Agarose

Agarosepoeders en geprefabriceerde gels

Bio-Rad biedt een verscheidenheid aan agarosepoeders en geprefabriceerde agarosegels om te voldoen aan al uw behoeften voor DNA- en RNA-elektroforese, inclusief pulse field gelelektroforese en speciale toepassingen zoals IEP en IEF. De poeders zijn gecertificeerde DNA-agarose van genetisch geteste kwaliteit. Onze geprefabriceerde gels zijn verkrijgbaar in TBE of TAE buffer, met of zonder ethidium bromide.

Agarose Types en Toepassingen in Elektroforese

Alle Bio-Rad agarose producten zijn gegarandeerd vrij van remmers, DNases, en RNases. Er is een reeks van soorten agarose die zijn geoptimaliseerd voor verschillende toepassingen.

Moleculaire biologie agarose: Dit is een agarose voor algemeen gebruik die een hoge uitsluitingsgrens heeft. Dit type agarose heeft een hoge gelsterkte en is gemakkelijk te hanteren bij lage percentages. Agarose voor moleculaire biologie is van GQT-kwaliteit (genetic quality tested), waardoor het ideaal is voor preparatieve gels en terugwinning van DNA. De analytische scheiding is >1.000 basisparen (bp).

Lage-smelt agarose: Het belangrijkste gebruik van low-melt agarose is voor preparatieve elektroforese. Het is ideaal voor in-gel-toepassingen zoals ligatie, PCR, restrictie-enzym digestie, transformatie en sequencing. Andere toepassingen zijn pulsed field elektroforese van megabase DNA en het inbedden van chromosomen. Deze agarose heeft een gelatietemperatuur van 26°C en een hoog oplossend vermogen, >1.000 kb.

Low-melt agarose wordt ook gebruikt om geïmmobiliseerde pH gradiënt (IPG) strips te bevestigen voor isoelectric focusing, de tweede dimensie van 2-D SDS-PAGE. Deze agarose bevat broomfenolblauw voor het controleren van elektroforese.

PCR-agarose: Deze agarose met hoge sterkte vormt gels die gemakkelijk te hanteren zijn en flexibel blijven, zelfs bij hoge gelpercentages, waardoor het risico van scheuren of breken wordt beperkt. De geleringstemperatuur is 40°C. Deze agarose heeft uitstekende zeefeigenschappen en de hoogste gelsterkte van alle agaroses.

PCR low-melt agarose heeft een hoge zeefcapaciteit. Het is ideaal voor preparatieve elektroforese en in-gel toepassingen zoals restrictie-enzym digesties, ligatie en transformatie. PCR-agaroses worden aanbevolen voor DNA-fragmenten <1.000 bp.

Laag bereik ultra-agarose: Deze agarose biedt resolutie van primers en kleine PCR-producten bij lagere concentraties dan standaardagarose, waardoor het gebruik van polyacrylamide niet nodig is. Een 3%-gel lost een ladder van 10 bp duidelijk op. Analytische scheiding is 20-800 bp.

Megabase agarose: Deze agarose heeft een zeer hoge gelsterkte, hoge elektroforetische mobiliteit, en hoge uitsluitingsgrens. Megabase agarose is de beste keuze voor geklemde homogene elektrische veld (CHEF) en veld-inversie gelelektroforese (FIGE) toepassingen. De gels blijven gemakkelijk hanteerbaar bij concentraties van slechts 0,3% en maken kortere doorlooptijden mogelijk. De lage achtergrondkleuring zorgt ook voor een superieure beeldvorming van DNA met een hoog molecuulgewicht. Het scheidingsbereik ligt tussen 1 kb en 5 Mb.

Pulsed field agarose: Pulsed field gelelektroforese (PFGE) wordt gebruikt voor de scheiding van grote DNA-fragmenten. Hoewel gels die met deze agarose zijn gegoten langere PFGE-looptijden hebben dan die met megabase-agarose, zijn de loopomstandigheden voor deze agarose een vooraf ingesteld, selecteerbaar protocol voor het auto-algoritme van het CHEF Mapper® XA-systeem. Het scheidingsbereik is 1 kb tot 2 Mb.

Agarose voor IEP en IEF: Agaroses zijn beschikbaar voor immuno-elektroforese (IEP) en iso-elektrische focussering (IEF). Zij kunnen worden gebruikt voor de bepaling van relatieve molecuulgewichten (Mr). De agarose voor IEF heeft geen detecteerbare elektroendosmose.

Precast Agarose Gels

Precast agarose gels hebben verschillende voordelen, naast snelheid en reproduceerbaarheid. De locking tray betekent dat de agarose gels niet bewegen tijdens het laden en aan het begin van een run, wat monsterverspilling kan veroorzaken, ongelijke ladingen kan geven en de bandscherpte kan verminderen. De UV-transparante tray heeft fluorescerende genummerde wells die helpen bij het bijhouden van laadpatronen wanneer er veel monsters zijn, alsmede een fluorescerende liniaal aan één kant voor het meten van migratie.

Er is een grote verscheidenheid aan gels, 1 en 3% agarose, TBE en TAE, en met en zonder ethidiumbromide, beschikbaar. Well-configuraties voldoen aan de behoeften van preparatieve tot screening van grote aantallen monsters (tot vier rijen wells). De uniformiteit maakt geprefabriceerde agarose gels gemakkelijk te laden met een multikanaalspipet.

Geprefabriceerde agarose gels zorgen voor een uitstekende scheiding en resolutie van DNA, en zijn compatibel met de meeste onderzeese horizontale elektroforese systemen.

Meer informatie over Agarose

Agarose is een lineaire polysaccharide gemaakt van repeterende eenheden van agarobiose die wordt gewonnen uit gekookte rode algen. Door zijn neutrale lading, lage geleertemperatuur en de vorming van stabiele gels met grote poriën is agarose een goed medium voor elektroforese en chromatografie. Agarosegels zijn gemakkelijk en snel op te zetten en kunnen DNA-fragmenten scheiden van ongeveer 20 bp tot vele megabasen. Agarosekorrels worden op grote schaal gebruikt voor kolomchromatografie, met name bij grootte-exclusie en affiniteits-chromatografie.