Allosterická regulace u fosfofruktokinázy z extrémního termofila Thermus thermophilus

Abstrakt Obrázek

Zkoumání kinetiky a regulačních vlastností typ-1 fosfofruktokinázy (PFK) z extrémního termofila Thermus thermophilus (TtPFK) odhaluje enzym, který je inhibován PEP a aktivován ADP změnou afinity vykazované k substrátu fruktosa-6-fosfátu (Fru-6-P) způsobem analogickým k ostatním prokaryotickým PFK. TtPFK však váže oba tyto alosterické ligandy podstatně těsněji než jiné bakteriální PFK a zároveň působí podstatně skromnější rozsah inhibice nebo aktivace při 25 °C, což posiluje zásadu, že vazebná afinita a účinnost mohou být nezávislé a vzájemně nekorelované. Tyto vlastnosti nám umožnily přísně stanovit, že PEP inhibuje pouze antagonizací vazby Fru-6-P, a nikoliv ovlivněním obratu, což je závěr, který vyžaduje stanovení kcat za podmínek, kdy se inhibitor i substrát sytí současně. Teplotní závislost alosterických účinků na vazbu Fru-6-P navíc naznačuje, že spojovací volné energie jsou dominantně entropické, jak bylo dříve pozorováno u PFK z Bacillus stearothermophilus, ale ne u PFK z Escherichia coli, což podporuje hypotézu, že entropicky dominantní alosterické účinky mohou být charakteristické pro enzymy pocházející z termostabilních organismů. U takových enzymů nemusí být hlavní příčina alosterického účinku snadno rozpoznatelná ze statických strukturních informací, jako jsou informace získané z rentgenové krystalografie

.

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.