A húgyúti fertőzések a leggyakoribb bakteriális fertőzések közé tartoznak. Előfordulhatnak vagy szövődménymentes gazdaszervezetben, amikor nincs mögöttes strukturális vagy funkcionális rendellenesség a beteg húgyúti rendszerében, vagy szövődményesen, amikor van. Ez utóbbi esetben gyakori hajlamosító tényező az idegen test jelenléte, beleértve a vizeletkatétert, vagy a normális vizeletáramlás elzáródás vagy visszatartás miatti megzavarása. A baktériumok széles skálán mozognak abban a tekintetben, hogy képesek-e sikeresen behatolni a húgyutakba; az ilyen fertőzések túlnyomó többségét néhány faj okozza. Az útvonal általában a húgycsőből való felszállás. Az Escherichia coli egyes uropatogén törzsei a legtapasztaltabbak, az azonosított okozói gyakoriságuk alapján. Ezek a törzsek számos olyan virulenciafaktort mutatnak, amelyek lehetővé teszik számukra, hogy elfoglalják ezt a rést – ami az ismeretek bővülésével elősegítheti a különböző kezelési módszerek alkalmazását. Más fajok gyakran csak a háttérben meghúzódó urológiai rendellenesség jelenlétében jelennek meg. A húgyúti katéter vagy más vizeletelvezető eszköz jelenléte kész keretet biztosít a szervezetek számára a biofilm kialakításához, ami viszont megvédi őket a sikeres kiirtástól. A vesekő hasonlóan összefüggésbe hozható a biofilm-termeléssel.