Redwood Creek tarjoaa kriittisen kutu- ja kasvatusympäristön koho- tai hopealohelle (Oncorhynchus kisutch), rannikon kirjolohelle (Oncorhynchus clarki clarki) ja meritaimenelle (Oncorhynchus mykiss), jotka kaikki ovat uhanalaisia lajeja. Puro on lähellä cohon elinympäristön eteläisintä rajaa, eikä kaloja ole koskaan istutettu, joten niillä on ainutlaatuinen DNA. Redwood Creekin lohet ovat Central Coastin koholohia, jotka on luokiteltu liittovaltion uhanalaisiksi lajeiksi lokakuusta 2006 lähtien ja liittovaltion uhanalaisiksi lajeiksi kesäkuussa 2005. Coho-lohet vaeltavat merestä takaisin makeaan veteen saadakseen yhden mahdollisuuden lisääntyä, yleensä kahden meressä vietetyn vuoden jälkeen. Kutuvaellukset alkavat sen jälkeen, kun rankat myöhäissateet tai talvisateet rikkovat Muir Beachin hiekkapenkereen, jolloin kalat pääsevät liikkumaan ylävirtaan (yleensä joulu- ja tammikuussa). Lohia ei nähty talvella 2007-2008 eikä talvella 2008-2009. Todisteet viittaavat siihen, että smolttien ylikesäys purossa on loppunut, mikä johtuu suurten puujätteiden ja syvien altaiden, joissa nuoret lohet voivat levätä, häviämisestä. Kansallispuistopalvelu aloittaa vuonna 2009 Muir Beachin kunnostamisen luodakseen toimivan, itseään ylläpitävän ekosysteemin ja parantaakseen vierailijoiden pääsyä sinne. Toimenpide oli melkein liian myöhäistä, sillä lohikalan elinikä on vain kolme vuotta. Onneksi tammikuussa 2010 ja ensimmäistä kertaa kolmeen vuoteen arviolta 45 cohoa ui Redwood Creekiä ylös kutemaan ja loi 23 munapesää tai mätirykelmää. Vuonna 2011 havaittiin 11 elävää täysikasvuista cohoa ja yksi cohon ruho sekä kolme kutupesää, mikä on hieman enemmän kuin kutukaudella 2007-2008. Koko osavaltiossa kohokalakanta on 1 prosentti 1940-luvun tasosta, ja kalat ovat kadonneet 90 prosentista puroista, joissa ne ovat virallisesti käyneet. Watershed Alliance of Marin raportoi, että yksikään lohi ei palannut kutemaan vuonna 2014, mikä herättää huolta siitä, että kalat saattavat nyt olla paikallisesti kuolleet sukupuuttoon. Kolme aikuista urospuolista cohoa, jotka pyydystettiin purosta nuorina vuonna 2014, vapautettiin kolmen Olema Creekissä elävän naaraan kanssa osana California Department of Fish and Wildlife -operaatiota ”coho jumpstart”, ja ainakin yhden jälkimmäisistä havaittiin kutevan, mikä herätti toiveita elinkelpoisen kutujoukon paluusta Redwood Creekiin.
Syksyllä 2003 NPS sai valmiiksi ensimmäisen vaiheen Banduccin kunnostushankkeessa, joka toteutettiin noin kilometrin päässä ylävirtaan päin siitä, kun puro suistui Muir Beachille. Keinotekoisia tukkipatoja rakennettiin kaadettujen eukalyptuspuiden avulla ja rikkomalla rajoittavat padot kanavan ja tulva-alueen yhdistämiseksi uudelleen. Virtavesihankkeen ensisijaisena tarkoituksena oli luoda lisääntymisaltaita lohenpoikasille. NPS poisti myös vierasperäistä, vierasperäistä kasvillisuutta rantakäytävästä ja korvasi sen alkuperäisellä kasvillisuudella parantaakseen rantakäytävällä asuvien ja muuttavien laululintujen pesimäympäristöä. Redwood Creekin ennallistamishankkeen nykyisessä vaiheessa, joka aloitettiin vuonna 2009, yritetään ennallistaa 46 hehtaarin kokoinen purouoma. Siihen kuuluu uuden 650 jalan pituisen mutkittelevan kanavan ja kolmen sivukanavan luominen, jolla pyritään palauttamaan historiallinen Big Lagoon, joka vuoden 1850 karttojen mukaan ulottui aina nykyiseen Pelican Inniin asti. Kun istutettu kotoperäinen kasvillisuus on saanut jalansijaa uudessa purouomassa, nykyistä parkkipaikkaa käännetään 90 astetta ja uusi kanava yhdistetään.
Valuma-alueella elävät myös harvinaiset lajit, kuten pohjoinen täpläpöllö (Strix occidentalis caurina) ja kalifornialainen punajalkasammakko (Rana aurora draytonii). Vuoden 2009 loppupuolella NPS kaivoi Green Gulch Farmin laitumelle lammen tarjotakseen elinympäristöä hupenevalle kalifornialaiselle punajalkasammakkopopulaatiolle, joka on ainoa vesistöalueella.
Jokisaukko (Lontra canadensis) havaittiin Redwood Creekissä vuonna 1996, ja se palaa vuosittain syömään kirjolohta. Grinnellin vuonna 1937 ilmestyneessä teoksessa Fur-bearing Mammals of California (Kalifornian turkisnisäkkäät) jokisaukkoja ei mainittu Marinin piirikunnan alkuperäislajeiksi.