カオル・イラはゲール語のCaol Ìle「アイラの音」に由来し、蒸留所がアイラとジュラの間の海峡を見下ろす位置にあることにちなんでいる（「アイラ海峡」と表記される）。 1846年、ヘクター・ヘンダーソンによって設立された。 蒸留所はうまくいかず、1854年にジュラ島蒸留所のオーナーであるノーマン・ブキャナンに引き継がれ、経営が変わった。 1863年にはウィスキー株のトレーダーであるグラスゴーのBulloch Lade & Co.によって買収された。 1871年の国勢調査によるとDuncan Johnstonが当時の支配人である。 1880年代には年間147,000インペリアル・ガロン(670,000L)のウィスキーが生産された。
1920年にBulloch Ladeは私的整理を行い、実業家のコンソーシアムがCaol Ila Distillery Company Ltdを設立。 1927年にディスティラーズ・カンパニーがカオル・イラの支配権を獲得し、1930年にはスコティッシュ・モルト・ディスティラーズ社が全株式を取得した。 第二次世界大戦中の1942年から1945年にかけては、戦時中の大麦の供給制限により蒸留所は閉鎖された。 その後1972年まで生産は続けられ、蒸留所の建物は全て取り壊された。 その後、より大きな蒸留所が建設され、ジョージ・レスリー・ダージが設計し、彼のトレードマークであるガラス張りのカーテンウォールをスチルハウスに用いた他の多くの建築様式と同じで、1974年に生産が再開された。 その後、同社はDiageoの傘下となった
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