Eliminointidieetti on yksi yleinen hoitovaihtoehto. On tärkeää keskustella pätevän allergologin/ gastroenterologin kanssa ja saada ruoka-aineallergiaan perehtynyt ravitsemusterapeutti ennen eliminaatiodieetin aloittamista. Eliminointidieetti räätälöidään yksilöllisesti. Jotkut yksilöt saattavat pystyä tunnistamaan oireet laukaisevat elintarvikkeet, mutta useimmat eivät pysty tunnistamaan niitä. Kyse voi olla useammasta kuin yhdestä elintarvikkeesta. Jotkut lääkärit saattavat ehdottaa jopa 6/8 yleisimmän ruoka-aineallergeenin (maito, kananmuna, soija, vehnä, maapähkinä/puupähkinä, äyriäiset/kala) poistamista. Viimeaikaiset tutkimukset osoittavat, että maito, kananmuna, vehnä ja soija ovat EoE:n yleisimpiä laukaisevia ruoka-aineita, ja siksi jotkut erikoislääkärit saattavat suositella vain näiden neljän laukaisevan ruoka-aineen poistamista. Ei ole olemassa testiä (ihopistokoe, verikoe tai laastaritesti), jolla voitaisiin luotettavasti osoittaa EoE:n erityiset ruoka-aineet. Minkä tahansa eliminointidieetin yhteydessä on tärkeää varmistaa, että ruokavalio on tasapainoinen, kasvu säilyy ja että on olemassa suunnitelma uudelleenarviointia varten.
Elementtiruokavalio koostuu vain erityisestä lääkinnällisestä ruoasta, jota kutsutaan elementtivalmisteeksi ja joka sisältää aminohappoja (proteiinien rakennusaineita), rasvoja, sokereita, vitamiinejaja kivennäisaineita. Niistä saadaan kaikki henkilön tarvitsema ravinto, jos niitä nautitaan riittävästi.Jotkut henkilöt tarvitsevat syöttöletkua varmistaakseen, että he saavat riittävästi kaavaa tai jotta ruokatorvi voi levätä. Potilas saa syöttöletkua yksinään muutaman viikon ajan, minkä jälkeen hänelle tehdään uusi tähystys, jotta nähdään, onko tilanne parantunut. Jos tila on parantunut, ruokia otetaan hitaasti takaisin ruokavalioon, ja usein tehdään uusi endoskopia, jotta voidaan varmistaa jatkuva kontrolli ruokien palauttamisen yhteydessä.
Lääkitystä voidaan käyttää yksinään ja/tai yhdessä ruokavalion kanssa. YleisimminEoE:n hoidossa käytettävät lääkkeet ovat nieltäviä kortikosteroideja, usein käytetään flutikasonipuskuria (joka niellään) tai budesonidiampulleja (jotka valmistetaan lietteeksi). Nämä lääkkeet päällystävät ruokatorven ja auttavat pääsemään eroon eosinofiileistä. Myös happamuuslääkkeitä voidaan käyttää. Lääkäri määrittelee, mitkä lääkkeet soveltuvat kullekin henkilölle.
Ruokatorvenlaajennusta voidaan käyttää henkilöille, joilla on vakava ruokatorven ahtauma tai ahtauma, jotta saadaan välitöntä helpotusta, ja toiseksi henkilöille, joilla on pitkään jatkuneita oireita ja jotka ovat kokeilleet ruokavaliota tai lääkkeitä eivätkä ole parantuneet. Vaikka laajentaminen on suhteellisen turvallista, hoito ei ole yhtä miellyttävää, koska se edellyttää endoskooppista toimenpidettä, ja sitä on parasta käyttää vain tarkoin valituissa tapauksissa.