I henhold til The Lost Evidence var den midterste kvinde, der vender ud mod havet, sandsynligvis Earhart, og en af mændene til venstre var sandsynligvis Noonan. De faktiske identiteter af personerne på dette billede er ukendte.
Det pågældende “tabte bevismateriale” var et fotografi fundet i nationalarkivet i College Park af Jaluit Atoll i Sydhavs-mandatet, det japanske mandat for Marshalløerne. På fotografiet ses to europæisk udseende personer. I dokumentaren blev det gennem en retsmedicinsk analytiker, der havde specialiseret sig i ansigtsgenkendelse, påstået, at det var “meget sandsynligt”, at det var et billede af en tilfangetaget Earhart og Noonan. The Lost Evidence siger også, at en pram i baggrunden muligvis kunne indeholde et fly, og at dette fly muligvis kunne have været Electra. Fotografiet var fra Office of Naval Intelligence (ONI) og blev forberedt til invasionen af Marshalløerne i 1944 under Anden Verdenskrig. Dokumentaren antydede, at et skib, der ses i baggrunden med et japansk flag, kunne være Kōshū Maru, et japansk militærflådefartøj, som skulle have været involveret i transporten af fangerne. Det antydes, at Kōshū Maru måske transporterede dem til Saipan, hvor de døde i fangenskab. Dokumentaren citerede også eksisterende beviser for den japanske tilfangetagelseshypotese, f.eks. lokale beboere, der hævdede at have været vidne til et flystyrt på Mili Atoll. Den antydede også, at den amerikanske regering kunne have kendt til tilfangetagelsen og dækket denne viden til.
To dage efter offentliggørelsen af The Lost Evidence undersøgte den japanske historiker og blogger Kota Yamano sagen og offentliggjorde et blogindlæg, der viste den oprindelige kilde til det fotografi, som ONI havde brugt: en rejsebog The Lifeline of the Sea: My South Sea Memoir (海の生命線 我が南洋の姿, Umi no seimeisen : Waga nannyou no sugata), som blev udgivet første gang i 1935. Earhart og Noonans sidste flyvning fandt sted i 1937, så et foto fra 1935 ville ikke have noget at gøre med Earhart og Noonans forsvinden. I et interview med The Guardian kritiserede Yamano arbejdet bag dokumentaren og sagde: “Jeg finder det mærkeligt, at dokumentaristerne ikke har bekræftet datoen for fotografiet eller den publikation, hvori det oprindeligt blev offentliggjort. Det er det første, de burde have gjort.” Yamano sagde også, at det kun tog tredive minutters søgen at finde kilden. På Twitter identificerede Yamano (som @baron_yamaneko) skibet til højre i billedet som et andet skib ved navn Kōshū, der blev beslaglagt af de allierede japanske styrker under Første Verdenskrig fra det tyske kejserrige, og ikke den japanske flådes Kōshū Maru.
Skepsis havde eksisteret allerede før Yamanos blogindlæg. National Archives skrev i en advarsel, at arkivets version af fotografiet ikke havde en dato. Dorothy Cochrane, kurator ved luftfartsafdelingen på National Air and Space Museum, kaldte de nye beviser blot et “sløret fotografi” og henviste til de eksisterende beviser fra radiotransmissioner, der tydede på, at Electra i det mindste var tæt på Howland Island, 800 miles fra Marshalløerne. Forfatteren Fukiko Aoki, der har forsket i og skrevet en bog fra 1982, Looking for Amelia, var ligeledes kritisk før afsløringerne fra Yamano. Aoki fandt en ældre officer, som var en del af besætningen på Kōshū Maru fra 1937, og som benægtede skibets involvering. Aoki undersøgte efterfølgende Kōshū Maru’s skibslogbog, som viste, at det var 1.500 miles væk på tidspunktet for Earharts forsvinden. Det blev også hævdet, at for at nå og på en eller anden måde lande på den fjerntliggende atol, hvor hun angiveligt styrtede ned, ville det have krævet, at Earhart, selv om hun havde lavt brændstofforbrug, skulle ændre sin nordøstlige kurs, da hun nærmede sig Howland Island, og flyve hundredvis af kilometer mod nordvest. Hvis de japanske myndigheder havde fundet Earhart, ville de desuden have haft en betydelig motivation til at redde og returnere hende i betragtning af hendes berømmelse. Påstandene om, at den amerikanske regering havde mørklagt sagen, blev også kritiseret; dokumentaren nævner tydeligt “en rapport af 7. januar 1939 om, at Earhart var fange på Marshalløerne”. TIGHAR, en gruppe, der går ind for Gardner Island-hypotesen om forsvindingen, undersøgte regeringsrapporten fra 1939, som ikke var svær at finde, og fandt ud af, at det var en rapport om en åbenlys spøg – en usandsynlig fortælling fundet i Frankrig fra en person, der ikke identificerede sig selv. Meddelelsen fortalte, at han var blevet kidnappet af japanerne, at hans besætning var blevet dræbt, at han havde fundet Earhart i fangenskab og derefter var blevet sendt til Europa på et unavngivet japansk skib. TIGHAR skrev, at billedet var “hverken tabt eller bevismateriale”, og at billedet havde været “præcis, hvor det skulle være, og var præcis, hvad det var mærket til at være, et billede af Jaluit Harbor”, og kritiserede også elementet “tabt og forkert arkiveret foto” i The Lost Evidence.
Som reaktion herpå aflyste The History Channel genudsendelser af showet, meddelte, at det ikke ville være tilgængeligt på streaming eller on-demand-platforme, og stoppede planlagte udsendelser af showet i Canada og Det Forenede Kongerige. Den skrev i en pressemeddelelse, at “HISTORY har et hold af efterforskere, der udforsker den seneste udvikling omkring Amelia Earhart, og vi vil være gennemsigtige i vores resultater …. I sidste ende er historisk nøjagtighed det vigtigste for os og vores seere.”
I december 2017 er der endnu ikke kommet noget svar fra History Channel, hvilket skeptikeren Ben Radford kritiserede netværket og dets professionalisme for. 3:20