Floran på Blue Ridge Parkway är mångfacetterad av flera anledningar, t.ex. klimatvariationer, stor nord-sydlig geografisk utbredning, varierande geologiskt underlag och många olika mikrohabitat. På grund av de stora höjdskillnaderna från höga toppar till låga dalar kan parkbesökaren njuta av ett enormt utbud av vilda blommor och blommande buskar under vår-, sommar- och höstmånaderna. Medan sommarens vilda blommor blommar i dalarna har de spektakulära vårblommorna precis börjat blomma på de höga topparna.
Blue Ridge Parkway är unik eftersom den täcker ett brett spektrum av livsmiljöer längs den nord-sydliga axeln i Appalacherna, så att floran på en bergstopp i parkens norra ände kan vara helt annorlunda än floran på en bergstopp i parkens södra ände. Vissa av dessa livsmiljöer är exceptionellt sällsynta i regionen och några är till och med globalt sällsynta. Ett exempel är klippor på hög höjd som innehåller en ömtålig grupp alpina arter som under istiden trängdes söderut och så småningom strandsattes på de södra bergen. Det största hotet mot detta ömtåliga växtsamhälle är trampande av ovetande parkbesökare. En annan unik livsmiljö är de gräsbevuxna kalarna som troligen betades av inhemska djur som bison och älg, men som nu underhålls av parkens biologer.
.