Quatre procédures d’estimation différentes pour les modèles de structure de population sont comparées. On montre que les paramètres des modèles sont équivalents et, dans la plupart des cas, facilement exprimés en termes de paramètres que Wright appelle « F-statistiques. » Nous avons estimé les paramètres de chacun de ces modèles avec des données sur neuf paires d’allèles codominants dans 47 villages Yanomama, et nous constatons que les différents estimateurs pour un paramètre donné donnent tous des résultats plus ou moins équivalents.
Les statistiques F sont souvent assimilées aux coefficients de consanguinité qui sont définis comme la probabilité d’identité par descendance à partir d’allèles pris comme uniques dans une certaine population fondatrice. Cependant, nous sommes amenés à déduire d’une simulation informatique et de considérations historiques générales que toutes les estimations à partir des fréquences génotypiques sous-estiment grandement le coefficient de consanguinité pour les allèles dans la population fondatrice des Amérindiens de l’hémisphère occidental. Nous supposons que dans les populations tribales fortement subdivisées qui ont prévalu jusqu’à l’avènement récent de la civilisation, la probabilité d’identité par descendance pour les allèles homologues était d’environ 0,5. Nous considérons certaines conséquences de travailler avec les estimations habituelles, beaucoup plus faibles – 0,005 à 0,01 – si, sur l’échelle de temps de l’évolution humaine, celles-ci ne représentent qu’un écart très récent par rapport à l’intensité de la consanguinité qui prévalait avant la civilisation.