DIME (Differential Identification using Mixtures Ensemble)
O metodă robustă de identificare diferențială care ia în considerare un ansamblu de modele de amestecuri finite combinate cu o rată de descoperire falsă (fdr) locală pentru analiza datelor ChIP-seq care compară două probe. Acest pachet poate fi, de asemenea, utilizat pentru a identifica diferențialulîn alte date de mare randament, cum ar fi microarray, metilare etc. După normalizare, un amestec Exponential-Normal(k) sau Uniform-Normal(k) este ajustat la date. Componenta (k)-normală poate reprezenta fie regiuni diferențiale, fie regiuni nediferențiale, în funcție de localizarea și răspândirea lor. Componenta exponențială sau uniformă reprezintă locații diferențiale. locale (fdr) sunt calculate din modelul ajustat. caracteristici unice ale pachetului:
- Utilizarea ansamblului de modele de amesteccare permite ca datele să fie reprezentate precis & eficient. Apoi, selecția în două faze asigură selectarea celui mai bun model general.
- Această metodă poate fi folosită ca un program general pentru a ajusta un amestec de modele uniform-normal sau uniform-k-normal sau exponențial-k-normal
.