Hashimoton kilpirauhastulehdus (HT) on yksi yleisimmistä autoimmuunisairauksista, ja se johtaa usein hypotyreoosiin. Sen on osoitettu vaikuttavan merkittävästi potilaan elämänlaatuun. Liitännäissairauksien ja -sairauksien ajateltiin johtuvan kilpirauhasen vajaatoiminnasta. Silti monet potilaat kärsivät edelleen erilaisista oireista, vaikka kaikki kilpirauhasparametrit ovat normaalialueella. Kilpirauhasen toiminnasta riippumatta HT liittyy moniin elinkohtaisiin ja ei-elinkohtaisiin autoimmuunisairauksiin sekä muihin sairauksiin, kuten neuropsykologisiin/psykiatrisiin häiriöihin, vasemman kammion suorituskyvyn heikkenemiseen, suolistohäiriöihin, fibromyalgiaan ja lisääntymisterveyteen liittyviin ongelmiin. Taustalla olevat patomekanismit ovat edelleen epäselviä. Tulevaisuuden hoitovaihtoehtoja voisivat olla tyreoidektomia, seleenin anto, profylaktinen levotyroksiinilisä ja dehydroepiandrosteroni. Lisätutkimukset ovat kuitenkin perusteltuja kilpirauhasen autoimmuniteetin tärkeimpien patofysiologisten vaikutusten selvittämiseksi ja hoitovaihtoehtojen luomiseksi euthyroidisille potilaille, jotka kärsivät HT:hen liittyvistä oireista ja sairauksista.