Joissakin paikallisissa eläinkaupoissa on myös lemmikkieläinten rokotusklinikoita. Hinnat ovat yleensä halvempia kuin täyden palvelun eläinlääkäriklinikoiden hinnat. Huonona puolena on se, että ihmiset joutuvat usein jonottamaan, joskus jopa kaupan ulkopuolella, ja lähellä on usein muita lemmikkejä, mikä voi olla stressaavaa lemmikillesi. Kaikkien koirien on oltava vuokralla ja kaikkien kissojen kantorepuissa. Lisäksi asiakas on vastuussa näiden eläinlääkärikäyntien papereidensa tallentamisesta sen sijaan, että hän voisi soittaa eläinlääkärin toimistoon ja pyytää kopioita myöhemmin. Lisäksi näillä klinikoilla annetaan ainoastaan rokotuksia, eikä lemmikkisi saa näillä klinikoilla perusteellista tutkimusta.
Petco-kaupoissa on Vetco-klinikoita. Walgreens tekee yhteistyötä ShotVet.com-nimisen yrityksen kanssa. Lopuksi on vielä VIP-Petcare klinikat. Ne näyttävät useimmiten tekevän yhteistyötä paikallisten Pet Supplies Plus -myymälöiden kanssa. Ota yhteyttä paikallisiin myymälöihin tarkistaaksesi rokotusklinikoiden päivämäärät ja kellonajat alueellasi.
Aika ajoin paikalliset eläinsuojat pitävät myös raivotauti- ja mikrosiruklinikoita. Tarkista paikallisista eläinsuojista, onko niillä suunniteltuja päivämääriä klinikoille.
Muista, että jos rokotat lemmikkisi kaupungin klinikalla tai vähittäiskaupan klinikalla, SÄILYTÄ PAPERIT. Toisin kuin täyden palvelun eläinsairaala, nämä klinikat EIVÄT lähetä sinulle seuraavana vuonna muistutusta lemmikin rokotusten päivittämisestä. Laita muistutus puhelimeesi tai kalenteriisi, jotta lemmikkisi rokotetaan ajoissa seuraavana vuonna, mikä on erityisen tärkeää raivotautirokotusten osalta. On erittäin tärkeää, että kaikista raivotautirokotuksista on kirjalliset asiakirjat. Metalliset raivotautimerkit EIVÄT ole todiste rokotushistoriasta, joten tallenna paperisi.