Aloitin tänään MCAT-kokeen materiaalin kertaamisen, jotta kun lääkiksen opiskelu alkaa parin kuukauden päästä, pääsen vauhtiin. En ole mikään ulkoa opettelun ystävä, mutta on muutamia kohtia, joissa sille ei voi mitään. Aminohappojen tunteminen on hyvä esimerkki.
Minulla on kolme lyhennettä, jotka auttavat minua muistamaan kunkin aminohapon nimen. Pari niistä saa minut myös muistamaan aminohapon rakenteen. Jokainen lyhenne edustaa aminohapporyhmää, ja kukin ryhmä perustuu molekyylin sivuketjun elektronihahmoon. Huomaa, että lyhenteissä käytetään aminohappojen yksikirjaimisia lyhenteitä:
Ei-polaariset sivuketjut: ”Isoäiti käy aina toukokuussa Lontoossa Winstonin juhlissa” (G, A, V, L, I, M, F, W, P)
Polaariset sivuketjut: ”Santa’s Team Crafts New Quilts Yearly” (S, T, C, N, Q, Y)
Sähköisesti varatut sivuketjut: ”(D, E, K, R, H)
Vaikka nämä työkalut saattavat sopia sinulle hyvin, aminohappojen ulkoa opettelu vaatii silti työtä. Suosittelen hankkimaan muutaman paperiarkin, jossa käydään läpi nämä neljä vaihetta:
Kirjoita ensin jokaisen lyhenteen kirjainjärjestys sivun erillisille alueille ja jätä tilaa kunkin aminohapon piirtämiseen. Sano akronyymi ääneen itsellesi sitä mukaa kun etenet. (Aluksi kannattaa kirjoittaa ylös myös kunkin aminohapon koko nimi ja kolmikirjaiminen lyhenne. Myöhemmin, kun tiedät kaikkien 20 molekyylin nimet, sinun on luultavasti turvallista kirjoittaa vain kolmikirjaiminen lyhenne.)
Toiseksi piirrä aminohapon perusrakenne (alfahiili, aminoryhmä ja karboksyylihapporyhmä) jokaisen kirjaimen yläpuolelle. Voit esittää tämän rakenteen joko Fischer-projektiona (kuten yllä olevassa kuvassa) tai stereokemiallisena kuviona. Muista, että amino- ja karboksyyliryhmät ovat ionisoituneita pH 7:ssä, samoin kuin sähköisesti varautuneet sivuketjut.
Kolmanneksi piirrä kuhunkin perusrakenteeseen liitettynä sopiva sivuketju. Ajattele ääneen, kun piirrät kutakin sivuketjua – se auttaa sinua muistamaan paremmin. Kiinnitä huomiota lyhenteen järjestykseen ja rakenteen muutoksiin, kun siirryt sivuketjusta toiseen.
Viimeiseksi, huuhtele ja toista. Tee tämä harjoitus kerran päivässä viikon ajan, sitten kerran joka toinen päivä viikon ajan ja lopuksi yksi tai kaksi kertaa viikossa jatkossa. Myöhemmin kokeile piirtää sivuketjuja käänteisessä tai satunnaisessa järjestyksessä lisähaasteen saamiseksi.
Okei, nyt kun meillä on pelisuunnitelma, katsotaanpa tarkemmin noita lyhenteitä:
Non-polaariset sivuketjut:
”Isoäiti käy aina toukokuussa Lontoossa Winstonin juhlissa”
- Glysiini, Gly, G
- Alaniini, Ala, A
- Valiini, Val, V
- Leusiini, Leu, L
- Isoleusiini, Ile, I
- Metioniini, Met, M
- Fenyylialaniini, Phe, F
- Tryptofaani, Trp, W
- Proliini, Pro, P
Jotta muistaisimme, että tämä on ei-polaaristen sivuketjujen lyhenne, muistakaamme, että Lontoo, Englanti, ei sijaitse lähellä maapallon napoja. Lisäksi voi auttaa sinua yhdistämään Lontoon Winston Churchilliin (Yhdistyneen kuningaskunnan pääministeri toisen maailmansodan aikana) ja sitä kautta toukokuun 8. päivään (Euroopan voiton päivä, jolloin juhlitaan natsi-Saksan virallista antautumista liittoutuneille).
