Rilevamento in laboratorio e identificazione delle specie di Aspergillus mediante osservazione microscopica e coltura: l’approccio tradizionale

Abstract

I test molecolari e immunologici promettono una migliore e più veloce diagnosi di laboratorio dell’aspergillosi, ma la microscopia e la coltura rimangono strumenti essenziali e comunemente usati. Modifiche procedurali, così come un’adeguata formazione dei professionisti di laboratorio, possono migliorare il valore di questi strumenti tradizionali. Utilizzare Blankophor o Calcofluor per gli esami microscopici; migliorare il riconoscimento delle caratteristiche morfologiche dei funghi opportunisti negli strisci colorati dei campioni; massimizzare il tasso di crescita e la produzione di conidi di Aspergillus spp. in coltura; e riconoscere le varianti atipiche degli aspergilli comuni può migliorare il contributo del laboratorio alla diagnosi rapida. I sondaggi indicano che il numero di professionisti di laboratorio sta diminuendo mentre la domanda di assistenza sanitaria è in aumento. Il reclutamento efficace, il mantenimento e la formazione del personale devono essere paralleli ai progressi della tecnologia.

Aspergillus, cultura, istopatologia, microscopia, formazione

Introduzione

I metodi tradizionali per la diagnosi di aspergillosi e altre micosi sono stati integrati da approcci molecolari e immunologici. Mentre i vantaggi dei test basati sugli acidi nucleici sono evidenti, la loro standardizzazione e utilità clinica non sono state pienamente realizzate. Inoltre, mentre il test EIA sul galattomannano per l’antigene dell’Aspergillus è ampiamente disponibile negli Stati Uniti, l’uso standard dei test basati sugli acidi nucleici per l’identificazione degli isolati clinici appare limitato. I laboratori di riferimento che offrono l’identificazione molecolare degli aspergilli includono i Centers for Disease Control and Prevention (CDC), Atlanta, Georgia, il Centraalbureau voor Schimmelcultur (CBS), Utrecht, Paesi Bassi, e i laboratori negli Stati Uniti elencati nella directory dei test online dell’Association for Molecular Pathology. Anche se i metodi molecolari continuano a migliorare e a diventare più facilmente disponibili, la microscopia e la coltura rimangono gli strumenti di laboratorio principali per l’individuazione degli aspergilli. Il 2003 American Society for Microbiology (ASM) Benchmarking Survey ha documentato che l’89% dei laboratori che eseguono test micologici utilizzano la coltura, il 16% la sierologia e meno del 5% i test molecolari. Solo il 3% dei laboratori dichiaranti usa test molecolari “fatti in casa” per i patogeni microbici. Data la continua dipendenza dalla microscopia e dalla coltura, il valore diagnostico di questi metodi deve essere migliorato da cambiamenti procedurali e da un’adeguata formazione del personale di laboratorio.

Microscopia

I metodi microscopici, come il wet mount, la colorazione di Gram e l’istopatologia convenzionale, forniscono indizi che suggeriscono la presenza di Aspergillus spp. nei tessuti. Blankophor o Calcofluor mescolato con il 10%-20% di idrossido di potassio (KOH), macchia le pareti cellulari dei funghi e migliora il rilevamento dei funghi. Mentre il Calcofluor cristallizza in un pH alcalino, il Blankophor non lo fa e può essere conservato in una soluzione di lavoro fino a un anno. I marcatori fenotipici rilevati dalle macchie istopatologiche, così come dalla colorazione di Gram o dai supporti umidi, forniscono informazioni preziose per i funghi clinicamente importanti, soprattutto in assenza di coltura (Tabella 1). Tuttavia, la conferma dei risultati microscopici tramite coltura è sempre auspicabile e, nella maggior parte dei casi che coinvolgono muffe opportunistiche, essenziale per l’identificazione definitiva del patogeno. Nonostante la presenza di indizi visivi, l’identificazione degli aspergilli tramite la sola microscopia può essere fuorviante. Schell riporta un caso di sinusite da Aspergillus niger in cui i conidi di A. niger sono stati confusi con le cellule di lievito di Candida spp. e sezioni trasversali degli stipi di A. niger sono state confuse con le ampie ife di uno zigomicete. La comunicazione tra il patologo clinico e il micologo di laboratorio, che identifica abitualmente i funghi filamentosi dalla coltura, può migliorare il valore diagnostico dell’istopatologia.

