寄生原生生物のほとんどは、かなり一定の環境で生活しています。 宿主の内部では温度の変動はほとんどないか、まったくなく、乾燥の危険もなく、食料は常に供給されている。 一方、自由行動する原生生物は、温度、水中の酸性度、食物供給、水分、光などの短期的または長期的な変化に直面する。 多くの原生生物は、環境の悪条件に対応するために、嚢子（嚢のようなもの）を作り、厚くて丈夫な壁を自分の周りに作り、冬眠のような静止状態になる。 抵抗性のシストを形成する能力は、多様な原生生物群に広く存在し、おそらく進化の歴史の初期に発達したものと思われる。 また、休眠中のシストは風に運ばれやすく、土壌に生息する種や、一時的な池やプールに多く生息する種にとっては重要な分散手段を形成している。
シスト壁は様々な数の層で構成されており、その構成要素は種によって異なる。 嚢子形成の過程で、原生生物細胞は一連の変化を受け、生物の複雑さをかなり減少させる。 鞭毛を持つ生物や繊毛虫は鞭毛や繊毛を失い、収縮液胞や食物液胞は消滅し、細胞内の小器官の分布が再編成されることもある。 種によっては、細胞体積がかなり減少する。 7469>
ある種の海洋浮遊性ティンティン類は、餌が豊富な時期に一斉にシストから脱出するようプログラムされている。 例えば、Helicostomella subulataは温帯海域で6月に破嚢し、7月から10月にかけて大量に発生する。 10月になると再び嚢子になり、沈殿物に沈んで翌年までそこにとどまる。 このシストは通常の生活サイクルの一部であり、実験室内の個体群でも自然界の個体群と同じ時期にシスト化する。 この種の生活戦略パターンは、他のいくつかの繊毛虫やいくつかのアメーバで実証されている。
土壌に住む原生生物にとって、シストは土壌水分が消失したり土壌水が凍結したりしたときの重要な避難場所となる。
シストは、Entamoeba histolyticaやCryptosporidiumなど、自由生活型の散布段階を持ついくつかの寄生原生生物のライフサイクルにおいて重要な役割を担っている。 シストは宿主の糞便中に排泄され、水中や土壌中で生存する。 人間は通常、汚染された水を飲んだり、人糞を肥料として使用した場所で栽培された果物や野菜を生で食べることで感染します。
A.L.S. Leu
いくつかの淡水原生生物、特に繊毛虫Spirostomum、Loxodes、Plagiopylaは、底に住む生き方を捨て、上方に泳いで酸素がある程度利用できるが浮遊生物と直接競合しないレベルに身を置くことによって、不快な条件、特に酸素不足を避けることができる。
藻類との共生や光合成を行う餌のプラスティドの浮遊性原生生物による保持・隔離を含む混合栄養が広く見られるのは、餌が限られた水域への適応であると考えられている。 プラスティドを保持する繊毛虫は、生産性の高い海域よりも、餌が乏しい海域にはるかに多く生息しているようである。 このような混合栄養の形態と生態系の生産性の間には逆相関が存在する
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