Agaroză

Pudre de agaroză și geluri prefabricate

Bio-Rad oferă o varietate de pulberi de agaroză și geluri de agaroză prefabricate pentru a satisface toate nevoile dumneavoastră pentru electroforeza ADN și ARN, inclusiv electroforeza pe gel în câmp pulsatoriu și aplicații speciale, cum ar fi IEP și IEF. Pulberile sunt agaroză ADN testată genetic și de calitate certificată. Gelurile noastre prefabricate sunt disponibile atât în tampon TBE, cât și în tampon TAE, cu sau fără bromură de etidiu.

Tipuri de agaroză și utilizări în electroforeză

Toate produsele de agaroză Bio-Rad sunt garantate ca fiind lipsite de inhibitori, DNaze și RNaze. Există o gamă de tipuri de agaroză care au fost optimizate pentru diferite utilizări.

Agaroză pentru biologie moleculară: Aceasta este o agaroză de uz general care are o limită de excludere ridicată. Acest tip de agaroză are o rezistență ridicată a gelului și este ușor de manipulat la procente mici. Agaroza pentru biologie moleculară este de calitate GQT (calitate genetică testată), ceea ce o face ideală pentru gelurile pregătitoare și recuperarea ADN-ului. Separarea analitică este de >1.000 de perechi de baze (bp).

Agaroză cu topire redusă: Utilizarea principală a agarozei cu topire redusă este pentru electroforeza pregătitoare. Este ideală pentru aplicații în gel, cum ar fi ligatura, PCR, digestia cu enzime de restricție, transformarea și secvențierea. Alte aplicații includ electroforeza în câmp pulsat a ADN-ului megabazei și înglobarea cromozomilor. Această agaroză are o temperatură de gelifiere de 26°C și o capacitate de rezolvare ridicată, >1.000 kb.

Agaroza low-melt este, de asemenea, utilizată pentru a fixa benzile de gradient de pH imobilizat (IPG) pentru focalizarea izoelectrică, a doua dimensiune a SDS-PAGE 2-D. Această agaroză conține albastru de bromofenol pentru monitorizarea electroforezei.

AgarozăPCR: Această agaroză de înaltă rezistență formează geluri care sunt ușor de manevrat și rămân flexibile chiar și la procente mari de gel, reducând riscul de crăpare sau rupere. Temperatura de gelifiere este de 40°C. Această agaroză are proprietăți excelente de cernere și cea mai mare rezistență a gelului dintre toate agarozele.

Agaroza cu grad scăzut de topire PCR are o capacitate mare de cernere. Este ideală pentru electroforeza preparatorie și aplicațiile în gel, cum ar fi digestia enzimelor de restricție, ligatura și transformarea. Agaroza PCR este recomandată pentru fragmente de ADN <1.000 bp.

Agaroză ultrafină de gamă joasă: Această agaroză asigură rezoluția primerilor și a produselor PCR de mici dimensiuni la concentrații mai mici decât agaroza standard, evitând necesitatea de a utiliza poliacrilamidă. Un gel de 3% rezolvă clar un ladder de 10 bp. Separarea analitică este de 20-800 bp.

Agaroză de megabază: Această agaroză are o rezistență foarte mare a gelului, o mobilitate electroforetică ridicată și o limită de excludere ridicată. Agaroza megabază este cea mai bună alegere pentru aplicațiile de electroforeză în câmp electric omogen fixat (CHEF) și de electroforeză în gel cu inversiune de câmp (FIGE). Gelurile rămân ușor de manevrat la concentrații de până la 0,3% și permit timpi de execuție mai scurți. De asemenea, colorarea de fond scăzută asigură o imagistică superioară a ADN-ului cu greutate moleculară mare. Intervalul de separare este cuprins între 1 kb și 5 Mb.

Agaroză cu câmp pulsat: Electroforeza în gel în câmp pulsat (PFGE) este utilizată pentru separarea fragmentelor mari de ADN. Deși gelurile turnate cu această agaroză au timpi de execuție PFGE mai lungi decât cu agaroza megabazică, condițiile de execuție pentru această agaroză reprezintă un protocol prestabilit, selectabil, pentru autoalgoritmul sistemului CHEF Mapper® XA. Intervalul de separare este de la 1 kb la 2 Mb.

Agaroză pentru IEP și IEF: Agarozele sunt disponibile pentru imunoelectroforeză (IEP) și focalizare izoelectrică (IEF). Acestea pot fi utilizate pentru determinarea greutăților moleculare relative (Mr). Agaroza pentru IEF nu are electroendosmoză detectabilă.

Geluri de agaroză prefabricate

Gelurile de agaroză prefabricate au mai multe avantaje, pe lângă viteză și reproductibilitate. Tava de blocare înseamnă că gelurile de agaroză nu se mișcă în timpul încărcării și la începutul unei serii, ceea ce poate risipi proba, poate da sarcini inegale și poate scădea claritatea benzilor. Tava transparentă la UV are godeuri fluorescente numerotate care ajută la urmărirea modelelor de încărcare atunci când există multe probe, precum și o riglă fluorescentă pe o latură pentru măsurarea migrației.

Este disponibilă o mare varietate de geluri, 1 și 3% agaroză, TBE și TAE, și cu și fără bromură de etidiu. Configurațiile godeurilor se potrivesc nevoilor, de la cele pregătitoare până la screeningul unui număr mare de probe (până la patru rânduri de godeuri). Uniformitatea face ca gelurile de agaroză prefabricate să fie ușor de încărcat cu o pipetă multicanal.

Gelurile de agaroză prefabricate asigură o separare și o rezoluție excelentă a ADN-ului și sunt compatibile cu majoritatea sistemelor de electroforeză orizontală submarină.

Mai multe informații despre agaroză

Agaroza este o polizaharidă liniară formată din unități repetitive de agaroboză care este extrasă din alge roșii fierte. Sarcina sa neutră, temperatura scăzută de gelificare și formarea de geluri stabile cu pori de dimensiuni mari fac din agaroză un mediu bun pentru electroforeză și cromatografie. Gelurile de agaroză sunt ușor și rapid de preparat și pot separa fragmente de ADN de la aproximativ 20 bp la multe megabaze. Perlele de agaroză sunt utilizate pe scară largă pentru cromatografia pe coloană, în special în cromatografia de excludere a dimensiunii și de afinitate.

.