Tabella 1

Marcatori microscopici di specie selezionate di Aspergillus e altri patogeni fungini opportunisti.

Organismo (s) . Microscopici marcatori in preparati di vetrini di campioni preparati con procedure standard* .
. Hyphae . Altre caratteristiche .
A. fumigatus 2,5-8 µm di larghezza, settato, ialino, ramificazione ad angolo acuto, ramificazione ad albero o a ventaglio. I gambi possono assomigliare a ife di zigomiceti Capo conidiario uniseriato, colonnare, conidi in catene o staccati e dispersi. I conidi singoli o appaiati possono assomigliare a cellule di lievito
A. niger Vedi A. fumigatus Testa conidiale biseriata, raggiata, conidi in catene o staccati e dispersi. I conidi singoli o appaiati possono assomigliare a cellule di lievito
A. terreus Vedi A. fumigatus Piccoli conidi rotondi, ialini (conidi “accessori”) attaccati alle ife vegetative
Acremonium, Fusarium, and Paecilomyces spp See A. fumigatus Pialidi e fialoconidi, specifici del genere, possono essere trovati in tessuti chiusi
Scedosporium apiospermum Vedi A. fumigatus Si possono trovare annelloconidi e annellidi tipici in tessuti chiusi
Zygomycetes 10-30 µm di larghezza, asettici, non radianti, con ramificazioni a 90°. Le pieghe nelle ife possono simulare i setti
Muffe dematiacee Ife con pigmentazione marrone; pareti spesso non parallele; possono apparire moniliformi (come un ‘filo di perline’) Pigmento marrone visto nell’esame KOH con illuminazione in campo chiaro; colorato con Fontana-Masson e spesso con Ematossilina ed Eosina
Organismo (i) . Microscopici marcatori in preparati di vetrini di campioni preparati con procedure standard* .
. Hyphae . Altre caratteristiche .
A. fumigatus 2,5-8 µm di larghezza, settato, ialino, ramificazione ad angolo acuto, ramificazione ad albero o a ventaglio. I gambi possono assomigliare a ife di zigomiceti Capo conidiario uniseriato, colonnare, conidi in catene o staccati e dispersi. I conidi singoli o appaiati possono assomigliare a cellule di lievito
A. niger Vedi A. fumigatus Testa conidiale biseriata, raggiata, conidi in catene o staccati e dispersi. I conidi singoli o appaiati possono assomigliare a cellule di lievito
A. terreus Vedi A. fumigatus Piccoli conidi rotondi, ialini (conidi “accessori”) attaccati alle ife vegetative
Acremonium, Fusarium, and Paecilomyces spp See A. fumigatus Pialidi e fialoconidi, specifici del genere, possono essere trovati in tessuti chiusi
Scedosporium apiospermum Vedi A. fumigatus Si possono trovare annelloconidi e annellidi tipici in tessuti chiusi
Zygomycetes 10-30 µm di larghezza, asettici, non radianti, con ramificazioni a 90°. Le pieghe nelle ife possono simulare i setti
Muffe dematiacee Ife con pigmentazione marrone; pareti spesso non parallele; possono apparire moniliformi (come un ‘filo di perline’) Pigmento marrone visibile nell’esame KOH con illuminazione in campo chiaro; colorato con Fontana-Masson e spesso con Ematossilina ed Eosina
*

Per una valutazione accurata dei marcatori è necessaria una certa competenza nell’identificazione delle muffe. I risultati devono essere confermati dalla coltura.

Tabella 1

Marcatori microscopici di specie selezionate di Aspergillus e altri patogeni fungini opportunisti.

