Hola,
He publicado mi pregunta en otro sitio pero no me han contestado, me gustaría publicarla aquí y, siento que parezca una pregunta estúpida, porque estoy realmente confundido!
He leído en algún sitio una cosa que me ha dejado perplejo sobre el ADNc. Me gustaría saber si el ADNc es de doble cadena o de una sola?
Sé que el ADNc es la copia del ARNm por la transcriptasa inversa por lo que, teóricamente, sería de una sola cadena, ¿verdad o estoy equivocado?
Gracias por tus comentarios
Puse mi pregunta en otro sitio pero no me contestaron, me gustaría ponerla aquí y, lo siento, parece una pregunta estúpida, porque estoy realmente confundido!
Leí en algún sitio una cosa que me dejó perplejo sobre el ADNc. Me gustaría saber si el ADNc es de doble cadena o de una sola?
Sé que el ADNc es la copia del ARNm por la transcriptasa inversa por lo que, teóricamente, sería de una sola cadena, ¿verdad o estoy equivocado?
Gracias por sus comentarios
Para la mayoría de los casos, como para la RT-PCR, 3′ o 5′ RACE, sólo utilizamos ADNc monocatenario (la primera cadena de ADNc), mientras que en el caso de la preparación del ADNc para la construcción de bibliotecas, o el análisis de RDA/SSH que podría necesitar un paso adicional de síntesis de la segunda cadena para generar ADNc de doble cadena.
hi
hay que diferenciar 2 cosas :
El ADNc en general es la molécula de ADN que corresponde aproximadamente a la seuqencia del ARNm. Así que es una molécula de doble cadena incluida en el plásmido para la expresión en la mayoría de los casos.
RT PCR : la molécula de ARNm se transcribe inversamente en ADNc de cadena simple. Después de este punto la RNasa elimina la molécula de ARNm y se obtiene una molécula de ADNc de cadena simple. Como el paso siguiente es bastante clásico de la PCR, una sola hebra está bien para la exp (y el primer paso, que corresponde a la sysnthesis de la corrseponding segunda cadena de una molécula de ADN restaura la molécula de ADNc real.
Para ser correcto, el ADNc es una molécula de doble cadena, pero por conveniencia, el ADNc también se utiliza para el diseño de la molécula transcrita inversa de la RTPCR. Debería denominarse como medio ADNc o ADNc monocatenario.
El ADNc es un nombre abreviado.
mientras que en la mayoría de los casos, el ADNc, abreviatura de ADN complementario, se define como una molécula de ADN de una sola hebra con una secuencia de nucleótidos que es complementaria a una molécula de ARN, y que se sintetiza en el laboratorio a partir del ARNm por transcripción inversa…
¿Entonces, el ADNc es monocatenario hasta que se realiza una reacción de PCR? Ok, en este caso, ¿cómo la Taq ADN Polimerasa genera una segunda cadena complementaria a partir de una sola? Cuando los dos cebadores se unen a cada lado de la misma hebra, ¿cómo pueden producir la segunda hebra (la nueva complementaria)?
En la PCR un cebador se une a un trozo de ADN de una sola hebra (por eso el primer paso es siempre dentar a 94C(o así) para separar cualquier molécula de doble hebra en hebras simples. En el caso del ADNc de primera cadena de una reacción de RT sólo se une un cebador en la primera ronda… Esto significa que la primera ronda de amplificación en una RT-PCR no es logica, simplemente se sintetiza la segunda cadena de ADNc. En las rondas posteriores (de la ronda 2 a la ronda n) hay amplificación logísmica porque tanto el cebador directo como el inverso se unen a la plantilla de doble cadena desnaturalizada.
En la primera ronda, creo que es el cebador directo el que se une… Creo que esto es porque mRNA=cadena delantera en el genoma y la primera cadena cDNA=complemento de mRNA (o es lo mismo que la cadena inversa en el genoma)
Alguien revise mi lógica aquí, me estoy confundiendo… ¿es correcto que el mRNA es el complemento de la cadena inversa del ADN genómico?
es decir: ¿secuencia del ARNm=cadena delantera=secuencia 5′-3′ en el ADNg (sólo con U no T)???
HTH
Gracias por todo, ahora me queda más claro.
Creo que sí, hasta que se encuentra un intrón, ¿no? 
Podemos comprobar cualquiera de sus secuencias de ARNm conocidas en el NCBI, recuperar el hit genómico y comparar las secuencias para ver si es cierto o no.
Sí, eso es correcto, tendrías que omitir los intrones 
Suena como una buena manera de probar lo intentaré más tarde si tengo una oportunidad y te lo haré saber… cuanto más lo pienso, la secuencia de ARNm=secuencia de la cadena delantera tiene que ser correcta sin embargo…
¡Gracias! 