De acordo com The Lost Evidence, a mulher central de frente para o oceano era provavelmente Earhart, e um dos homens à esquerda, provavelmente Noonan. As identidades reais dos sujeitos desta foto são desconhecidas.
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A “evidência perdida” em questão era uma fotografia encontrada no Arquivo Nacional no Parque Universitário do Atol de Jaluit no Mandato dos Mares do Sul, o mandato japonês para as Ilhas Marshall. A fotografia inclui duas pessoas de aspecto europeu. O documentário, através de um analista forense especializado em reconhecimento facial, afirmou que era “muito provável” que fosse uma foto de um Earhart e Noonan capturados. O Lost Evidence também diz que uma barcaça no fundo pode possivelmente conter um avião, e esse avião pode ter sido o Electra. A fotografia foi do Escritório de Inteligência Naval (ONI) e preparada para a invasão das Ilhas Marshall durante a Segunda Guerra Mundial, em 1944. O documentário sugeria que um navio visto ao fundo com uma bandeira japonesa poderia ser o Kōshū Maru, um navio naval militar japonês, que teria estado envolvido no transporte dos prisioneiros. Ele sugere que talvez o Kōshū Maru os tenha transportado para Saipan, onde eles morreram sob custódia. O documentário também citou evidências existentes para a hipótese de captura japonesa, como os locais que afirmaram ter testemunhado um acidente de avião no Mili Atoll. Também sugeriu que o governo americano poderia ter sabido da captura e cobriu esse conhecimento.
Dois dias após a publicação de The Lost Evidence, o historiador e blogueiro japonês Kota Yamano investigou a questão, e publicou uma entrada no blog que mostrava a fonte original da fotografia que a ONI tinha usado: um livro de viagem The Lifeline of the Sea: My South Sea Memoir (海の生命線 我が南洋の姿, Umi no seimeisen : Waga nannyou no sugata), que foi publicado pela primeira vez em 1935. O último vôo de Earhart e Noonan foi em 1937, portanto uma foto de 1935 não estaria relacionada com o desaparecimento de Earhart e Noonan. Em entrevista ao The Guardian, Yamano criticou o trabalho por trás do documentário, dizendo: “Acho estranho que os documentaristas não tenham confirmado a data da fotografia ou a publicação em que ela apareceu originalmente. Essa é a primeira coisa que eles deveriam ter feito”. Yamano também disse que foram necessários apenas trinta minutos de busca para encontrar a fonte. No Twitter, Yamano (como @baron_yamaneko) identificou o navio à direita da foto como um navio diferente chamado Kōshū apreendido pelas forças aliadas japonesas na Primeira Guerra Mundial do Império Alemão e não a Kōshū Maru da marinha japonesa.
Skepticism tinha existido mesmo antes do post do blog de Yamano. Os Arquivos Nacionais escreveram avisando que a versão da fotografia dos Arquivos não tinha data. Dorothy Cochrane, curadora do departamento de aeronáutica do Museu Nacional do Ar e Espaço, chamou a nova evidência de mera “fotografia desfocada” e citou as evidências existentes de transmissões de rádio que sugeriam que a Electra estava pelo menos perto da Ilha Howland, a 800 milhas de distância das Ilhas Marshall. A autora Fukiko Aoki, que pesquisou e escreveu um livro de 1982, Looking for Amelia, foi igualmente crítica antes das revelações de Yamano. Aoki localizou um oficial idoso, parte da tripulação de 1937 da Kōshū Maru, que negou o envolvimento do navio. Aoki posteriormente pesquisou o diário de bordo do navio Kōshū Maru, que mostrou que ele estava a 1.500 milhas de distância na época do desaparecimento de Earhart. Também foi argumentado que para chegar e de alguma forma pousar no remoto atol onde ela supostamente se despenhou teria exigido que Earhart, embora com pouco combustível, mudasse seu curso para nordeste ao se aproximar da ilha Howland e voasse centenas de milhas para noroeste. Além disso, se os oficiais japoneses tivessem encontrado Earhart, eles teriam tido uma motivação substancial para resgatá-la e devolvê-la, considerando a sua fama. As alegações de um encobrimento do governo americano também foram criticadas; o documentário menciona de forma proeminente “um relatório datado de 7 de janeiro de 1939 que Earhart era um prisioneiro nas Ilhas Marshall”. TIGHAR, um grupo que defende a hipótese do desaparecimento da Ilha Gardner, investigou o relatório do governo de 1939, que não foi difícil de encontrar, e descobriu que era um relatório sobre uma partida óbvia – uma história implausível encontrada na França de alguém que não se identificou. A mensagem dizia ter sido raptada pelos japoneses, ter a sua tripulação morta, encontrar Earhart sob custódia e depois ser enviada para a Europa num navio japonês sem nome. TIGHAR escreveu que a foto não era “nem perdida nem prova” e que a foto tinha sido “exatamente onde deveria estar, e era exatamente o que foi rotulado como sendo, uma foto de Jaluit Harbor”, criticando o elemento “foto perdida e mal arquivada” de The Lost Evidence também.
Em resposta, The History Channel cancelou rebroadcasts do programa, anunciou que não estaria disponível em plataformas de streaming ou on-demand, e parou as transmissões programadas do programa no Canadá e no Reino Unido. Ele escreveu em um comunicado de imprensa que “HISTÓRIA tem uma equipe de investigadores explorando os últimos desenvolvimentos sobre Amelia Earhart, e nós seremos transparentes em nossas descobertas … Em última análise, a precisão histórica é mais importante para nós e para os nossos telespectadores”
A partir de Dezembro de 2017, ainda não houve resposta do History Channel, pelo qual o céptico Ben Radford criticou a rede e o seu profissionalismo.:3:20