Organismo (s) . Microscopici marcatori in preparati di vetrini di campioni preparati con procedure standard* .
. Hyphae . Altre caratteristiche .
A. fumigatus 2,5-8 µm di larghezza, settato, ialino, ramificazione ad angolo acuto, ramificazione ad albero o a ventaglio. I gambi possono assomigliare a ife di zigomiceti Capo conidiario uniseriato, colonnare, conidi in catene o staccati e dispersi. I conidi singoli o appaiati possono assomigliare a cellule di lievito
A. niger Vedi A. fumigatus Testa conidiale biseriata, raggiata, conidi in catene o staccati e dispersi. I conidi singoli o appaiati possono assomigliare a cellule di lievito
A. terreus Vedi A. fumigatus Piccoli conidi rotondi, ialini (conidi “accessori”) attaccati alle ife vegetative
Acremonium, Fusarium, and Paecilomyces spp See A. fumigatus Pialidi e fialoconidi, specifici del genere, possono essere trovati in tessuti chiusi
Scedosporium apiospermum Vedi A. fumigatus Si possono trovare annelloconidi e annellidi tipici in tessuti chiusi
Zygomycetes 10-30 µm di larghezza, asettici, non radianti, con ramificazioni a 90°. Le pieghe nelle ife possono simulare i setti
Muffe dematiacee Ife con pigmentazione marrone; pareti spesso non parallele; possono apparire moniliformi (come un ‘filo di perline’) Pigmento marrone visto nell’esame KOH con illuminazione in campo chiaro; colorato con Fontana-Masson e spesso con Ematossilina ed Eosina
Organismo (i) . Microscopici marcatori in preparati di vetrini di campioni preparati con procedure standard* .
. Hyphae . Altre caratteristiche .
A. fumigatus 2,5-8 µm di larghezza, settato, ialino, ramificazione ad angolo acuto, ramificazione ad albero o a ventaglio. I gambi possono assomigliare a ife di zigomiceti Capo conidiario uniseriato, colonnare, conidi in catene o staccati e dispersi. I conidi singoli o appaiati possono assomigliare a cellule di lievito
A. niger Vedi A. fumigatus Testa conidiale biseriata, raggiata, conidi in catene o staccati e dispersi. I conidi singoli o appaiati possono assomigliare a cellule di lievito
A. terreus Vedi A. fumigatus Piccoli conidi rotondi, ialini (conidi “accessori”) attaccati alle ife vegetative
Acremonium, Fusarium, and Paecilomyces spp See A. fumigatus Pialidi e fialoconidi, specifici del genere, possono essere trovati in tessuti chiusi
Scedosporium apiospermum Vedi A. fumigatus Si possono trovare annelloconidi e annellidi tipici in tessuti chiusi
Zygomycetes 10-30 µm di larghezza, asettici, non radianti, con ramificazioni a 90°. Le pieghe nelle ife possono simulare i setti
Muffe dematiacee Ife con pigmentazione marrone; pareti spesso non parallele; possono apparire moniliformi (come un ‘filo di perline’) Pigmento marrone visibile nell’esame KOH con illuminazione in campo chiaro; colorato con Fontana-Masson e spesso con Ematossilina ed Eosina
*

Per una valutazione accurata dei marcatori è necessaria una certa competenza nell’identificazione delle muffe. I risultati devono essere confermati dalla coltura.

Riconoscimento delle caratteristiche morfologiche

Siccome gli aspergilli sono onnipresenti in natura, possono comunemente contaminare campioni e terreni di coltura. Di conseguenza, determinare il significato di Aspergillus spp. che cresce in coltura è spesso una sfida quando l’esame microscopico del campione è negativo. In un’indagine sugli isolati di Aspergillus dai destinatari di trapianti di fegato e reni, Brown et al. hanno scoperto che la presenza di più di due colonie in una coltura e l’infezione in più di un sito predicevano un’infezione significativa. Nei pazienti granulocitopenici con leucemia acuta, un singolo isolamento da un campione respiratorio inferiore deve essere considerato significativo. Rapporti inequivocabili delle osservazioni di laboratorio al medico possono ridurre il dilemma diagnostico. Per esempio, la dichiarazione: “Un totale di tre colonie di Aspergillus fumigatus isolate su due delle tre piastre” fornisce più informazioni di “Raro A. fumigatus isolato”.

