Tre acronimi mnemonici per ricordare gli aminoacidi

Oggi ho iniziato a rivedere il materiale del MCAT in modo che quando la scuola di medicina arriverà tra un paio di mesi, potrò partire in quarta. Non sono un fan della memorizzazione delle cose, ma ci sono alcuni posti dove non si può fare a meno. Conoscere gli aminoacidi è un buon esempio.

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Ho tre acronimi che mi aiutano a ricordare il nome di ogni aminoacido. Un paio di essi mi spingono anche a ricordare la struttura dell’aminoacido. Ogni acronimo rappresenta un gruppo di aminoacidi, e ogni gruppo è basato sul carattere elettronico della catena laterale della molecola. Notate che gli acronimi usano le abbreviazioni di una lettera degli aminoacidi:

Catene laterali non polari: “Grandma Always Visits London In May For Winston’s Party” (G, A, V, L, I, M, F, W, P)

Catene laterali polari: “Santa’s Team Crafts New Quilts Yearly” (S, T, C, N, Q, Y)

Catene laterali elettriche: “Dragons Eat Knights Riding Horses” (D, E, K, R, H)

Anche se questi strumenti possono fare al caso vostro, memorizzare gli aminoacidi richiederà comunque lavoro. Vi consiglio di procurarvi alcuni fogli di carta e di seguire questi quattro passi:

Prima di tutto, scrivete la sequenza di lettere di ogni acronimo in aree separate della pagina, lasciando spazio per disegnare ogni aminoacido. Dì l’acronimo ad alta voce a te stesso mentre vai avanti. (All’inizio, vorrai anche scrivere il nome completo e l’abbreviazione di tre lettere di ogni aminoacido. Più tardi, una volta che conosci i nomi di tutte e 20 le molecole, probabilmente sarai al sicuro scrivendo solo il codice di tre lettere.)

In secondo luogo, disegna la struttura fondamentale dell’aminoacido (il carbonio alfa, il gruppo amminico e il gruppo dell’acido carbossilico) sopra ogni lettera. Puoi mostrare questa struttura sia come proiezione di Fischer (come mostrato nell’immagine sopra) o come figura stereochimica. Ricorda che i gruppi amminico e carbossilico sono ionizzati a pH 7, così come le catene laterali elettricamente cariche.

In terzo luogo, attaccato ad ogni struttura fondamentale, disegna la catena laterale appropriata. Pensa ad alta voce mentre disegni ogni catena laterale: ti aiuterà a ricordare meglio. Fai attenzione all’ordine dell’acronimo e ai cambiamenti di struttura quando passi da una catena laterale alla successiva.

Infine, sciacqua e ripeti. Fate questo esercizio una volta al giorno per una settimana, poi una volta ogni due giorni per una settimana, e infine una o due volte alla settimana andando avanti. Più tardi, prova a disegnare le catene laterali al contrario o in ordine casuale per una sfida in più.

Ok, ora che abbiamo un piano di gioco, diamo un’occhiata più da vicino a queste sigle:

Catene laterali non polari:

“Grandma Always Visits London In May For Winston’s Party”

  1. Glicina, Gly, G
  2. Alanina, Ala, A
  3. Valina, Val, V
  4. Leucina, Leu, L
  5. Isoleucina, Ile, I
  6. Metionina, Met, M
  7. Fenilalanina, Phe, F
  8. Triptofano, Trp, W
  9. Prolina, Pro, P

Per ricordare che questa è la sigla delle catene laterali non polari, ricordate che Londra, Inghilterra, non si trova vicino ai poli terrestri. Inoltre, può essere utile associare Londra a Winston Churchill (primo ministro del Regno Unito durante la seconda guerra mondiale) e, per estensione, all’8 maggio (Giorno della Vittoria in Europa, che celebra la resa formale della Germania nazista agli alleati).

I piantagrane del gruppo non polare sono fenilalanina (F) e triptofano (W). Naturalmente, l’abbreviazione di una lettera della fenilalanina dovrebbe essere relativamente facile da ricordare perché le prime due lettere, “ph”, sono pronunciate come se fossero una “F”. Nel frattempo, un trucco per ricordare l’abbreviazione del triptofano è quello di immaginare una lettera W laterale formata da diversi legami negli anelli di cinque e sei membri della catena laterale.

Catene laterali polari:

“Santa’s Team Crafts New Quilts Yearly”

  1. Serina, Ser, S
  2. Treonina, Thr, T
  3. Cisteina, Cys, C
  4. Asparagina, Asn, N
  5. Glutamina, Gln, Q
  6. Tirosina, Tyr, Y

Per ricordare che questo è l’acronimo delle catene laterali polari, basta chiedere a un bambino di cinque anni dove vive Babbo Natale e la sua squadra di elfi – al Polo Nord, naturalmente! (Mia madre è molto appassionata di quilting e cucito, quindi mi aiuta ad associare i quilt ai regali di Natale.)

I piantagrane del gruppo polare sono asparagina (N), glutammina (Q) e tirosina (Y). Un modo per affrontare i primi due è saltare avanti al trucco per ricordare l’aspartato e il glutammato (vedi la fine di questo post per una nota su asparagina e glutammina). Nel frattempo, ricordo che la tirosina ha l’abbreviazione Y perché quella lettera è la seconda nel nome completo, e perché se la catena laterale è disegnata verso il basso, due dei legami nell’anello fenile e il legame con il gruppo idrossile possono formare una Y immaginaria.

Anche la cisteina è un po’ complicata, ma solo perché l’altro modo ufficiale di scrivere il nome, “cistina” si riferisce alla forma ossidata degli aminoacidi.

Catene laterali elettricamente cariche:

“I draghi mangiano i cavalieri a cavallo”

  1. Aspartato, Asp, D
  2. Glutammato, Glu, E
  3. Lisina, Lys, K
  4. Arginina, Arg, R
  5. Istidina, His, H

Per eliminazione, saprete che questo acronimo si riferisce al gruppo rimanente di aminoacidi. Come quei fastidiosi draghi, quasi ogni molecola qui è un piantagrane: aspartato (D), glutammato (E), lisina (K) e arginina (R).

Ci sono due trucchi alimentari che uso per ricordare l’aspartato (D) e il glutammato (E). Primo, associo il suffisso “-ate” all’idea dei draghi che mangiano. In secondo luogo, quando guardo le abbreviazioni dei due aminoacidi, “Asp” e “Glu”, penso alla frase “Aspiranti golosi”. Nel frattempo, per la lisina (K), mi ricordo solo che la L segue la K nell’alfabeto. E l’abbreviazione di una lettera dell’arginina dovrebbe essere relativamente facile da ricordare perché le prime due lettere, “ar”, si pronunciano come il nome della lettera R.

Nota su asparagina e glutammina:

Asparagina (N) e glutammina (Q) sono identiche ad aspartato (D) e glutammato (E), tranne che le prime due hanno un gruppo amminico mentre le ultime due hanno un ossigeno carico negativamente. È utile che le abbreviazioni di tre lettere per l’asparagina (N) e la glutammina (Q) siano rispettivamente Asn e Gln – il fatto che entrambi contengano la lettera “n” mi ricorda l’atomo di azoto che si trova nelle loro catene laterali amminiche.

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