Agaroza

Proszki agarozy i prefabrykowane żele

Bio-Rad oferuje różne proszki agarozy i prefabrykowane żele agarozowe, aby spełnić wszystkie Twoje potrzeby w zakresie elektroforezy DNA i RNA, w tym elektroforezy żelowej w polu impulsowym i zastosowań specjalnych, takich jak IEP i IEF. Proszki są certyfikowanymi genetycznymi testami jakości agarozy DNA. Nasze żele prefabrykowane są dostępne w buforze TBE lub TAE, z lub bez bromku etydyny.

Rodzaje i zastosowania agarozy w elektroforezie

Wszystkie produkty agarozowe Bio-Rad są wolne od inhibitorów, DNaz i RNaz. Istnieje szereg rodzajów agarozy, które zostały zoptymalizowane do różnych zastosowań.

Agaroza do biologii molekularnej: Jest to agaroza ogólnego przeznaczenia, która ma wysoki limit wykluczania. Ten rodzaj agarozy ma wysoką wytrzymałość żelu i jest łatwy w obróbce przy niskich procentach. Agaroza do biologii molekularnej ma klasę GQT (genetic quality tested), co czyni ją idealną do żeli preparatywnych i odzyskiwania DNA. Separacja analityczna wynosi >1 000 par zasad (bp).

Agaroza niskotopliwa: Głównym zastosowaniem agarozy niskotopliwej jest elektroforeza preparatywna. Jest ona idealna do zastosowań w żelu, takich jak ligacja, PCR, trawienie enzymami restrykcyjnymi, transformacja i sekwencjonowanie. Inne zastosowania obejmują elektroforezę polem pulsacyjnym megabaz DNA i osadzanie chromosomów. Agaroza ta ma temperaturę żelowania 26°C i wysoką zdolność rozdzielczą, >1000 kb.

Agaroza niskotopliwa jest również używana do zabezpieczania pasków z unieruchomionym gradientem pH (IPG) do ogniskowania izoelektrycznego, drugiego wymiaru 2-D SDS-PAGE. Agaroza ta zawiera błękit bromofenolowy do monitorowania elektroforezy.

Agaroza PCR: Ta agaroza o wysokiej wytrzymałości tworzy żele, które są łatwe w obsłudze i pozostają elastyczne nawet przy wysokich procentach żelu, zmniejszając ryzyko pękania lub łamania. Temperatura żelowania wynosi 40°C. Ta agaroza ma doskonałe właściwości przesiewania i najwyższą wytrzymałość żelu spośród wszystkich agaroz.

PCR niskotopliwa agaroza ma wysoką zdolność przesiewania. Jest idealna do elektroforezy preparatywnej i zastosowań wewnątrzżelowych, takich jak trawienie enzymami restrykcyjnymi, ligacja i transformacja. Agarozy PCR są zalecane dla fragmentów DNA <1000 bp.

Agaroza ultra o niskim zakresie: Agaroza ta zapewnia rozdzielczość primerów i małych produktów PCR przy niższych stężeniach niż standardowa agaroza, unikając konieczności stosowania poliakrylamidu. Żel o stężeniu 3% wyraźnie rozdziela drabinkę 10 bp. Separacja analityczna wynosi 20-800 bp.

Megabazowa agaroza: Ta agaroza ma bardzo wysoką wytrzymałość żelu, wysoką ruchliwość elektroforetyczną i wysoką granicę wykluczenia. Agaroza megabazowa jest najlepszym wyborem dla aplikacji elektroforezy żelowej z zaciskanym jednorodnym polem elektrycznym (CHEF) i elektroforezy żelowej z odwróconym polem (FIGE). Żele pozostają łatwe w obsłudze przy stężeniach tak niskich jak 0,3% i pozwalają na skrócenie czasu przebiegu. Barwienie na niskim poziomie tła zapewnia również doskonałe obrazowanie DNA o wysokiej masie cząsteczkowej. Zakres separacji wynosi od 1 kb do 5 Mb.

Agaroza z polem pulsacyjnym: Pulsed field gel electrophoresis (PFGE) jest stosowana do rozdzielania dużych fragmentów DNA. Chociaż żele z tą agarozą mają dłuższy czas przebiegu PFGE niż z agarozą megabazową, warunki przebiegu dla tej agarozy są wstępnie ustawionym, wybieralnym protokołem dla automatycznego algorytmu systemu CHEF Mapper® XA. Zakres separacji wynosi od 1 kb do 2 Mb.

Agaroza do IEP i IEF: Agarozy są dostępne do immunoelektroforezy (IEP) i ogniskowania izoelektrycznego (IEF). Mogą one być używane do określania względnych mas cząsteczkowych (Mr). Agaroza do IEF nie ma wykrywalnej elektroendosmozy.

Prefabrykowane żele agarozowe

Prefabrykowane żele agarozowe mają kilka zalet, oprócz szybkości i odtwarzalności. Taca blokująca oznacza, że żele agarozowe nie przesuwają się podczas ładowania i na początku przebiegu, co może powodować marnowanie próbki, nierównomierne obciążenie i zmniejszenie ostrości pasm. Przezroczysta w świetle UV taca posiada fluorescencyjne numerowane dołki, które pomagają śledzić wzorce ładowania, gdy jest wiele próbek, jak również fluorescencyjną linijkę po jednej stronie do pomiaru migracji.

Dostępna jest szeroka gama żeli, 1 i 3% agarozy, TBE i TAE, z bromkiem etydyny i bez niego. Konfiguracje studzienek odpowiadają potrzebom od przygotowawczych do przesiewowych dużej liczby próbek (do czterech rzędów studzienek). Jednolitość sprawia, że prefabrykowane żele agarozowe można łatwo załadować pipetą wielokanałową.

Prefabrykowane żele agarozowe zapewniają doskonałą separację i rozdzielczość DNA i są kompatybilne z większością podmorskich systemów elektroforezy poziomej.

Więcej informacji o agarozie

Agaroza jest liniowym polisacharydem zbudowanym z powtarzających się jednostek agarobiozy, który jest pozyskiwany z gotowanych czerwonych alg. Jej neutralny ładunek, niska temperatura żelowania i tworzenie stabilnych żeli o dużych rozmiarach porów sprawia, że agaroza jest dobrym medium do elektroforezy i chromatografii. Żele agarozowe są łatwe i szybkie w przygotowaniu, mogą rozdzielać fragmenty DNA od około 20 bp do wielu megabaz. Perełki agarozowe są szeroko stosowane w chromatografii kolumnowej, szczególnie w chromatografii wykluczania wielkości i chromatografii powinowactwa.

.