A Redwood Creek kritikus ívási és felnevelési élőhelyet biztosít a coho vagy ezüstlazac (Oncorhynchus kisutch), a parti vágófejű lazac (Oncorhynchus clarki clarki) és az acélfejű pisztráng (Oncorhynchus mykiss) számára, amelyek mindegyike veszélyeztetett faj. A patak közel van a coho élőhely legdélebbi határához, és a halakat soha nem telepítették, ezért jellegzetes DNS-sel rendelkeznek. A Redwood Creek-i lazacok a Central Coast-i coho lazacok, amelyek 2006 októbere óta szövetségi szinten veszélyeztetett fajként, 2005 júniusában pedig szövetségi szinten veszélyeztetett fajként szerepelnek a jegyzékben. A coho lazacok az óceánból vándorolnak vissza az édesvízbe, hogy egyszeri esélyt kapjanak a szaporodásra, általában az óceánban töltött két év után. Az ívási vándorlás azután kezdődik, hogy a heves késő őszi vagy téli esőzések áttörik a Muir Beach-i homokpadot, és a halak felfelé mozoghatnak a folyón (általában decemberben és januárban). Sem a 2007-2008-as, sem a 2008-2009-es téli ívás során nem láttak lazacokat. A jelek arra utalnak, hogy a patakban túlnyaraló lazacok kimerültek a nagy fatörmelék és a fiatal lazacok számára pihenésre alkalmas mély medencék elvesztése miatt. A Nemzeti Parkszolgálat 2009-től kezdődően megkezdi a Muir Beach helyreállítását, hogy működőképes, önfenntartó ökoszisztémát hozzon létre, és javítsa a látogatók hozzáférését. A beavatkozás már majdnem elkésett, mivel a kohónak csak hároméves az élettartama. Szerencsére 2010 januárjában, három év óta először, becslések szerint 45 coho hal úszott fel a Redwood Creekbe ívni, és 23 redd-et vagy ikrákból álló csoportot hozott létre. 2011-ben 11 élő kifejlett kohót és 1 kohó tetemet figyeltek meg, valamint három ívóhelyet, ami szerény növekedést jelent a 2007-2008-as ívási szezonhoz képest. Államszerte a kohópopuláció az 1940-es évek szintjének 1%-a, és a halak eltűntek a hivatalosan látogatott patakok 90%-ából. A Watershed Alliance of Marin jelentése szerint 2014-ben egyetlen lazac sem tért vissza ívásra, ami aggodalomra ad okot, hogy a halak helyileg kihaltak. A California Department of Fish and Wildlife “coho jumpstart” műveletének részeként 2014-ben a patakból ivadékként kifogott három kifejlett hím coho-t három Olema Creek-i nősténnyel együtt engedték szabadon, és legalább az utóbbiak közül egyet megfigyeltek ívás közben, ami felcsillantotta a reményt, hogy a Redwood Creekbe visszatér egy életképes ívóállomány.
2003 őszén az NPS befejezte a Banducci Site helyreállítási projekt első szakaszát, körülbelül 1 km-re a patak Muir Beach-i torkolatától felfelé. Kivágott eukaliptuszfák felhasználásával és a korlátozó gátak áttörésével mesterséges rönkgátakat építettek a csatorna és az árterület újbóli összekapcsolása érdekében. A folyóvízi projekt elsődleges célja az volt, hogy nevelőmedencéket hozzon létre a fiatal lazacfélék számára. Az NPS eltávolította az invazív, nem őshonos növényzetet is a folyóparti folyosón, és azt őshonos növényzettel helyettesítette, hogy javítsa a fészkelő élőhelyet a helyben lakó és vándorló folyóparti énekesmadarak számára. A Redwood Creek helyreállítási projekt 2009-ben megkezdett jelenlegi szakasza a patak 46 hektáros árterének helyreállítására tesz kísérletet. Ez magában foglalja egy új, 650 láb hosszú, kanyargós csatorna létrehozását három mellékcsatornával, amely megpróbálja helyreállítani a történelmi Nagy Lagúnát, amely az 1850-es térképek szerint egészen a jelenlegi Pelican Innig terjedt. Amint a telepített őshonos növényzet meghonosodik az új patakparton, a jelenlegi parkolót 90 fokkal elforgatják, és összekötik az új csatornával.
A vízgyűjtőn élő egyéb ritka fajok közé tartozik az északi foltos bagoly (Strix occidentalis caurina) és a kaliforniai vöröslábú béka (Rana aurora draytonii). 2009 végén az NPS egy tavat ásott ki a Green Gulch Farm egyik legelőjén, hogy élőhelyet biztosítson az egyre fogyatkozó kaliforniai vöröslábú béka populációjának, amely az egyetlen a vízgyűjtőn.
A folyami vidrát (Lontra canadensis) 1996-ban észlelték a Redwood Creekben, és minden évben visszatér, hogy acélfejű pisztrángot egyen. Grinnell 1937-es, Kalifornia prémes emlőseit bemutató könyvében a folyami vidra nem szerepel Marin megyében őshonosnak.