DIME (Differential Identification using Mixtures Ensemble)
Robusti differentiaalinen identifiointimenetelmä, joka ottaa huomioon äärellisten seosmallien ensemblen yhdistettynä paikalliseen väärän löydön määrään (false discovery rate, fdr) kahta näytettä vertailevan ChIP-seq-datan analysoimiseksi. Tätä pakettia voidaan käyttää myös differentiaalien tunnistamiseen muissa korkean läpimenon aineistoissa, kuten microarray-, metylaatio- jne. aineistoissa.Normalisoinnin jälkeen aineistoon sovitetaan Exponential-Normal(k) tai Uniform-Normal(k) seos. (k)-normaalikomponentti voi edustaa joko differentiaalisia alueita tai ei-differentiaalisia alueita niiden sijainnista ja leviämisestä riippuen. Eksponentiaalinen tai yhtenäinen edustavat differentiaalisia alueita. paikalliset (fdr) lasketaan sovitetun mallin perusteella.Paketin ainutlaatuiset ominaisuudet:
- Käytetään seosmallien ensemblea, joka mahdollistaa tietojen tarkan & tehokkaan esittämisen. Tämän jälkeen kaksivaiheinen valinta varmistaa parhaan kokonaismallin valinnan.
- Tätä menetelmää voidaan käyttää yleisenä ohjelmana sovittamaan sekoitus tasaisen normaalin tai tasaisen k-normaalin tai eksponentiaalisen k-normaalin