Redwood Creekは、ギンザケ（Oncorhynchus kisutch）、沿岸性カットスロート（Oncorhynchus clarki clarki）、スチールヘッドトラウト（Oncorhynchus mykiss）に産卵・生育に不可欠な生息地で、それぞれが危急種に指定されています。 この小川はコーホーの生息地の最南端に近く、魚は一度も放流されたことがないため、独特のDNAを持っています。 レッドウッドクリークのサケは、2006年10月に連邦絶滅危惧種に、2005年6月に連邦絶滅危惧種に指定されたセントラルコーストのギンザケである。 ギンザケは、通常2年間海で過ごした後、繁殖のチャンスを得るために再び海から淡水へと移動する。 産卵のための回遊は、晩秋または冬の大雨がミュアビーチの砂州を破り、魚が上流に移動できるようになった後に始まる（通常12月から1月にかけて）。 2007-2008年の冬季遡上、および2008-2009年の冬季遡上では、サケの姿は確認されなかった。 その証拠に、若いサケが休息できる大きな木質瓦礫や深いプールが失われたため、スモルトがクリークで夏を越し、疲弊していることが指摘されている。 2009年、国立公園管理局はミュアビーチの修復を開始し、機能的で自立した生態系を作り、ビジターアクセスを向上させる予定です。 コオリカマスの寿命は3年しかないため、この介入はほとんど手遅れでした。 幸いなことに、2010年1月の時点で、3年ぶりに推定45匹のコーホーが産卵のためにレッドウッド・クリークを泳ぎ、23のレッズ（卵の塊）を形成しました。 2011年には、11匹の生きた成魚と1匹の死骸が、3つの赤礁とともに観察されましたが、これは2007年から2008年の産卵シーズンに比べてわずかに増加したものです。 州全体のギンザケの生息数は1940年代の1％で、かつて生息していた川の90％から姿を消しました。 Watershed Alliance of Marinは、2014年に産卵に帰ってきたサケがいなかったと報告し、現在この魚は局所的に絶滅しているのではないかと懸念している。 2014年にクリークで幼魚として捕獲された3匹の雄の成魚が、カリフォルニア州魚類野生生物局の作戦「coho jumpstart」の一環として3匹のオレマ・クリークの雌とともに放たれ、少なくとも後者の1匹は産卵が確認されており、レッドウッド・クリークに生存可能な産卵遡上が復活する期待が高まっている。
2003年の秋、NPSはミュアビーチのクリーク河口の1kmほど上流のバンドゥーチ遺跡復元プロジェクトの第1期を完成させた。 ユーカリの倒木を利用して人工的な丸太の詰まりを作り、制約のある堤防を壊して河道と氾濫原を再接続しました。 このプロジェクトの主な目的は、サケ科の幼魚のための飼育プールを作ることです。 また、NPSは水辺の回廊にある侵略的な外来植物を取り除き、在来種の植物に植え替えて、水辺に生息する鳥や渡り鳥の営巣地を強化しました。 2009年に始まったレッドウッドクリーク再生プロジェクトの現在の段階は、46エーカーのクリークの氾濫原を復元しようとするものです。 1850年の地図によると、現在のペリカンインまで続いていた歴史的なビッグラグーンを復元するため、3つの側水路と650フィートの蛇行した水路を新たに作ることが含まれています。 植えられた原生植物が新しい川岸に定着したら、現在の駐車場を90度回転させ、新しい水路をつなげる予定です。
この流域には、他に、キタマフクロウ (Strix occidentalis caurina) やカリフォルニア アカガエル (Rana aurora draytonii) といった貴重種が生息しています。 2009年末、NPSはGreen Gulch Farmの牧草地に池を掘削し、流域で唯一減少しつつあるカリフォルニアレッドレッグフロッグの生息地を提供した。
River otter (Lontra canadensis) は1996年にレッドウッド・クリークで発見され、スチールヘッドトラウトを食べるために毎年戻って来ている。 リバーラッコはGrinnellの1937年の「Fur-bearing Mammals of California」ではマリン郡に生息しているものとしてリストアップされていない。