DIME (Differential Identification using Mixtures Ensemble)
Robustní metoda diferenciální identifikace, která zohledňuje soubor modelů konečných směsí v kombinaci s lokální mírou falešných objevů (fdr) pro analýzu dat ChIP-seq porovnávajících dva vzorky. Tento balíček lze použít také k identifikaci diferenciálův jiných vysokokapacitních datech, jako jsou microarray, metylace atd. po normalizaci se na data aplikuje exponenciálně-normální(k) nebo rovnoměrně-normální(k) směs. (k)-normální složka může reprezentovat buď diferenciální oblasti, nebo nediferenciální oblasti v závislosti na jejich umístění a rozšíření. Exponenciální nebo uniformní reprezentují diferenciální místa. lokální (fdr) jsouvypočítány z fitovaného modelu. jedinečné vlastnosti balíčku:
- Používání souboru směsných modelůumožňuje přesné & efektivní reprezentování dat. Dvoufázový výběr pak zajistí výběr nejlepšího celkového modelu.
- Tuto metodu lze použít jako obecný program pro fitování směsi uniformně-normální nebo uniformně-k-normální nebo exponenciálně-k-normální
.