Marlon Green werd geboren in El Dorado, Arkansas. Zijn vader, Mickinley Green, werd in 1900 geboren en trouwde met Green’s toekomstige moeder, Lucy, op 10 april 1921. Green’s broer Rudolph Valentino Green werd in 1928 geboren, gevolgd door Marlon (6 juni 1929); Jean Evelyn (1933); James Zell (1936); en Allen David (1941).
In 1936 of 1937 verhuisde het gezin naar Lansing, Michigan, waar hij werk vond bij de Drop Forge Company. Later trad hij toe tot de huishoudelijke staf van tandarts J. Shelton Rushing als wat zijn zoon de major domo noemde.
Marlon Green trad in dienst bij de Amerikaanse luchtmacht, waar zijn laatste stationering het vliegen van de SA-16 Albatross was bij het 36e Air Rescue Squadron op de Johnson Air Base in Tokio, Japan. Tijdens zijn verlof in 1957 solliciteerde hij naar een functie als piloot bij Continental Airlines en werd uitgenodigd voor een gesprek nadat hij de raciale-identiteitsvraag op de sollicitatie had opengelaten. Hij plakte ook geen foto van zichzelf in het kleine vierkante blokje rechtsboven op de eerste pagina van de sollicitatie, terwijl vijf andere blanke sollicitanten, die minder gekwalificeerd waren, wel werden aangenomen. Volgens verschillende bronnen werd hij toen afgewezen, of werd hij aangenomen als wat de eerste Afro-Amerikaanse piloot voor een grote commerciële luchtvaartmaatschappij zou zijn geweest, maar werd afgewezen nadat hij zich had gemeld voor oriëntatie. Op 22 april 1963, na mondelinge argumenten op 28 maart 1963, oordeelde het Hooggerechtshof van de Verenigde Staten in “Colorado Anti-Discrimination Commission v. Continental Airlines, Inc. 372 U.S. 714 no. 146” dat Green onwettig was gediscrimineerd. In 1964 nam American Airlines David Harris in dienst als eerste Afro-Amerikaanse piloot voor een grote Amerikaanse passagiersluchtvaartmaatschappij. Na zijn overwinning bij het Hooggerechtshof vloog Green van 1965 tot 1978 voor Continental, aanvankelijk als piloot van Vickers Viscounts vanuit Denver. Hij werd gezagvoerder in 1966.
Green overleed op 80-jarige leeftijd in Denver, Colorado. Hij was gescheiden en wordt overleefd door zijn drie dochters en drie zonen. Op 16 februari 2010, op George Bush Intercontinental Airport in Houston, Texas, vernoemde Continental Airlines een Boeing 737-824 (N77518, cn 31605)> naar hem.
Tijdens zijn leven werd Green opgenomen in de Arkansas Aviation Hall of Fame.