Agarosio

Polveri di agarosio e gel prefabbricati

Bio-Rad offre una varietà di polveri di agarosio e gel di agarosio prefabbricati per soddisfare tutte le vostre esigenze di elettroforesi di DNA e RNA, compresa l’elettroforesi in gel a campo pulsato e applicazioni speciali come IEP e IEF. Le polveri sono agarosio di DNA di qualità genetica certificata. I nostri gel prefabbricati sono disponibili sia in tampone TBE che TAE, con o senza bromuro di etidio.

Tipi di agarosio e usi nell’elettroforesi

Tutti i prodotti di agarosio Bio-Rad sono garantiti privi di inibitori, DNasi e RNasi. Esiste una gamma di tipi di agarosio che sono stati ottimizzati per usi diversi.

Agarosio per biologia molecolare: Questo è un agarosio di uso generale che ha un alto limite di esclusione. Questo tipo di agarosio ha un’alta resistenza del gel ed è facile da maneggiare a basse percentuali. L’agarosio per biologia molecolare è di grado GQT (qualità genetica testata), il che lo rende ideale per i gel preparativi e il recupero del DNA. La separazione analitica è >1.000 coppie di basi (bp).

Agarosio a bassa fusione: L’uso principale dell’agarosio a bassa fusione è per l’elettroforesi preparatoria. È ideale per applicazioni in-gel come legatura, PCR, digestione con enzimi di restrizione, trasformazione e sequenziamento. Altre applicazioni includono l’elettroforesi in campo pulsato di DNA megabase e l’inclusione di cromosomi. Questo agarosio ha una temperatura di gelificazione di 26°C e un’alta capacità risolutiva, >1.000 kb.

L’agarosio a bassa fusione è anche usato per fissare le strisce di gradiente di pH immobilizzato (IPG) per la focalizzazione isoelettrica, la seconda dimensione della SDS-PAGE 2-D. Questo agarosio contiene blu di bromofenolo per il monitoraggio dell’elettroforesi.

AgarosioPCR: Questo agarosio ad alta resistenza forma gel che sono facili da maneggiare e rimangono flessibili anche ad alte percentuali di gel, riducendo il rischio di crepe o rotture. La temperatura di gelificazione è di 40°C. Questo agarosio ha eccellenti proprietà di setacciamento e la più alta forza del gel di tutti gli agarosio.

L’agarosio a bassa fusione PCR ha un’elevata capacità di setacciamento. È ideale per l’elettroforesi preparatoria e per applicazioni in-gel come digest con enzimi di restrizione, legatura e trasformazione. L’agarosio per PCR è raccomandato per frammenti di DNA <1.000 bp.

Bassa gamma di ultra agarosio: Questo agarosio fornisce la risoluzione di primer e piccoli prodotti di PCR a concentrazioni inferiori rispetto all’agarosio standard, evitando la necessità di utilizzare la poliacrilamide. Un gel al 3% risolve chiaramente un ladder di 10 bp. La separazione analitica è di 20-800 bp.

Megabase agarose: Questo agarosio ha una forza del gel molto alta, un’alta mobilità elettroforetica e un alto limite di esclusione. L’agarosio Megabase è la scelta migliore per le applicazioni di elettroforesi con campo elettrico omogeneo clampato (CHEF) e con gel ad inversione di campo (FIGE). I gel rimangono facili da maneggiare a concentrazioni basse come lo 0,3% e permettono tempi di esecuzione più brevi. La bassa colorazione di fondo fornisce anche un’immagine superiore del DNA ad alto peso molecolare. La gamma di separazione è compresa tra 1 kb e 5 Mb.

Agarosio a campo pulsato: L’elettroforesi a campo pulsato (PFGE) è usata per la separazione di grandi frammenti di DNA. Anche se i gel colati con questo agarosio hanno tempi di esecuzione PFGE più lunghi rispetto all’agarosio megabase, le condizioni di esecuzione per questo agarosio sono un protocollo preimpostato e selezionabile per l’auto-algoritmo del sistema CHEF Mapper® XA. L’intervallo di separazione va da 1 kb a 2 Mb.

Agarosio per IEP e IEF: Sono disponibili agarosio per immunoelettroforesi (IEP) e focalizzazione isoelettrica (IEF). Possono essere usati per determinare i pesi molecolari relativi (Mr). L’agarosio per IEF non ha elettroendosmosi rilevabile.

Gel di agarosio prefusi

I gel di agarosio prefusi hanno diversi vantaggi, oltre alla velocità e alla riproducibilità. Il vassoio di bloccaggio significa che i gel di agarosio non si muovono durante il caricamento e all’inizio di una corsa, il che può causare uno spreco di campione, dare carichi irregolari e diminuire la nitidezza delle bande. Il vassoio trasparente agli UV ha pozzetti numerati fluorescenti che aiutano a tenere traccia dei modelli di caricamento quando ci sono molti campioni, così come un righello fluorescente lungo un lato per misurare la migrazione.

È disponibile un’ampia varietà di gel, 1 e 3% di agarosio, TBE e TAE, e con e senza bromuro di etidio. Le configurazioni dei pozzetti si adattano a esigenze che vanno dalla preparazione allo screening di un gran numero di campioni (fino a quattro file di pozzetti). L’uniformità rende i gel di agarosio prefabbricati facili da caricare con una pipetta multicanale.

I gel di agarosio prefabbricati forniscono un’eccellente separazione e risoluzione del DNA e sono compatibili con la maggior parte dei sistemi di elettroforesi orizzontale sottomarina.

Più informazioni sull’agarosio

L’agarosio è un polisaccaride lineare costituito da unità ripetute di agarobiosio che viene estratto da alghe rosse bollite. La sua carica neutra, la bassa temperatura di gelificazione e la formazione di gel stabili con grandi dimensioni dei pori rendono l’agarosio un buon mezzo per l’elettroforesi e la cromatografia. I gel di agarosio sono facili e veloci da preparare e possono separare frammenti di DNA che vanno da circa 20 bp a molte megabasi. Le perle di agarosio sono ampiamente utilizzate per la cromatografia su colonna, in particolare nella cromatografia di esclusione della dimensione e di affinità.