Three acronym mnemonics for remembering the amino acids

Today I started reviewing material from the MCAT because when med school arrives in couple of months, I can hit the ground running.Why did this? 暗記モノはあまり好きではないのですが、しょうがないところもいくつかあります。 アミノ酸の知識はその良い例です。

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それぞれのアミノ酸の名前を覚えるために、3つの頭文字をとっています。 そのうちのいくつかは、アミノ酸の構造を思い出すよう促してもくれます。 それぞれの頭字語はアミノ酸のグループを表し、各グループは分子の側鎖の電子特性に基づいています。 なお、頭字語はアミノ酸の1文字略語を使用している:

Non-polar side chain: “Grandma Always Visits London In May For Winston’s Party” (G, A, V, L, I, M, F, W, P)

極性のある側鎖。 “Santa’s Team Crafts New Quilts Yearly” (S, T, C, N, Q, Y)

電荷を帯びた側鎖です。 “Dragons Eat Knights Riding Horses” (D, E, K, R, H)

これらのツールはあなたに合っているかもしれませんが、アミノ酸を暗記するには、やはり作業が必要でしょう。 私は、次の4つのステップを歩く数枚の紙を用意することをお勧めします。

まず、ページの別々の領域にそれぞれの頭字語の文字の並びを書き出し、各アミノ酸を描くスペースを残します。 その際、頭文字を声に出して言ってみてください。 (最初はアミノ酸の正式名称と3文字の略称も書いておくとよいでしょう。

次に、各文字の上にアミノ酸の基本構造(α炭素、アミノ基、カルボン酸基)を描きます。 この構造は、フィッシャー投影図(上の画像のように)でも立体化学図でもどちらでも構いません。 アミノ基とカルボキシル基は pH7 でイオン化し、電荷を帯びた側鎖もイオン化することを忘れないでください。

第三に、それぞれの基本構造について、適切な側鎖を描いてください。 それぞれの側鎖を描くときに、声に出して考えてみてください。 頭文字の順番と、側鎖から次の側鎖に移るときの構造の変化に注意してください。

最後に、すすぎと繰り返しを行います。 このエクササイズを 1 日 1 回、1 週間行い、次に 1 日おきに 1 回、1 週間行い、最後に週に 1 回または 2 回、今後行います。 その後、サイドチェーンを逆から描いたり、ランダムな順番で描いたりして、さらにチャレンジしてみてください。

さて、ゲームプランができたところで、これらの頭字語について詳しく見ていきましょう:

Non-polar side chains:

“Grandma Always Visits London In May For Winston’s Party”

  1. Glycine, Gly, G
  2. Alanine, Ala, A
  3. Valine, Val, V
  4. Leucine, Leu, L
  5. Isoleucine, Ile, I
  6. Methionine, Met.A
  7. Leu, L Ile, I
  8. Methionine, Leu, L Isoleucine, Ile, L
  9. Methionine, Met.A M
  10. Phenylalanine, Phe, F
  11. Tryptophan, Trp, W
  12. Proline, Pro, P

これが非極性側鎖の頭文字であることを思い出すには、イギリスのロンドンが地球の極の近くに位置していないことを思い出すと良い。 また、ロンドンといえば、ウィンストン・チャーチル(第二次世界大戦中のイギリス首相)、ひいては5月8日(ナチス・ドイツの連合国への正式降伏を祝うヨーロッパ戦勝記念日)を連想するのもよいでしょう。

非極性グループの問題児はフェニルアラニン(F)とトリプトファン(W)です。 もちろん、フェニルアラニンの1文字略語は、最初の2文字「ph」を「F」のように発音するので、比較的容易に思い出すことができるはずです。 一方、トリプトファンの略称を覚えるコツは、側鎖が結合した5員環と6員環の結合がいくつか集まってできた横文字のWを想像することである。

極性のある側鎖。

“Santa’s Team Crafts New Quilts Yearly”

  1. Serine, Ser, S
  2. Threonine, Thr, T
  3. Cysteine, Cys, C
  4. Asparagine, Asn, N
  5. Glutamine, Gln.S
  6. Assign, N
  7. Cysteine, N
  8. Glutamine, N

  9. Cysteine, N
  10. Threee, N
  11. Threee, N Q
  12. Tyrosine, Tyr, Y

これが極性側鎖の頭文字であることを覚えるには、5歳の子供にサンタと妖精たちの住む場所を聞けばいい–もちろん、北極だ!(笑)。 (私の母はキルトや裁縫が好きなので、キルトとクリスマスプレゼントを結びつけるのに役立っています)

極性グループの問題児は、アスパラギン(N)、グルタミン(Q)、チロシン(Y)です。 最初の2つについては、アスパラギン酸やグルタミン酸を覚えるコツ(アスパラギンとグルタミンについては、この記事の最後を参照)を飛ばして対処するのも1つの方法でしょう。 一方、チロシンがYという略語を持つのは、その文字が正式名称の2番目であることと、側鎖を下向きに描くと、フェニル環の2つの結合と水酸基との結合が想像上のYを形成することができるからだと覚えています。

システインも少し厄介ですが、名前のもう一つの正式表記法「シスチン」が、アミノ酸の酸化型を指しているからにすぎないのです。

電気を帯びた側鎖。

“Dragons Eat Knights Riding Horses”

  1. Aspartate, Asp, D
  2. Glutamate, Glu, E
  3. Lysine, Lys, K
  4. Arginine.A
  5. Asp, Glu, D
  6. Lys, K
  7. Glutamate, Glu, E Arg, R
  8. Histidine, His, H

消去法で、この頭文字が残りのアミノ酸群を指すことがわかるだろう。 アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、リジン(K)、アルギニン(R)です。

私がアスパラギン酸(D)とグルタミン酸(E)を覚えるのに、食事をテーマにしたトリックが 2 つあります。 まず、「-ate」という接尾語から「龍が食べる」というイメージを連想します。 次に、2つのアミノ酸の略称である「Asp」と「Glu」を見て、「Aspiring Gluttons」というフレーズを思い浮かべるのです。 一方、リジン(K)については、アルファベットでKの次にLがあることを思い出すだけだ。 また、アルギニンの1文字略語は、最初の2文字「ar」の発音がRの名前と同じなので、比較的思い出しやすいはずです。

アスパラギンとグルタミンについてのメモ:

アスパラギン(N)とグルタミン(Q)は、前2者がアミノ基を持っており、後2者は負電荷の酸素を持っていること以外はアスパルテート(D)とグルタミン酸(E)と同じものです。 アスパラギン(N)とグルタミン(Q)の3文字略号がそれぞれAsnとGlnであるのは、どちらも「n」を含んでいることが、アミノ基の側鎖にある窒素原子を連想させるからである

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