DIME (Differential Identification using Mixtures Ensemble)
Robusztus differenciális azonosítási módszer, amely két mintát összehasonlító ChIP-seq adatok elemzéséhez véges keverékmodellek együttesét veszi figyelembe, helyi hamis felfedezési rátával (fdr) kombinálva. Ez a csomag más nagy áteresztőképességű adatok, például microarray, metiláció stb. differenciális azonosítására is használható. normalizálás után egy Exponential-Normal(k) vagy egy Uniform-Normal(k) keverék illeszkedik az adatokhoz. A (k)-normális komponens képviselhet differenciális vagy nem differenciális régiókat azok elhelyezkedésétől és terjedésétől függően. Az exponenciális vagy egyenletes differenciális helyeket reprezentál. helyi (fdr) kiszámításra kerül az illesztett modellből.A csomag egyedi jellemzői:
- A keverékmodellek együttesének használata, amely lehetővé teszi az adatok pontos & hatékony reprezentálását. Ezután kétfázisú kiválasztás biztosítja a legjobb átfogó modell kiválasztását.
- Ez a módszer általános programként használható egyenletes-normális vagy egyenletes-k-normális vagy exponenciális-k-normális
keverék illesztésére.