Vandaag ben ik begonnen met de MCAT, zodat ik over een paar maanden, als ik naar de medische faculteit ga, meteen aan de slag kan. Ik ben geen fan van dingen uit het hoofd leren, maar er zijn een paar plaatsen waar het niet anders kan. De aminozuren kennen is een goed voorbeeld.
Ik heb drie acroniemen om me te helpen de naam van elk aminozuur te onthouden. Een paar ervan helpen me ook de structuur van het aminozuur te herinneren. Elk acroniem vertegenwoordigt een groep aminozuren, en elke groep is gebaseerd op het elektronenkarakter van de zijketen van het molecuul. Merk op dat de acroniemen de eenletterige afkortingen van de aminozuren gebruiken:
Non-polaire zijketens: “Oma bezoekt altijd Londen in mei voor Winstons feestje” (G, A, V, L, I, M, F, W, P)
Polaire zijketens: “Santa’s Team Crafts New Quilts Yearly” (S, T, C, N, Q, Y)
Elektrisch geladen zijketens: “Dragons Eat Knights Riding Horses” (D, E, K, R, H)
Hoewel deze hulpmiddelen misschien goed bij je passen, zal het memoriseren van de aminozuren toch werk vergen. Ik raad je aan een paar vellen papier te pakken en deze vier stappen te doorlopen:
Voreerst schrijf je de lettervolgorde van elk acroniem op in afzonderlijke gebieden van de pagina, waarbij je ruimte overlaat om elk aminozuur te tekenen. Zeg het acroniem hardop tegen jezelf terwijl je bezig bent. (In het begin zul je ook de volledige naam en de drieletterige afkorting van elk aminozuur willen opschrijven. Later, als je de namen van alle 20 moleculen kent, kun je waarschijnlijk volstaan met het opschrijven van de drieletterige code.)
Teken vervolgens boven elke letter de basisstructuur van het aminozuur (de alfacarbonaat, de aminogroep en de carboxylzuurgroep). Je kunt deze structuur weergeven als een Fischer projectie (zoals in de afbeelding hierboven) of als een stereochemische figuur. Bedenk dat de amino- en carboxylgroepen bij pH 7 geïoniseerd zijn, evenals de elektrisch geladen zijketens.
Teken in de derde plaats aan elke basisstructuur de bijbehorende zijketen. Denk hardop terwijl u elke zijketen tekent-het zal u helpen om beter te onthouden. Let op de volgorde van het acroniem en de veranderingen in de structuur als u van de ene zijketen naar de volgende gaat.
Tot slot, spoelen en herhalen. Doe deze oefening één keer per dag gedurende een week, dan om de dag gedurende een week, en tenslotte één of twee keer per week. Probeer later de zijketens in omgekeerde of willekeurige volgorde te tekenen voor een extra uitdaging.
Oké, nu we een plan hebben, laten we de acroniemen eens nader bekijken:
Non-polaire zijketens:
“Oma gaat altijd naar Londen in mei voor Winston’s feestje”
- Glycine, Gly, G
- Alanine, Ala, A
- Valine, Val, V
- Leucine, Leu, L
- Isoleucine, Ile, I
- Methionine, Met, M
- Phenylalanine, Phe, F
- Tryptofaan, Trp, W
- Proline, Pro, P
Om te onthouden dat dit het acroniem is voor apolaire zijketens, herinner je je dat Londen, Engeland, niet in de buurt van de polen van de aarde ligt. Ook kan het helpen om Londen te associëren met Winston Churchill (de premier van het Verenigd Koninkrijk tijdens de Tweede Wereldoorlog) en, bij uitbreiding, met 8 mei (Dag van de Overwinning in Europa, waarop de formele overgave van nazi-Duitsland aan de geallieerden wordt gevierd).
De onruststokers in de apolaire groep zijn fenylalanine (F) en tryptofaan (W). Natuurlijk, de één-letter afkorting van fenylalanine is relatief gemakkelijk te onthouden, omdat de eerste twee letters, “ph”, worden uitgesproken alsof het een “F” is. Een truc om de afkorting van tryptofaan te onthouden is om je een letter W voor te stellen die gevormd wordt door verschillende bindingen in de vijf- en zeshoekige ringen van de zijketen.
Polaire zijketens:
“Santa’s Team Crafts New Quilts Yearly”
- Serine, Ser, S
- Threonine, Thr, T
- Cysteine, Cys, C
- Asparagine, Asn, N
- Glutamine, Gln, Q
- Tyrosine, Tyr, Y
Om te onthouden dat dit het acroniem is voor polaire zijketens, hoef je alleen maar aan een vijfjarige te vragen waar de Kerstman en zijn elfenteam wonen – op de Noordpool natuurlijk! (Mijn moeder houdt erg van quilten en naaien, dus het is nuttig voor mij om quilts te associëren met kerstcadeaus.)
De onruststokers in de polaire groep zijn asparagine (N), glutamine (Q), en tyrosine (Y). Een manier om met de eerste twee om te gaan is door verder te gaan met de truc voor het onthouden van aspartaat en glutamaat (zie het einde van dit bericht voor een noot over asparagine en glutamine). Ondertussen herinner ik me dat tyrosine de afkorting Y heeft omdat die letter de tweede is in de volledige naam, en omdat als de zijketen naar beneden is getekend, twee van de bindingen in de fenylring en de binding met de hydroxylgroep een denkbeeldige Y kunnen vormen.
Cysteïne is ook een beetje lastig, maar alleen omdat de andere officiële manier om de naam te spellen, “cystine” verwijst naar de geoxideerde vorm van aminozuren.
Elektrisch geladen zijketens:
“Dragons Eat Knights Riding Horses”
- Aspartate, Asp, D
- Glutamate, Glu, E
- Lysine, Lys, K
- Arginine, Arg, R
- Histidine, His, H
Door eliminatie weet je dat dit acroniem verwijst naar de overgebleven groep aminozuren. Net als die vervelende draken, is bijna elke molecule hier een onruststoker: aspartaat (D), glutamaat (E), lysine (K), en arginine (R).
Er zijn twee eet-thema trucs die ik gebruik om aspartaat (D) en glutamaat (E) te onthouden. Ten eerste, ik associeer het achtervoegsel “-ate” met het idee van draken die eten. Ten tweede, als ik naar de afkortingen van de twee aminozuren kijk, “Asp” en “Glu”, denk ik aan de uitdrukking “Aspiring Gluttons”. Ondertussen, voor lysine (K), herinner ik me gewoon dat L volgt op K in het alfabet. En de eenletterige afkorting van arginine zou betrekkelijk gemakkelijk te onthouden moeten zijn, omdat de eerste twee letters, “ar”, worden uitgesproken als de naam van de letter R.
Note over asparagine en glutamine:
Asparagine (N) en glutamine (Q) zijn identiek aan aspartaat (D) en glutamaat (E), behalve dat de eerste twee een aminogroep hebben, terwijl de laatste twee een negatief geladen zuurstof hebben. Het is nuttig dat de drieletterige afkortingen voor asparagine (N) en glutamine (Q) respectievelijk Asn en Gln zijn – het feit dat beide de letter “n” bevatten herinnert aan het stikstofatoom dat in hun aminozijketens voorkomt.