Dnes jsem si začal procházet materiály z MCAT, takže až za pár měsíců nastoupím na lékařskou fakultu, budu moci začít pracovat. Nejsem příznivcem memorování, ale je pár míst, kde se s tím nedá nic dělat. Dobrým příkladem je znalost aminokyselin.
Mám tři zkratky, které mi pomáhají zapamatovat si název každé aminokyseliny. Pár z nich mě také nabádá, abych si vzpomněl na strukturu aminokyseliny. Každá zkratka představuje skupinu aminokyselin a každá skupina je založena na elektronovém charakteru postranního řetězce molekuly. Všimněte si, že zkratky používají jednopísmenné zkratky aminokyselin:
Nepolární postranní řetězce: „(G, A, V, L, I, M, F, W, P)
Polární postranní řetězce: „(S, T, C, N, Q, Y)
Elektricky nabité postranní řetězce: „(D, E, K, R, H)
Přestože se vám tyto nástroje mohou hodit, zapamatování aminokyselin vám dá ještě zabrat. Doporučuji, abyste si pořídili několik listů papíru, na kterých projdete tyto čtyři kroky:
Nejprve si na samostatné plochy stránky napište posloupnost písmen jednotlivých zkratek a nechte si místo na nakreslení každé aminokyseliny. Postupně si akronymy nahlas říkejte. (Nejprve si také zapište celý název a třípísmennou zkratku každé aminokyseliny. Později, až budete znát názvy všech 20 molekul, budete pravděpodobně bezpečně psát jen třípísmenný kód)
Druhé, nad každé písmeno nakreslete základní strukturu aminokyseliny (alfa uhlík, aminoskupinu a skupinu kyseliny karboxylové). Tuto strukturu můžete zobrazit buď jako Fischerovu projekci (jak je znázorněno na obrázku výše), nebo jako stereochemický obrázek. Nezapomeňte, že aminoskupiny a karboxylové skupiny jsou při pH 7 ionizované, stejně jako elektricky nabité postranní řetězce.
Zatřetí ke každé základní struktuře nakreslete příslušný postranní řetězec. Při kreslení každého postranního řetězce přemýšlejte nahlas – pomůže vám to lépe si zapamatovat. Věnujte pozornost pořadí zkratky a změnám struktury při přechodu od jednoho postranního řetězce k dalšímu.
Nakonec opláchněte a opakujte. Toto cvičení provádějte jednou denně po dobu jednoho týdne, pak jednou za dva dny po dobu jednoho týdne a nakonec jednou nebo dvakrát týdně do budoucna. Později zkuste kreslit postranní řetězce v opačném nebo náhodném pořadí, abyste získali další výzvu.
Když už máme herní plán, pojďme se na tyto zkratky podívat blíže:
Nepolární postranní řetězce:
„Babička vždycky jezdí do Londýna v květnu na Winstonův večírek“
- Glycin, Gly, G
- Alanin, Ala, A
- Valin, Val, V
- Leucin, Leu, L
- Isoleucin, Ile, I
- Methionin, Met, M
- Fenylalanin, Phe, F
- Tryptofan, Trp, W
- Prolin, Pro, P
Abyste si uvědomili, že se jedná o zkratku pro nepolární postranní řetězce, připomeňte si, že Londýn v Anglii se nenachází v blízkosti zemských pólů. Také vám možná pomůže, když si Londýn spojíte s Winstonem Churchillem (premiérem Spojeného království během druhé světové války) a následně s 8. květnem (Den vítězství v Evropě, který se slaví na počest formální kapitulace nacistického Německa Spojencům).
Problémovými zástupci v nepolární skupině jsou fenylalanin (F) a tryptofan (W). Jednopísmenná zkratka fenylalaninu by samozřejmě měla být poměrně snadno zapamatovatelná, protože první dvě písmena, „ph“, se vyslovují, jako by to bylo „F“. Zatímco trik, jak si zapamatovat zkratku tryptofanu, spočívá v tom, že si představíte postranní písmeno W tvořené několika vazbami ve spojených pětičlenných a šestičlenných kruzích postranního řetězce.
Polární postranní řetězce:
„Santův tým každoročně vyrábí nové deky“
- Serin, Ser, S
- Treonin, Thr, T
- Cystein, Cys, C
- Asparagin, Asn, N
- Glutamin, Gln, Q
- Tyrosin, Tyr, Y
Chcete-li si zapamatovat, že se jedná o zkratku polárních postranních řetězců, stačí se zeptat pětiletého dítěte, kde žije Santa a jeho tým skřítků – samozřejmě na severním pólu! (Moje maminka se opravdu věnuje prošívání a šití, takže mi pomáhá spojovat prošívané deky s vánočním obdarováváním.)
Problematičtí členové polární skupiny jsou asparagin (N), glutamin (Q) a tyrosin (Y). Jedním ze způsobů, jak se vypořádat s prvními dvěma, je přeskočit na trik pro zapamatování aspartátu a glutamátu (viz poznámku o asparaginu a glutaminu na konci tohoto příspěvku). Zatím si pamatuji, že tyrosin má zkratku Y, protože toto písmeno je druhé v plném názvu a protože pokud je postranní řetězec nakreslen směrem dolů, dvě z vazeb ve fenylovém kruhu a vazba s hydroxylovou skupinou mohou tvořit pomyslné Y.
Cystein je také trochu ošemetný, ale jen proto, že druhý oficiální způsob psaní názvu „cystin“ se týká oxidované formy aminokyselin.
Elektricky nabité postranní řetězce:
„Draci jedí rytíře na koních“
- Aspartát, Asp, D
- Glutamát, Glu, E
- Lysin, Lys, K
- Arginin, Arg, R
- Histidin, His, H
Eliminačním postupem zjistíte, že tato zkratka označuje zbývající skupinu aminokyselin. Stejně jako ti otravní draci je zde téměř každá molekula potížistka: aspartát (D), glutamát (E), lysin (K) a arginin (R).
Existují dva triky na téma jídlo, které používám k zapamatování aspartátu (D) a glutamátu (E). Zaprvé si příponu „-ate“ spojuji s představou draků, kteří jedí. Za druhé, když se podívám na zkratky obou aminokyselin, „Asp“ a „Glu“, vzpomenu si na větu „Aspirující žrouti“. Zatím co u lysinu (K) si jen vzpomenu, že v abecedě následuje po K písmeno L. V případě lysinu (K) si vzpomenu na to, že v abecedě následuje po K písmeno L. A jednopísmenná zkratka argininu by měla být poměrně snadno zapamatovatelná, protože první dvě písmena „ar“ se vyslovují stejně jako název písmene R.
Poznámka k asparaginu a glutaminu:
Asparagin (N) a glutamin (Q) jsou totožné s aspartátem (D) a glutamátem (E), až na to, že první dvě mají aminoskupinu, kdežto druhé dvě mají záporně nabitý kyslík. Je užitečné, že třípísmenné zkratky pro asparagin (N) a glutamin (Q) jsou Asn a Gln – skutečnost, že oba obsahují písmeno „n“, připomíná atom dusíku, který se nachází v jejich postranních aminořetězcích.
.