Marlon Green è nato a El Dorado, Arkansas. Suo padre, Mickinley Green, era nato nel 1900, e sposò la futura madre di Green, Lucy, il 10 aprile 1921. Il fratello di Green, Rudolph Valentino Green, nacque nel 1928, seguito da Marlon (6 giugno 1929); Jean Evelyn (1933); James Zell (1936); e Allen David (1941).
Nel 1936 o 1937, la famiglia si trasferì a Lansing, Michigan, dove trovò lavoro alla Drop Forge Company. In seguito si unì al personale domestico del dentista J. Shelton Rushing come quello che suo figlio chiamava il maggiore domo.
Marlon Green si unì alla United States Air Force, dove il suo ultimo incarico fu pilotare l’SA-16 Albatross con il 36° Air Rescue Squadron alla Johnson Air Base di Tokyo, Giappone. Mentre era in licenza nel 1957, fece domanda per una posizione di pilota con la Continental Airlines, e fu invitato ad un colloquio dopo aver lasciato in bianco la domanda sull’identità razziale. Ha anche omesso di incollare nel piccolo blocco quadrato previsto nell’angolo superiore destro della prima pagina della domanda, una sua foto, Cinque altri candidati bianchi, meno qualificati, furono assunti. Secondo varie fonti, o è stato respinto allora, o è stato assunto come quello che sarebbe stato il primo pilota afro-americano della nazione per una grande compagnia aerea commerciale, ma è stato respinto dopo la segnalazione per l’orientamento. Il 22 aprile 1963, dopo le discussioni orali del 28 marzo 1963, la Corte Suprema degli Stati Uniti decise in “Colorado Anti-Discrimination Commission v. Continental Airlines, Inc. 372 U.S. 714 n. 146” che Green era stato illegalmente discriminato. Nel 1964, l’American Airlines assunse David Harris come primo pilota afroamericano per la principale compagnia aerea statunitense di passeggeri. Dopo la vittoria della Corte Suprema, Green volò per Continental dal 1965 al 1978, inizialmente pilotando Vickers Viscounts fuori Denver. Divenne capitano nel 1966.
Green morì a 80 anni a Denver, Colorado. Era divorziato e lascia tre figlie e tre figli. Il 16 febbraio 2010, al George Bush Intercontinental Airport di Houston, Texas, la Continental Airlines gli ha intitolato un Boeing 737-824 (N77518, cn 31605)>.
Durante la sua vita, Green è stato inserito nella Arkansas Aviation Hall of Fame.