母集団データからの近親交配推定。 Models, Procedures and Implications | Minions

Four different estimation procedures for models of population structure are comparison.集団構造のモデルに対する4つの異なる推定手順を比較した。 モデルのパラメータは等価であり、ほとんどの場合、ライトが “F統計 “と呼ぶパラメータで容易に表現できることが示された。 ヤノママ47村の9つの共優性対立遺伝子対のデータを用いて、これらのモデルのそれぞれのパラメータを推定したところ、与えられたパラメータに対する異なる推定法はすべて多かれ少なかれ同等の結果をもたらすことがわかった。

F統計はしばしば近親交配係数と等しく、ある創設集団においてユニークであるとされる対立遺伝子からの子孫による同一性の確率と定義される。 しかし,コンピュータ・シミュレーションと一般的な歴史的考察から,遺伝子型頻度からの推定値はすべて,西半球のアメリカン・インディアンの祖先集団の対立遺伝子の近親交配係数を大幅に過小評価していることが推察される。 最近の文明の出現まで優勢であった高度に細分化された部族集団では、相同な対立遺伝子の子孫による同一性の確率はおよそ0.5であったと推測される。 もし,人類の進化の時間スケールで考えると,これらの確率は文明が発達する以前の近親交配の強さからごく最近に逸脱したに過ぎないのであれば,慣習的にもっと低く見積もられている0.005から0.01で作業した場合の結果をいくつか考察してみた

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