科学者たちは、一部の人々の虫歯を加速させるストレプトコッカス・ソブリヌスという第2の有害細菌が存在することを知っていますが、この微生物についてはほとんど知られていませんでした。 ポール・ジェンセン助教授率いるイリノイ州のバイオエンジニアリング研究チームが、ソブリヌス菌の 3 つの株の完全なゲノムの配列決定に成功したのです。 S. sobrinusはまれですが、酸をより速く生成し、特に子供の間で、最も悪い臨床結果と関連しています」と、大学内のカール R. ウーズ研究所ゲノム生物学研究所の研究者であるジェンセンは指摘しました。 「S. sobrinus が S. mutans と共に存在する場合、虫歯が蔓延するリスクがあります。つまり、この 2 つの間には、まだ解明されていない何らかのレベルのコミュニケーションや相乗効果があるのです」
S. sobrinus の配列が完了した現在、ジェンセンと彼の学生たちは、この 2 つの細菌の相互作用をより理解し、なぜ S. sobrinus が、S. 436>
すでに彼らは、たとえば、S. sobrinus には、バクテリアが近くのバクテリアを感知して反応し、最終的に増殖する能力であるクォーラム センシングの経路が完全に欠如していることを確認しています。 S. ミュータンス菌の細胞がある閾値に達すると、攻撃して、人の口の中に善玉菌と悪玉菌の間の不均衡を作り出し、急速な虫歯の形成につながります」
「S. sobrinus はこのための完全なシステムを持っていません」と、Jensen は語ります。 とジェンセンは語ります。「私たちは、これをさらに調査して、何が欠けていて、なぜ欠けているのかを見つけたいと強く思っています」
興味深いことに、S. sobrinus の全ゲノム配列決定は、バイオエンジニアリング学部生と 1 年の工学修士 (M. Engineering) に在籍する学生たちのチームによって完成されました。Eng.）プログラムに登録されたバイオエンジニアリングの学部生と学生のチームによって完了したもので、通常この種の研究を数年にわたって行う博士候補者ではありません。 “2018年、病気を引き起こす種全体があり、それの完全なゲノムがなかったというのは驚きです。 しかし、学部生と工学修士課程の学生の野心的なチームは、1 年で配列決定を完了しました」
この 5 月に学士号を取得したミア・セールズは、S. sobrinus の種のうち 2 種のアセンブリを完了させました。 セールス氏はまた、他のチームメンバーが最初のゲノム組み立てに使用したコンピューターも構築しました。 sobrinus のゲノムを構成する約200万個のアデニン、シトシン、グアニン、チミンのヌクレオチドを発見しました。 「この研究は、まったく新しい洞察で学習経験を総合する学生の能力を例証するものであり、オリジナルな研究発表につながりました」と、工学修士プログラムのディレクターであるディパンジャン・パン教授は述べています。 彼らの研究は、Microbial Resource Announcements誌に、以下のタイトルで掲載されました。 「Streptococcus sobrinus SL1 (ATCC 33478 = DSM 20742), NIDR 6715 (ATCC 27351 & 27352), and NCTC 10919 (ATCC 33402) Complete genomic sequences」
この研究はNIH National Institute of Dental and Craniofacial Researchとイリノイ大学バイオエンジニアリング工学マスタープログラムからの助成金によって行われました。