Ottimizzare i risultati della coltura

L’isolamento in coltura e l’identificazione fenotipica dei comuni isolati clinici di Aspergillus spp. è solitamente facile e veloce. Tuttavia, la coltura è spesso descritta come lenta, creando forse idee sbagliate sul suo valore per il rilevamento degli aspergilli. A. fumigatus è un coltivatore rapido. Le tipiche colonie velutinose, grigio-blu-verdi e le teste conidiali uniseriate si sviluppano entro 24-48 ore su entrambi i supporti fungini e sull’agar sangue di pecora comunemente usato per la coltura batterica. Altri aspergilli associati all’aspergillosi invasiva, in particolare A. flavus, A. niger, A. nidulans e A. terreus hanno tassi di crescita simili a quelli di A. fumigatus quando le colonie sono state misurate su agar di estratto di malto e agar di lievito Czapek dopo un’incubazione di sette giorni a 25°C e 37°C. Poiché la resistenza ai farmaci di alcuni Aspergillus spp. è una minaccia, l’identificazione completa, non solo di A. fumigatus, ma anche delle specie meno comunemente isolate, è garantita. Gli scienziati di laboratorio devono anche riconoscere gli isolati atipici di Aspergillus spp. Recentemente sono stati riportati ceppi scarsamente sporulanti (bianchi) di A. fumigatus con una ridotta suscettibilità a diversi farmaci antifungini. Questi ceppi bianchi hanno una sequenza genetica diversa da quella del wild-type, A. fumigatus Fresenius, e non sono riusciti a sviluppare le tipiche teste conidiali blu-verdi fino a 10-12 giorni dopo l’incubazione. Un’altra sfida è la muffa bianca, Neosartorya fisheri, che inizialmente produce teste conidiali rade, simili a quelle di A. fumigatus. Tuttavia, N. fisheri sviluppa successivamente numerosi cleistoteci rotondi a parete sottile, rendendo semplice la differenziazione da A. fumigatus. Un cannocchiale da dissezione è utile per localizzare rapidamente le teste dei conidi e i cleistoteci. Possono verificarsi isolati sterili, bianchi, a crescita rapida o glabri, ammassati, a crescita lenta di A. fumigatus, che richiedono la termotolleranza e il test dell’esoantigene per l’identificazione definitiva. Khan et al. hanno riportato un A. atipico. terreus isolato da campioni delle vie respiratorie inferiori di un paziente con aspergilloma. Le colonie iniziali erano arancioni e producevano un pigmento giallo diffusibile e piccole cellule singole che venivano confuse con i conidi di Scedosporium apiospermum. Gli anticorpi precipitanti e le teste conidiali tipiche di A. terreus prodotte dopo 10 settimane di incubazione hanno confermato l’identificazione.

Le immagini e le informazioni disponibili nei libri di testo e su Internet offrono buone opportunità educative per imparare a identificare Aspergillus spp. Il CDC, il National Laboratory Training Network (NLTN) e la CBS offrono workshop di laboratorio. Quando il viaggio fuori sede non è pratico, i laboratori sono incoraggiati a utilizzare il tutorial online, Aspergillus Reference Cultures, per la formazione interna. Gli organismi di riferimento elencati sono disponibili per l’acquisto dalle principali collezioni di colture.

