Agarosa

Polvos de agarosa y geles prefabricados

Bio-Rad ofrece una variedad de polvos de agarosa y geles de agarosa prefabricados para satisfacer todas sus necesidades de electroforesis de ADN y ARN, incluyendo la electroforesis en gel de campo pulsado y aplicaciones especiales como IEP e IEF. Los polvos son agarosa de ADN de calidad genética certificada. Nuestros geles prefabricados están disponibles en tampón TBE o TAE, con o sin bromuro de etidio.

Tipos de agarosa y usos en electroforesis

Todos los productos de agarosa de Bio-Rad están garantizados como libres de inhibidores, DNasas y RNasas. Existe una gama de tipos de agarosa que han sido optimizados para diferentes usos.

Agarosa para biología molecular: Es una agarosa de uso general que tiene un alto límite de exclusión. Este tipo de agarosa tiene una alta resistencia de gel y es fácil de manejar en porcentajes bajos. La agarosa de biología molecular es de grado GQT (genetic quality tested), lo que la hace ideal para geles preparativos y recuperación de ADN. La separación analítica es de >1.000 pares de bases (pb).

Agarosa de baja fusión: El principal uso de la agarosa de baja fusión es para la electroforesis preparativa. Es ideal para aplicaciones en gel como la ligadura, la PCR, la digestión con enzimas de restricción, la transformación y la secuenciación. Otras aplicaciones incluyen la electroforesis de campo pulsado de ADN megabase y la incrustación de cromosomas. Esta agarosa tiene una temperatura de gelificación de 26°C y una alta capacidad de resolución, >1.000 kb.

La agarosa de baja fusión también se utiliza para asegurar las tiras de gradiente de pH inmovilizado (IPG) para el enfoque isoeléctrico, la segunda dimensión del SDS-PAGE 2-D. Esta agarosa contiene azul de bromofenol para controlar la electroforesis.

Agarosa para PCR: Esta agarosa de alta resistencia forma geles que son fáciles de manipular y permanecen flexibles incluso a altos porcentajes de gel, reduciendo el riesgo de agrietamiento o rotura. La temperatura de gelificación es de 40°C. Esta agarosa tiene excelentes propiedades de tamizado y la mayor resistencia de gel de todas las agarosas.

La agarosa de baja fusión para PCR tiene una gran capacidad de tamizado. Es ideal para la electroforesis preparativa y las aplicaciones en gel, como las digestiones con enzimas de restricción, la ligadura y la transformación. Las agarosas para PCR se recomiendan para fragmentos de ADN <1.000 pb.

Agarosa ultra de baja gama: Esta agarosa proporciona la resolución de los cebadores y de los productos de PCR pequeños a concentraciones más bajas que la agarosa estándar, evitando la necesidad de utilizar poliacrilamida. Un gel al 3% resuelve claramente una escalera de 10 pb. La separación analítica es de 20-800 pb.

Agarosa megabase: Esta agarosa tiene una fuerza de gel muy alta, una alta movilidad electroforética y un alto límite de exclusión. La agarosa megabase es la mejor opción para aplicaciones de electroforesis de campo eléctrico homogéneo (CHEF) y de inversión de campo (FIGE). Los geles son fáciles de manejar a concentraciones tan bajas como el 0,3% y permiten tiempos de ejecución más cortos. La baja tinción de fondo también proporciona una imagen superior del ADN de alto peso molecular. El rango de separación está entre 1 kb y 5 Mb.

Agarosa de campo pulsado: La electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE) se utiliza para la separación de grandes fragmentos de ADN. Aunque los geles fundidos con esta agarosa tienen tiempos de ejecución de PFGE más largos que con la agarosa megabase, las condiciones de ejecución para esta agarosa son un protocolo preestablecido y seleccionable para el autoalgoritmo del sistema CHEF Mapper® XA. El rango de separación es de 1 kb a 2 Mb.

Agarosa para IEP e IEF: Las agarosas están disponibles para la inmunoelectroforesis (IEP) y el enfoque isoeléctrico (IEF). Pueden utilizarse para determinar los pesos moleculares relativos (Mr). La agarosa para IEF no tiene electroendosmosis detectable.

Geles de agarosa prefabricados

Los geles de agarosa prefabricados tienen varias ventajas, además de la velocidad y la reproducibilidad. La bandeja de bloqueo significa que los geles de agarosa no se mueven durante la carga y al principio de una corrida, lo que puede desperdiciar muestra, dar cargas desiguales y disminuir la nitidez de las bandas. La bandeja transparente a la luz ultravioleta tiene pozos numerados fluorescentes que ayudan a seguir los patrones de carga cuando hay muchas muestras, así como una regla fluorescente en uno de los lados para medir la migración.

Se dispone de una amplia variedad de geles, de agarosa al 1 y al 3%, TBE y TAE, y con y sin bromuro de etidio. Las configuraciones de los pocillos se adaptan a las necesidades, desde la preparación hasta el cribado de un gran número de muestras (hasta cuatro filas de pocillos). La uniformidad hace que los geles de agarosa prefabricados sean fáciles de cargar con una pipeta multicanal.

Los geles de agarosa prefabricados proporcionan una excelente separación y resolución del ADN, y son compatibles con la mayoría de los sistemas de electroforesis horizontal submarina.

Más información sobre la agarosa

La agarosa es un polisacárido lineal formado por unidades repetidas de agarobiosa que se extrae de algas rojas hervidas. Su carga neutra, su baja temperatura de gelificación y la formación de geles estables con grandes tamaños de poro hacen de la agarosa un buen medio para la electroforesis y la cromatografía. Los geles de agarosa son fáciles y rápidos de preparar, y pueden separar fragmentos de ADN que van desde unos 20 pb hasta muchas megabases. Las perlas de agarosa se utilizan ampliamente para la cromatografía en columna, especialmente en la exclusión por tamaño y la cromatografía de afinidad.