I dag började jag gå igenom material från MCAT så att jag kan komma igång när läkarutbildningen börjar om ett par månader. Jag är inget fan av att memorera saker, men det finns några ställen där det inte kan hjälpas. Att kunna aminosyrorna är ett bra exempel.
Jag har tre akronymer som hjälper mig att komma ihåg namnet på varje aminosyra. Ett par av dem får mig också att minnas aminosyrans struktur. Varje akronym representerar en grupp av aminosyror, och varje grupp är baserad på elektronkaraktären i molekylens sidokedja. Observera att akronymerna använder aminosyrornas enbokstavsförkortningar:
Nonpolära sidokedjor: (G, A, V, L, L, I, M, F, W, P)
Polära sidokedjor: Polära sidokedjor: De är en av följande: ”Mormor besöker alltid London i maj för Winstons fest” (G, A, V, L, I, M, F, W, P): ”Santa’s Team Crafts New Quilts Yearly” (S, T, C, N, Q, Y)
Elektriskt laddade sidokedjor: ”Dragons Eat Knights Riding Horses” (D, E, K, R, H)
Trots att dessa verktyg kan passa dig, kommer det ändå att krävas arbete för att memorera aminosyrorna. Jag rekommenderar att du skaffar några pappersark och går igenom dessa fyra steg:
Först skriver du ner bokstavsföljden för varje akronym i separata områden på sidan och lämnar utrymme för att rita varje aminosyra. Säg akronymen högt för dig själv under tiden. (Till en början vill du också skriva ner det fullständiga namnet och förkortningen på tre bokstäver för varje aminosyra. Senare, när du känner till namnen på alla 20 molekyler, kommer du förmodligen att vara säker på att bara skriva trebokstavskoden.)
För det andra ritar du aminosyrans grundläggande struktur (alfakolet, aminogruppen och karboxylsugruppen) ovanför varje bokstav. Du kan antingen visa denna struktur som antingen en Fischer-projektion (som i bilden ovan) eller som en stereokemisk figur. Kom ihåg att amino- och karboxylgrupperna är joniserade vid pH 7, liksom de elektriskt laddade sidokedjorna.
För det tredje, fäst vid varje grundläggande struktur, rita in den lämpliga sidokedjan. Tänk högt när du ritar varje sidokedja – det hjälper dig att komma ihåg bättre. Var uppmärksam på akronymens ordning och förändringarna i strukturen när du går från en sidokedja till nästa.
Till sist, skölj och upprepa. Gör den här övningen en gång om dagen i en vecka, sedan en gång varannan dag i en vecka och slutligen en eller två gånger i veckan framöver. Försök senare att rita sidokedjorna i omvänd eller slumpmässig ordning för att få en extra utmaning.
Okej, nu när vi har en spelplan, låt oss ta en närmare titt på dessa akronymer:
Nonpolära sidokedjor:
”Farmor besöker alltid London i maj för Winstons fest”
- Glycin, Gly, G
- Alanin, Ala, A
- Valin, Val, V
- Leucin, Leu, L
- Isoleucin, Ile, I
- Methionin, Met, M
- Fenylalanin, Phe, F
- Tryptofan, Trp, W
- Prolin, Pro, P
För att komma ihåg att detta är akronymen för opolära sidokedjor, bör man erinra sig att London, England, inte ligger nära jordens poler. Det kan också hjälpa dig att associera London med Winston Churchill (Storbritanniens premiärminister under andra världskriget) och, i förlängningen, med den 8 maj (dagen för segern i Europa, som firar Nazitysklands formella kapitulation till de allierade).
Svårigheterna i den opolära gruppen är fenylalanin (F) och tryptofan (W). Fenylalanins förkortning på en bokstav borde naturligtvis vara relativt lätt att komma ihåg eftersom de två första bokstäverna, ”ph”, uttalas som om de vore ett ”F”. Ett knep för att komma ihåg tryptofans förkortning är att föreställa sig en sidledes bokstav W som bildas av flera av bindningarna i sidokedjans sammanfogade fem- och sexdelade ringar.
Polära sidokedjor:
”Santa’s Team Crafts New Quilts Yearly”
- Serin, Ser, S
- Threonin, Thr, T
- Cystein, Cys, C
- Asparagin, Asn, N
- Glutamin, Gln, Q
- Tyrosin, Tyr, Y
För att komma ihåg att detta är akronymen för polära sidokedjor räcker det att fråga en femåring var jultomten och hans team av älvor bor – på Nordpolen, förstås! (Min mamma gillar verkligen att quilta och sy, så det hjälper mig att associera quiltar med julklappar.)
Som problemmakare i den polära gruppen kan nämnas asparagin (N), glutamin (Q) och tyrosin (Y). Ett sätt att hantera de två första är att hoppa vidare till tricket för att komma ihåg aspartat och glutamat (se slutet av det här inlägget för en anmärkning om asparagin och glutamin). Under tiden kommer jag ihåg att tyrosin har förkortningen Y eftersom den bokstaven är den andra i det fullständiga namnet, och eftersom om sidokedjan ritas nedåt kan två av bindningarna i fenylringen och bindningen med hydroxylgruppen bilda ett tänkt Y.
Cystein är också lite knepigt, men bara för att det andra officiella sättet att stava namnet, ”cystin”, hänvisar till aminosyrornas oxiderade form.
Elektriskt laddade sidokedjor:
”Dragons Eat Knights Riding Horses”
- Aspartat, Asp, D
- Glutamat, Glu, E
- Lysin, Lys, K
- Arginin, Arg, R
- Histidin, His, H
Med hjälp av elimineringsprocessen vet du att denna akronym hänvisar till den återstående gruppen av aminosyror. Liksom dessa irriterande drakar är nästan varje molekyl här en bråkmakare: aspartat (D), glutamat (E), lysin (K) och arginin (R).
Det finns två knep med mat-tema som jag använder för att komma ihåg aspartat (D) och glutamat (E). För det första associerar jag suffixet ”-ate” med tanken på att drakar äter. För det andra, när jag tittar på de två aminosyrornas förkortningar, ”Asp” och ”Glu”, tänker jag på frasen ”Aspiring Gluttons”. När det gäller lysin (K) kommer jag bara ihåg att L följer efter K i alfabetet. Och arginins förkortning på en bokstav borde vara relativt lätt att komma ihåg eftersom de två första bokstäverna, ”ar”, uttalas som namnet på bokstaven R.
Notis om asparagin och glutamin:
Asparagin (N) och glutamin (Q) är identiska med aspartat (D) och glutamat (E), med undantag för att de två förstnämnda har en aminogrupp där de två sistnämnda har ett negativt laddat syre. Det är bra att förkortningarna på tre bokstäver för asparagin (N) och glutamin (Q) är Asn respektive Gln – det faktum att båda innehåller bokstaven ”n” påminner mig om den kväveatom som finns i deras aminosidekedjor.