Epäpolaaristen sivuketjujen häiriköt ovat fenyylialaniini (F) ja tryptofaani (W). Fenyylialaniinin yksikirjaiminen lyhenne pitäisi tietysti olla suhteellisen helppo muistaa, koska kaksi ensimmäistä kirjainta, ”ph”, lausutaan kuin ne olisivat ”F”. Tryptofaanin lyhenteen muistaminen onnistuu puolestaan siten, että kuvitellaan sivuttain W-kirjain, joka muodostuu sivuketjun yhdistettyjen viisi- ja kuusijäsenisten renkaiden useista sidoksista.
Polaariset sivuketjut:
”Santa’s Team Crafts New Quilts Yearly”
- Serine, Ser, S
- Threonine, Thr, T
- Cysteine, Cys, C
- Asparagine, Asn, N
- Glutamine, Gln, Q
- Tyrosiini, Tyr, Y
Jotta muistaisit, että tämä on polaaristen sivuketjujen lyhenne, sinun tarvitsee vain kysyä viisivuotiaalta, missä joulupukki ja hänen tontturyhmänsä asuvat – pohjoisnavalla, tietenkin! (Äitini on todella innostunut tilkkutöistä ja ompelusta, joten minulle on hyödyllistä yhdistää tilkkutäkit joululahjoihin.)
Polaarisen ryhmän häiriköt ovat asparagiini (N), glutamiini (Q) ja tyrosiini (Y). Yksi tapa käsitellä kahta ensimmäistä on hypätä eteenpäin temppuun aspartaatin ja glutamaatin muistamiseksi (ks. tämän viestin lopussa oleva huomautus asparagiinista ja glutamiinista). Sillä välin muistan, että tyrosiinilla on lyhenne Y, koska kyseinen kirjain on toinen koko nimessä ja koska jos sivuketju piirretään alaspäin, kaksi fenyylirenkaan sidosta ja sidos hydroksyyliryhmän kanssa voivat muodostaa kuvitteellisen Y:n.
Kysteiini on myös hieman hankala, mutta vain siksi, että toinen virallinen tapa kirjoittaa nimi, ”kystiini”, viittaa aminohappojen hapettuneeseen muotoon.
Sähköisesti varatut sivuketjut:
”Dragons Eat Knights Riding Horses”
- Aspartaatti, Asp, D
- Glutamaatti, Glu, E
- Lysiini, Lys, K
- Arginiini, Arg, R
- Histidiini, His, H
Eliminointimenetelmällä tiedät, että tämä lyhenne viittaa jäljellä olevaan aminohapporyhmään. Kuten nuo ärsyttävät lohikäärmeet, lähes jokainen molekyyli tässä on häirikkö: aspartaatti (D), glutamaatti (E), lysiini (K) ja arginiini (R).
On kaksi syömiseen liittyvää kikkaa, joita käytän aspartaatin (D) ja glutamaatin (E) muistamiseen. Ensinnäkin yhdistän päätteen ”-ate” ajatukseen lohikäärmeiden syömisestä. Toiseksi, kun katson näiden kahden aminohapon lyhenteitä ”Asp” ja ”Glu”, mieleeni tulee lause ”Aspiring Gluttons”. Lysiinin (K) osalta taas muistan vain, että L seuraa K:ta aakkosissa. Ja arginiinin yksikirjaiminen lyhenne pitäisi olla suhteellisen helppo muistaa, koska kaksi ensimmäistä kirjainta, ”ar”, lausutaan kuten R-kirjaimen nimi.
Huomautus asparagiinista ja glutamiinista:
Asparagiini (N) ja glutamiini (Q) ovat identtisiä aspartaatin (D) ja glutamaatin (E) kanssa sillä erotuksella, että kahdessa ensin mainitussa on aminoryhmä, kun taas kahdessa jälkimmäisessä negatiivisesti varautunut happi. On hyödyllistä, että asparagiinin (N) ja glutamiinin (Q) kolmikirjaimiset lyhenteet ovat vastaavasti Asn ja Gln – se, että molemmissa on n-kirjain, muistuttaa niiden aminosivuketjuissa olevasta typpiatomista.