Streptococcus mitis and Streptococcus oralis normally colonize the human mouth but can also cause infections. Az S. mitis és az S. oralis gyakori okozói az invazív betegségeknek, beleértve a bakteriémia kialakulását, különösen az immunhiányos betegeknél. Ennek következtében elsődleges kórokozói a fertőző endokarditisz (IE) kialakulásának. A S. mitis és a S. oralis antibiotikum-rezisztenciája egyre növekszik, ami kevesebb kezelési lehetőséget eredményez, és szükségessé teszi ezen organizmusok alapvető fiziológiájának mélyebb megértését. Jelentőségük ellenére nem sikerült feltárni azokat a géneket, amelyek lehetővé teszik a S. mitis és a S. oralis szaporodását a véráramban és a szívbillentyűkön. Továbbá a fertőzési izolátumok kevéssé képviseltetik magukat a genomszekvenálási elemzésekben, ezért nem ismert, hogy ezek a törzsek rendelkeznek-e olyan egyedi tulajdonságokkal, amelyek fokozzák a véráramban és a szívbillentyűkön való szaporodási képességüket. A következmény az, hogy egyes betegeknél a mikrobiomjukban található törzsek miatt nagyobb lehet a S. mitis vagy S. oralis fertőzés kockázata; e törzsek jellemzőinek azonosítása, valamint a betegek kockázati tényezőinek azonosítása lehetővé tenné a hatékonyabb megelőzést és az azonnali kezelést. Az itt javasolt kutatás genomszekvenálási és mutagenezis módszereket alkalmaz a virulencia genetikai mechanizmusainak vizsgálatára ezekben a baktériumokban.
Az 1. célkitűzésben a retrospektív gyűjtésből származó bakteriémia és endocarditis izolátumokat szekvenálják és filogenomikai megközelítések alkalmazásával összehasonlítják az orális izolátumokkal.
Az 1. cél két célt szolgál: A. Annak a hipotézisnek a tesztelése, hogy a S. mitis és a S. oralis fertőzéshez specifikus genetikai jellemzők kapcsolódnak. B. A S. mitis és a S. oralis közötti genomikai különbségek meghatározása. A beteg jellemzőit is összefüggésbe hozzák annak megállapítása érdekében, hogy a fertőzés kimenetele jobban összefügg-e a szervezet virulenciájával, mint a gazdaszervezet jellemzőivel.
A 2. célzott mutagenezist és transzpozonmutagenezist alkalmaznak szekvenálással (Tn-Seq) a S. mitis és a S. oralis növekedéséhez szükséges gének azonosítására vérben és szimulált endokardiális vegetációban. A kutatás befejeztével ezek a célok tisztázni fogják, hogy mit jelent S. mitisnek vagy S. oralisnak lenni, potenciálisan azonosítva a két faj között gyorsan megkülönböztető géneket vagy fenotípusokat; meghatározzák, hogy léteznek-e olyan magas kockázatú törzsek, amelyek patogén és/vagy antibiotikum-rezisztencia tulajdonságokkal gazdagodnak; és megkezdik annak vizsgálatát, hogy a fertőzőképesség az S. mitis vagy S. oralis egyik fő jellemzője-e. Az S. mitis és a S. oralis a S. mitis és a S. oralis egyik fő jellemzője. mitis és az S. oralis fertőzőképessége, amelyet a szekvencia-variáció és a horizontális géntranszfer fokoz, és/vagy a virulencia inkább az egyéni gazdatulajdonságoktól függ.
Közegészségügyi jelentőség
A viridans-csoportba tartozó streptococcusok, különösen a Streptococcus mitis és az S. oralis, a bakteriémia és a fertőző endokarditis vezető okai közé tartoznak. Nem ismertek azok a mechanizmusok, amelyeket ezek a normális emberi szájüregi kolonizátorok a véráramban és a szívbillentyűkön való szaporodásukhoz használnak. Az itt javasolt kutatás genomszekvenálási és in vitro modellezési megközelítéseket alkalmaz a virulencia genetikai mechanizmusainak vizsgálatára ezekben a baktériumokban.