Mykoplasma är de minsta fritt levande mikroorganismerna, med en diameter på cirka 300 nm. De avgränsas av ett treskiktat membran och har till skillnad från konventionella bakterier ingen styv cellvägg. Därför är de inte mottagliga för penicilliner och andra antibiotika som verkar på denna struktur. De är dock mottagliga för en rad andra bredspektrumantibiotika, varav de flesta endast hämmar deras förökning och inte dödar dem. Tetracyklinerna har alltid legat i framkant när det gäller antibiotikaanvändning, särskilt för infektioner i könsorganen, men makrolider används också i stor utsträckning för infektioner i luftvägarna. I jämförelse med tetracyklinerna har erytromycin, de nyare makroliderna, ketoliderna och de nyare kinolonerna samma eller ibland större aktivitet. De två sistnämnda antibiotikagrupperna har också en viss cidal aktivitet. Antibiotikakänslighetsprofiler för flera mykoplasmer av mänskligt ursprung presenteras, och de för Mycoplasma pneumoniae och Mycoplasma genitalium är likartade. Förutom penicillinerna är mykoplasma naturligt resistenta mot vissa andra antibiotika, t.ex. rifampicinerna. Dessutom kan vissa utveckla resistens, antingen genom genmutation eller genom förvärv av en resistensgen, mot antibiotika som de vanligtvis är känsliga för. Mykoplasmernas resistens mot tetracykliner är vanlig och beror på förvärv av tetM-genen. Mönstret för antibiotikakänslighet kan i hög grad påverkas av mykoplasmakällan, t.ex. kan en mykoplasma som återfunnits från en kontaminerad eukaryotisk cellkultur som utsatts för omfattande antibiotikabehandling ha en antibiotikaprofil som skiljer sig mycket från samma mykoplasmaart som återfunnits direkt från en mänsklig eller animalisk källa. Det kan vara svårt att utrota mykoplasma från människor eller djur eller från cellkulturer genom antibiotikabehandling på grund av resistens mot antibiotikan, eller på grund av att det saknar cidal aktivitet, eller på grund av att vissa mykoplasma invaderar eukaryota celler. Utrotning kan vara särskilt svår hos immunsupprimerade eller immunbristande individer, särskilt de som är hypogammaglobulinaemiska. De behandlingsmetoder som sannolikt är mest effektiva vid behandling av mykoplasmainfektioner i luftvägarna eller i urin- och urinvägarna presenteras.