Agarose

Poudres d’agarose et gels préfabriqués

Bio-Rad propose une variété de poudres d’agarose et de gels d’agarose préfabriqués pour répondre à tous vos besoins en matière d’électrophorèse d’ADN et d’ARN, y compris l’électrophorèse sur gel à champ pulsé et les applications spécialisées telles que l’IEP et l’IEF. Les poudres sont de l’agarose d’ADN certifié de qualité génétique. Nos gels préfabriqués sont disponibles à la fois en tampon TBE ou TAE, avec ou sans bromure d’éthidium.

Types d’agarose et utilisations en électrophorèse

Tous les produits d’agarose Bio-Rad sont garantis sans inhibiteurs, DNases et RNases. Il existe une gamme de types d’agarose qui ont été optimisés pour différentes utilisations.

Agarose de biologie moléculaire : C’est un agarose à usage général qui a une limite d’exclusion élevée. Ce type d’agarose a une force de gel élevée et est facile à manipuler à de faibles pourcentages. L’agarose de biologie moléculaire est de qualité GQT (genetic quality tested), ce qui le rend idéal pour les gels préparatifs et la récupération d’ADN. La séparation analytique est de >1 000 paires de bases (bp).

L’agarose à faible fusion : L’utilisation principale de l’agarose à bas point de fusion est l’électrophorèse préparative. Il est idéal pour les applications in-gel telles que la ligature, la PCR, la digestion par enzymes de restriction, la transformation et le séquençage. D’autres applications comprennent l’électrophorèse en champ pulsé d’ADN mégabase et l’inclusion de chromosomes. Cet agarose a une température de gélification de 26°C et une capacité de résolution élevée, >1 000 kb.

L’agarose à faible fusion est également utilisé pour fixer les bandes de gradient de pH immobilisé (IPG) pour la focalisation isoélectrique, la deuxième dimension de la SDS-PAGE 2-D. Cet agarose contient du bleu de bromophénol pour le suivi de l’électrophorèse.

Agarose pour PCR : Cet agarose à haute résistance forme des gels faciles à manipuler et reste flexible même à des pourcentages de gel élevés, ce qui réduit le risque de fissuration ou de rupture. La température de gélification est de 40°C. Cet agarose possède d’excellentes propriétés de tamisage et la force de gel la plus élevée de tous les agaroses.

L’agarose à basse fusion pour PCR possède une capacité de tamisage élevée. Il est idéal pour l’électrophorèse préparative et les applications in-gel telles que les digestions par enzymes de restriction, la ligature et la transformation. Les agaroses PCR sont recommandés pour les fragments d’ADN <1 000 pb.

Agarose ultra bas de gamme : Cet agarose permet la résolution des amorces et des petits produits PCR à des concentrations inférieures à celles de l’agarose standard, ce qui évite d’utiliser du polyacrylamide. Un gel à 3% résout clairement une échelle de 10 pb. La séparation analytique est de 20 à 800 pb.

Agarose de mégabase : Cet agarose a une force de gel très élevée, une mobilité électrophorétique élevée et une limite d’exclusion élevée. L’agarose Megabase est le meilleur choix pour les applications d’électrophorèse en gel à champ électrique homogène clampé (CHEF) et à inversion de champ (FIGE). Les gels restent faciles à manipuler à des concentrations aussi faibles que 0,3 % et permettent des temps d’exécution plus courts. La faible coloration de fond permet également une imagerie supérieure de l’ADN de poids moléculaire élevé. La gamme de séparation est comprise entre 1 kb et 5 Mb.

Agarose à champ pulsé : L’électrophorèse en gel à champ pulsé (PFGE) est utilisée pour la séparation de grands fragments d’ADN. Bien que les gels coulés avec cet agarose aient des temps de passage PFGE plus longs qu’avec l’agarose mégabase, les conditions de passage pour cet agarose sont un protocole prédéfini, sélectionnable, pour l’auto-algorithme du système CHEF Mapper® XA. La gamme de séparation est de 1 kb à 2 Mb.

Agarose pour IEP et IEF : Des agaroses sont disponibles pour l’immunoélectrophorèse (IEP) et la focalisation isoélectrique (IEF). Ils peuvent être utilisés pour déterminer les poids moléculaires relatifs (Mr). L’agarose pour l’IEF ne présente pas d’électroendosmose détectable.

Gels d’agarose préfabriqués

Les gels d’agarose préfabriqués présentent plusieurs avantages, outre la rapidité et la reproductibilité. Le plateau de verrouillage signifie que les gels d’agarose ne bougent pas pendant le chargement et au début d’une série, ce qui peut gaspiller de l’échantillon, donner des charges inégales et diminuer la netteté des bandes. Le plateau transparent aux UV comporte des puits numérotés fluorescents qui aident à suivre les schémas de chargement lorsqu’il y a de nombreux échantillons, ainsi qu’une règle fluorescente sur un côté pour mesurer la migration.

Une grande variété de gels, 1 et 3% d’agarose, TBE et TAE, et avec et sans bromure d’éthidium, est disponible. Les configurations des puits répondent aux besoins allant de la préparation au criblage d’un grand nombre d’échantillons (jusqu’à quatre rangées de puits). L’uniformité rend les gels d’agarose préfabriqués faciles à charger avec une pipette multicanaux.

Les gels d’agarose préfabriqués fournissent une excellente séparation et résolution de l’ADN, et sont compatibles avec la plupart des systèmes d’électrophorèse horizontale sous-marins.

Plus d’informations sur l’agarose

L’agarose est un polysaccharide linéaire composé d’unités répétées d’agarobiose qui est extrait d’algues rouges bouillies. Sa charge neutre, sa faible température de gélification et la formation de gels stables avec des pores de grande taille font de l’agarose un bon milieu pour l’électrophorèse et la chromatographie. Les gels d’agarose sont faciles et rapides à mettre en place, et peuvent séparer des fragments d’ADN allant d’environ 20 pb à plusieurs mégabases. Les billes d’agarose sont largement utilisées pour la chromatographie sur colonne, notamment pour la chromatographie d’exclusion de taille et d’affinité.

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