Se comparan cuatro procedimientos diferentes de estimación de modelos de estructura poblacional. Se demuestra que los parámetros de los modelos son equivalentes y, en la mayoría de los casos, se expresan fácilmente en términos de los parámetros que Wright llama «F-statistics». Hemos estimado los parámetros de cada uno de estos modelos con datos sobre nueve pares de alelos codominantes en 47 aldeas yanomama, y encontramos que los diferentes estimadores para un parámetro dado arrojan todos resultados más o menos equivalentes.
Los estadísticos F suelen equipararse a los coeficientes de endogamia que se definen como la probabilidad de identidad por descendencia a partir de alelos que se consideran únicos en alguna población fundadora. Sin embargo, la simulación informática y las consideraciones históricas generales nos llevan a inferir que todas las estimaciones de las frecuencias genotípicas subestiman en gran medida el coeficiente de endogamia para los alelos de la población fundadora de los indios americanos en el hemisferio occidental. Suponemos que en las poblaciones tribales altamente subdivididas que prevalecieron hasta el reciente advenimiento de la civilización, la probabilidad de identidad por descendencia para los alelos homólogos era aproximadamente de 0,5. Consideramos algunas consecuencias de trabajar con las estimaciones habituales, mucho más bajas -0,005 a 0,01- si, en la escala temporal de la evolución humana, éstas representan sólo un cambio muy reciente de la intensidad de la endogamia que prevalecía antes de la civilización.