurden.
Koplik wurde vermutlich irgendwann im 14. Jahrhundert von Zar Stephan Dushan von Serbien gegründet.
Koplik ist eine Grenzstadt und hat eine lange Geschichte der Kriegsführung. Seine historische Bedeutung verdankt Koplik vor allem den Malissori-Stammesangehörigen. Ihr unabhängiger Charakter sorgte dafür, dass Koplik während eines Großteils seiner Geschichte oft in Kriege gegen die Osmanen und die Serben verwickelt war. In der Stadt selbst erinnert ein Denkmal an die Schlacht von Koplik, die auch als Schlacht von Deçiq bekannt ist, da sie sowohl in Koplik als auch in Tuzi stattfand. Die Schlacht war das Ergebnis eines Aufstandes von Malsori-Stammesangehörigen unter der Führung von Ded Gjo Luli vom Stamm der Traboin-Hoti gegen die osmanische kaiserliche Autorität. Die Schlacht war ein kostspieliger Sieg für die Malsori-Stammesangehörigen. Nach dem Ersten Weltkrieg und der Teilung von Malsia e Madhe in zwei Teile wurde das Gebiet um Tuzi dem Königreich Montenegro zugesprochen, während das Gebiet um Koplik albanisch blieb und Koplik zur regionalen Hauptstadt von Malsia e Madhe wurde. Während der osmanischen Besatzung konvertierten viele Einwohner der Stadt zum Islam, obwohl die Landbevölkerung in Malësia e Madhe weiterhin hauptsächlich katholisch war. Das kommunistische Regime schränkte die Mobilität stark ein, doch nach dem Fall des Kommunismus im Jahr 1991 erlebte Koplik einen starken Zustrom neuer Siedler vom Land.
Im Jahr 1984 wurde Koplik zur Stadt erhoben und erhielt nach den ersten demokratischen Wahlen am 26. Juli 1992 den Status einer Gemeinde.