Analizzare ogni fase della procedura di coltura può portare a un migliore recupero degli aspergilli. La liquefazione dei campioni con Sputolisina o altri agenti mucolitici è stata suggerita per il recupero di funghi intrappolati nel muco dell’espettorato e nel materiale del seno recuperato dalla chirurgia endoscopica. L’uso di destrosio di patate, fiocco di patate, estratto di malto, agar di muffa inibitorio, o agar di sporulazione simili come mezzi di isolamento primario per Aspergillus spp. può accelerare il tasso di crescita e la produzione di conidi. L’aggiunta di agenti antibatterici ai terreni di isolamento aiuta a ridurre il tempo di identificazione inibendo la crescita eccessiva dei batteri e riducendo la necessità di subcultura. L’incubazione iniziale dei mezzi fungini a 35-37°C invece di, o in aggiunta a, 30°C può accelerare la crescita di alcuni aspergilli. Allo stesso modo, l’ispezione quotidiana dei terreni di coltura assicura il rilevamento più precoce possibile. Incubando le piastre di coltura in un ambiente microaerofilo a 35 °C, Tarrand ha scoperto che Aspergillus spp. selezionati e clinicamente importanti crescevano da 12 su 12 colture in brodo. Le colture degli stessi organismi incubate a 25 °C senza CO2 non hanno dato risultati positivi. Ulteriori studi sarebbero utili per chiarire i mezzi e le condizioni più efficaci per il recupero e l’identificazione rapida di aspergilli clinicamente importanti.

Con un rapido scotch-tape o un montaggio di tease, le teste conidiali di Aspergillus spp. possono tipicamente essere identificate. Tuttavia, una coltura su vetrino può essere necessaria quando la sporulazione è lenta o atipica. Il ritmo rapido della maggior parte dei laboratori ospedalieri impone il metodo più semplice, anche se non necessariamente il più raffinato, per eseguire la coltura su vetrino. Il classico metodo di coltura su vetrino di Riddell è stato integrato con altre tecniche meno laboriose. Un metodo rapido è semplicemente quello di spingere un vetrino coprioggetto di 18 × 18 mm con un angolo di 45 gradi in un mezzo di sporulazione, come l’agar fiocco di patate. Quando la muffa sporula, il coprioggetto viene accuratamente ritirato dall’agar e montato in una goccia di blu di lattofenolo o lattofucsina su un vetrino da microscopio. Un’altra goccia viene posta sopra il piccolo vetrino coprioggetto prima di completare il montaggio con un vetrino coprioggetto da 22 × 22 mm.

Problemi di forza lavoro

La diagnosi rapida dell’aspergillosi dipende non solo dal miglioramento della metodologia ma anche da una forza lavoro adeguata e ben formata. Le indagini sulle pratiche micologiche raccomandano fortemente una maggiore formazione. Un’enfasi particolare dovrebbe essere posta sull’identificazione accurata, sull’esame diretto, sull’uso appropriato dei media, sulla rilevanza clinica e sull’efficacia dei costi. Tuttavia, l’inadeguatezza del personale può compromettere sia la formazione che l’implementazione di procedure più clinicamente rilevanti. L’indagine ASM Benchmarking ha rivelato una carenza continua di personale per alcuni laboratori di microbiologia negli Stati Uniti. In parte, la carenza deriva da una riduzione del 53%-56% dei programmi di formazione CLS negli ultimi 12 anni. Il 34% dei professionisti che lavorano nei laboratori di microbiologia oggi hanno più di 50 anni. Saranno disponibili lavoratori più giovani per sostituirli quando andranno in pensione? Mentre quasi l’80% delle donne nella forza lavoro sono più giovani di 30 anni, solo il 10% delle lavoratrici nei laboratori di microbiologia hanno meno di 30 anni. Questi dati suggeriscono che la carenza di forza lavoro continuerà e forse si aggraverà.

Conclusione

Il miglioramento delle procedure diagnostiche tradizionali e non tradizionali per le micosi richiede sforzi simultanei per garantire una forza lavoro adeguata e per migliorare la mobilità della carriera, il riconoscimento professionale, le opportunità di formazione avanzata, la compensazione e altri fattori necessari per stimolare l’interesse per le scienze di laboratorio.

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