Marlon Green est né à El Dorado, Arkansas. Son père, Mickinley Green, est né en 1900, et a épousé la future mère de Green, Lucy, le 10 avril 1921. Le frère de Green, Rudolph Valentino Green, est né en 1928, suivi de Marlon (6 juin 1929) ; Jean Evelyn (1933) ; James Zell (1936) ; et Allen David (1941).
En 1936 ou 1937, la famille déménage à Lansing, dans le Michigan, où il trouve un emploi à la Drop Forge Company. Il rejoint ensuite le personnel de maison du dentiste J. Shelton Rushing en tant que ce que son fils appelle le major domo.
Marlon Green s’engage dans l’armée de l’air américaine, où sa dernière affectation est de piloter le SA-16 Albatross au sein du 36e escadron de sauvetage aérien de la base aérienne de Johnson à Tokyo, au Japon. Pendant son congé en 1957, il a postulé pour un poste de pilote chez Continental Airlines, et a été invité à passer un entretien après avoir laissé en blanc la question sur l’identité raciale dans le formulaire de candidature. Il a également omis de coller dans le petit bloc carré prévu dans le coin supérieur droit de la première page de la candidature, une photo de lui-même, Cinq autres candidats blancs, moins qualifiés, ont été engagés. Selon diverses sources, soit il a été rejeté à ce moment-là, soit il a été embauché comme ce qui aurait été le premier pilote afro-américain du pays pour une grande compagnie aérienne commerciale, mais il a été rejeté après s’être présenté à l’orientation. Le 22 avril 1963, après les plaidoiries du 28 mars 1963, la Cour suprême des États-Unis statue dans l’affaire « Colorado Anti-Discrimination Commission v. Continental Airlines, Inc. 372 U.S. 714 no. 146 » que Green avait fait l’objet d’une discrimination illégale. En 1964, American Airlines engage David Harris comme premier pilote afro-américain pour une grande compagnie aérienne américaine de transport de passagers. Après sa victoire devant la Cour suprême, Green a volé pour Continental de 1965 à 1978, pilotant initialement des Vickers Viscount au départ de Denver. Il est devenu capitaine en 1966.
Green est décédé à l’âge de 80 ans à Denver, dans le Colorado. Il était divorcé et laisse derrière lui ses trois filles et ses trois fils. Le 16 février 2010, à l’aéroport intercontinental George Bush de Houston (Texas), Continental Airlines a donné son nom à un Boeing 737-824 (N77518, cn 31605)>.
De son vivant, Green a été intronisé au temple de la renommée de l’aviation de l’Arkansas.