FLAG-tag nebo FLAG oktapeptid či FLAG epitop je polypeptidová proteinová značka, kterou lze přidat k proteinu pomocí technologie rekombinantní DNA a která má sekvenční motiv DYKDDDDK (kde D=kyselina asparagová, Y=tyrosin a K=lysin). Je to jedna z nejspecifičtějších značek a jedná se o umělý antigen, ke kterému byly vyvinuty specifické monoklonální protilátky s vysokou afinitou, a proto ji lze použít k purifikaci proteinů pomocí afinitní chromatografie a lze ji také použít k lokalizaci proteinů v živých buňkách. Byl použit k oddělení rekombinantního, nadměrně exprimovaného proteinu od proteinu divokého typu exprimovaného hostitelským organismem. Lze ji také použít při izolaci proteinových komplexů s více podjednotkami, protože její mírný purifikační postup nemá tendenci takové komplexy narušovat. Byla použita k získání proteinů dostatečné čistoty a kvality k provedení určení 3D struktury pomocí rentgenové krystalografie.
Tag FLAG lze použít v mnoha různých testech, které vyžadují rozpoznání protilátkou. Pokud proti danému proteinu neexistuje protilátka, přidání značky FLAG k proteinu umožňuje studovat protein pomocí protilátky proti sekvenci FLAG. Příkladem jsou studie buněčné lokalizace pomocí imunofluorescence, imunoprecipitace nebo detekce pomocí proteinové elektroforézy SDS PAGE a Western blottingu.
Sekvence peptidu FLAG-tag od N-konce k C-konci je následující: DYKDDDDK (1012 Da). Navíc může být použita v tandemu, běžně se používá peptid 3xFLAG: DYKDHD-G-DYKDHD-I-DYKDDDDK (s poslední značkou kódující místo štěpení enterokinázy). Může být spojen s C-koncem nebo N-koncem proteinu nebo vložen do proteinu. Některé komerčně dostupné protilátky (např. M1/4E11) rozpoznávají epitop pouze tehdy, je-li přítomen na N-konci. Jiné dostupné protilátky (např. M2) však nejsou citlivé na polohu. Tyrosinový zbytek ve FLAG-značce může být sulfatován, což může ovlivnit rozpoznávání epitopu FLAG protilátkami. Značku FLAG lze použít ve spojení s jinými afinitními značkami, například polyhistidinovou značkou (His-tag), HA-tag nebo myc-tag.
.