Deși imagistica celulelor vii este de dorit, aceasta nu este întotdeauna fezabilă și, în multe situații, celulele sunt fixate pentru a oferi o „fotografie” a naturii și distribuției moleculelor în interiorul unei celule, minimizând în același timp modificările cauzate de mișcarea celulelor, degradarea probei etc. Există o gamă largă de metode de fixare disponibile, care acționează prin diferite mecanisme și asupra diferitelor componente celulare. Fiecare metodă are avantaje și dezavantaje, iar alegerea metodei de fixare pentru un anumit experiment trebuie să țină cont de acești factori. Aici am folosit imagistica spectroscopică Raman a celulelor vii și am comparat-o cu celulele conservate cu aldehide sau cu metode de fixare pe bază de solvenți organici pentru a evalua modificările chimice induse de fiecare fixator și impactul acestora asupra calității imaginilor care pot fi obținute din celulele fixate. În general, metodele de fixare cu aldehide au funcționat semnificativ mai bine decât cele cu solvenți organici, cu pierderi mai puțin severe de informații biochimice. Fixativele pe bază de aldehide prezintă un conținut biochimic modificat al celulelor, atribuit formării de adaosuri, dar acest lucru poate fi redus la minimum prin optimizarea temperaturii de fixare sau prin eliminarea formării de adaosuri prin tratamente de permeabilizare pe bază de detergenți ca o a doua etapă (cu prețul pierderii altor informații biochimice). Rezultatele au arătat că, pe de altă parte, solvenții organici duc la o pierdere severă a conținutului celular, atribuită pierderii integrității membranei după îndepărtarea lipidelor. În plus, fixarea cu aldehide înainte de permeabilizarea cu solvenți organici nu asigură o protecție adecvată a conținutului citoplasmatic. Utilizarea imagisticii Raman este ideală pentru compararea grupurilor de celule din punct de vedere al conținutului lor molecular, iar rezultatele arată că metodele de fixare cu aldehide sunt preferabile pentru studiile în care conținutul molecular global al probelor este important. Deși nu există o metodă de fixare universală pentru fiecare aplicație, rezultatele de aici ne permit să oferim câteva principii generale: în cazul în care este importantă similitudinea spectrală cu celulele vii, este preferabilă fixarea cu paraformaldehidă la temperatura camerei, cu prețul unor sângerări și al formării de vacuole. În cazul în care este importantă conservarea structurii celulare sau a distribuției biomoleculare, un amestec de paraformaldehidă și glutaraldehidă ar fi mai potrivit, dar cu prețul unor modificări ale profilului spectral, în special în benzile legate de ADN.
.