Mykoplazmy są najmniejszymi wolno żyjącymi mikroorganizmami, mającymi około 300 nm średnicy. Są one ograniczone trójwarstwową błoną i w przeciwieństwie do konwencjonalnych bakterii nie mają sztywnej ściany komórkowej. Dlatego też nie są wrażliwe na penicyliny i inne antybiotyki działające na tę strukturę. Są natomiast wrażliwe na szereg innych antybiotyków o szerokim spektrum działania, z których większość jedynie hamuje ich namnażanie, a nie zabija. Tetracykliny zawsze były w czołówce antybiotyków, szczególnie w infekcjach dróg rodnych, ale makrolidy są również szeroko stosowane w infekcjach dróg oddechowych. Rzeczywiście, w porównaniu z tetracyklinami, erytromycyna, nowsze makrolidy, ketolidy i nowsze chinolony mają taką samą lub czasami większą aktywność. Dwie ostatnie grupy antybiotyków wykazują również pewną aktywność kobójczą. Przedstawiono profile wrażliwości na antybiotyki kilku mykoplazm pochodzenia ludzkiego, przy czym profile wrażliwości Mycoplasma pneumoniae i Mycoplasma genitalium są podobne. Poza penicylinami, mykoplazmy są wrodzenie oporne na niektóre inne antybiotyki, na przykład na rifampicyny. Ponadto, niektóre z nich mogą rozwinąć oporność, albo przez mutację genu, albo przez nabycie genu oporności, na antybiotyki, na które zwykle są wrażliwe. Oporność mykoplazm na tetracykliny jest powszechna i wynika z nabycia genu tetM. Na wzór wrażliwości na antybiotyki może mieć duży wpływ źródło pochodzenia mykoplazmy; na przykład, jedna odzyskana ze skażonej eukariotycznej hodowli komórkowej, która została poddana intensywnemu leczeniu antybiotykami, może mieć profil antybiotykowy całkiem inny niż ten sam gatunek mykoplazmy, który został odzyskany bezpośrednio ze źródła ludzkiego lub zwierzęcego. Mykoplazmy mogą być trudne do zwalczenia z żywicieli ludzkich lub zwierzęcych lub z hodowli komórkowych poprzez leczenie antybiotykami z powodu oporności na antybiotyk, lub z powodu braku działania zabójczego, lub z powodu inwazji niektórych mykoplazm na komórki eukariotyczne. Eradykacja może być szczególnie trudna u osób w immunosupresji lub z niedoborem odporności, szczególnie u tych, u których występuje hipogammaglobulinemia. Przedstawiono schematy, które najprawdopodobniej będą skuteczne w leczeniu zakażeń mykoplazmami układu oddechowego lub moczowo-płciowego.