Marlon Green syntyi El Doradossa, Arkansasissa. Hänen isänsä Mickinley Green oli syntynyt vuonna 1900 ja avioitui Greenin tulevan äidin Lucyn kanssa 10. huhtikuuta 1921. Greenin veli Rudolph Valentino Green syntyi vuonna 1928, jonka jälkeen seurasivat Marlon (6. kesäkuuta 1929), Jean Evelyn (1933), James Zell (1936) ja Allen David (1941).
Vuonna 1936 tai 1937 perhe muutti Lansingiin, Michiganiin, jossa hän löysi töitä Drop Forge Companyltä. Myöhemmin hän liittyi hammaslääkäri J. Shelton Rushingin kotitaloushenkilökuntaan, jota hänen poikansa kutsui major domoksi.
Marlon Green liittyi Yhdysvaltain ilmavoimiin, jossa hänen viimeinen komennuksensa oli lentää SA-16 Albatrossia 36. lentopelastuslaivueessa Johnsonin lentotukikohdassa Tokiossa, Japanissa. Virkavapaalla ollessaan vuonna 1957 hän haki Continental Airlinesin lentäjän paikkaa, ja hänet kutsuttiin haastatteluun, kun hän oli jättänyt hakemuksessa rotuidentiteettikysymyksen tyhjäksi. Hän jätti myös liittämättä hakemuksen ensimmäisen sivun oikeaan yläkulmaan varattuun pieneen neliönmuotoiseen lohkoon kuvan itsestään, Viisi muuta vähemmän pätevää valkoihoista hakijaa otettiin palvelukseen. Eri lähteiden mukaan hänet joko hylättiin silloin tai hänet palkattiin maan ensimmäiseksi afroamerikkalaiseksi lentäjäksi suureen kaupalliseen lentoyhtiöön, mutta hänet hylättiin, kun hän oli ilmoittautunut perehdytykseen. Huhtikuun 22. päivänä 1963 Yhdysvaltain korkein oikeus päätti 28. maaliskuuta 1963 pidetyn suullisen käsittelyn jälkeen asiassa Colorado Anti-Discrimination Commission v. Continental Airlines, Inc. 372 U.S. 714 no. 146″, että Greeniä oli lainvastaisesti syrjitty. Vuonna 1964 American Airlines palkkasi David Harrisin ensimmäiseksi afroamerikkalaiseksi lentäjäksi suureen yhdysvaltalaiseen matkustajalentoyhtiöön. Korkeimmassa oikeudessa saamansa voiton jälkeen Green lensi Continentalin palveluksessa vuosina 1965-1978, aluksi Vickers Viscounteja Denveristä käsin. Hänestä tuli kapteeni vuonna 1966.
Green kuoli 80-vuotiaana Denverissä, Coloradossa. Hän oli eronnut, ja häneltä jäi henkiin kolme tytärtä ja kolme poikaa. Continental Airlines nimesi 16. helmikuuta 2010 George Bush Intercontinental -lentokentällä Houstonissa, Teksasissa Boeing 737-824 -lentokoneen (N77518, cn 31605)> hänen mukaansa.
Hänen elinaikanaan Green otettiin Arkansasin ilmailun kunniagalleriaan.